Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07541
- Subject:
- NR_102757.1
- Aligned Length:
- 2275
- Identities:
- 1463
- Gaps:
- 607
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------ATGCCGACTGTCAGCGTGA 19
|||||||||||||||||.|
Sbjct 1 CTCTAGGGTCGCTGAGGCCCCGCATGTGGCGCAGGCGCAGTGTCCACGACTCGCCATGCCGACTGTCAGCGTAA 74
Query 20 AGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGATGAACTATGTTTTGAATTT 93
||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 75 AGCGAGACCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGGACCTACACTGATGAAGAGTTTGACGAACTGTGTTTTGAATTT 148
Query 94 GGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAGGTAATGTAAAGGCAGCAGG 167
||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 GGTCTGGAACTTGATGAAATT----------------------------------------------------- 169
Query 168 AGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTCCTGTGTCTGGAAGGATTGG 241
|||.||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 170 ---------------------------------------------ATACGACCTCCTGTGTCTGGAAGGACTGG 198
Query 242 TTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGGTAATGCCTGATGGAAAAATC 315
.|||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||..|.|||.|.|||
Sbjct 199 CTCGGGGCCTCCAGGTCTTCAAAGAAAGGATCAAAGCTCCGGTATATAAGCGAGTGATGCCCAAGGGAGACATC 272
Query 316 CAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAGCAGTTCTCCGTAATATAAA 389
||.||..||.|||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 273 CAAAAGCTGGTTATCACAGAAGAGACAGCCAAAGTGCGCCCTTTTGCTGTAGCAGCAGTTCTCCGGAATATCAA 346
Query 390 GTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAGAATATTTGCAGGAAAAGAG 463
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 347 GTTCACTAAAGACCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAACTACACCAGAATATCTGCAGGAAAAGAG 420
Query 464 CACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTATACTGCAAAGCGTCCTTCA 537
|..|||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 421 CGTTGGTTGCTATTGGAACTCACGACTTGGACACTTTATCAGGCCCATTTACTTACACCGCGAAACGTCCTTCA 494
Query 538 GATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGATGAACATATACAAGACTGA 611
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 495 GATATCAAATTCAAGCCTCTGAATAAGACCAAGGAGTATACAGCTTGTGAATTAATGAACATATACAAGACTGA 568
Query 612 CAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTTATCTATGATAGCAATGGTG 685
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 569 CAACCACCTTAAACATTATTTACATATCATTGAAAGTAAGCCCCTGTATCCAGTTATCTATGACAGCAATGGTG 642
Query 686 TCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAATACTAGAAATATTTTTATT 759
|.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 643 TGGTCCTGTCGATGCCTCCGATTATAAATGGGAATCATTCAAAAATAACAGTAAATACTAGGAATATATTTATT 716
Query 760 GAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCACCATGTTCAGTGAATATTG 833
||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 717 GAATGCACAGGGACTGACTTCACTAAAGCAAAAATCGTGCTTGACATTATTGTCACCATGTTCAGTGAACACTG 790
Query 834 TGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCACATACCTTTCCAGAATTAG 907
|||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||.||||.||||||||||||||||..||||||||||||..|..
Sbjct 791 TGAAAATCAGTTTACAGTTGAAGCAGTTGAAGTAGTTTCTCCTAATGGAAAATCAAGTACCTTTCCAGAGCTGC 864
Query 908 CTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCAGAAAATCTT 981
|||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||.
Sbjct 865 CTTACAGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGATTTAATTAACAAGAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCTGCAAATCTC 938
Query 982 GCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATCAGATTGAGATTGAAATCCC 1055
|||||.||.|||||||||||||.|.|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 939 GCCAAGCTCCTGACCAGGATGTGTCTGAAGTCAGAAGTCATAGGTGACGGCAATCAGATTGAGGTTGAAATTCC 1012
Query 1056 TCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATTGCTTATGGATATAACAACA 1129
|||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1013 TCCGACCAGAGCAGATGTCATCCATGCATGTGACATTGTGGAGGACGCAGCTATTGCTTATGGCTATAACAACA 1086
Query 1130 TTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAAGCTCACTGAACTTCTCCGA 1203
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.||
Sbjct 1087 TTCAGATGACTCTGCCGAAAACGTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTCAACAAGCTCACCGAGCTCCTCAGA 1160
Query 1204 CATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGATAA 1277
|.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1161 CTTGACATGGCTGCGGCTGGCTTCACCGAAGCACTGACTTTTGCTCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGACAA 1234
Query 1278 ACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACAGCTGAATTTCAGGTGGCAC 1351
.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 1235 GCTTGGCCTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTGCACATAAGTAATCCTAAAACCGCTGAGTTCCAGGTGGCGC 1308
Query 1352 GCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCCCCTTCCACTGAAACTGTTT 1425
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1309 GCACTACCCTTCTTCCTGGCCTTCTAAAGACCATTGCAGCAAACCGGAAGATGCCCCTTCCTCTCAAACTGTTT 1382
Query 1426 GAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACTACAGACATCTCTGTGCTGT 1499
||||||||||||.|||||.|||||||||||...|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1383 GAAATCTCTGACGTTGTAGTAAAAGATTCTGGCAAAGATGTAGGTGCGAAAAACTACAGGCATCTCTGTGCTGT 1456
Query 1500 TTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATTATGCAGTTGCTCGATGTGC 1573
||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1457 TTATTACAACAAGACTCCCGGGTTTGAGATCATCCATGGCTTGCTGGACAGAATTATGCAGCTGCTCGATGTGC 1530
Query 1574 CTCCTGGTGAAGACAAG-GGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTTCTTCCCCGGGCGATGTGC 1646
||||||||||.|| ||| |||||.||..||||||||||.||.|.|||..||||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1531 CTCCTGGTGAGGA-AAGCGGGGGCTACATGATCAAAGCGTCTGCAGGTTCTGCCTTTTTCCCTGGACGGTGTGC 1603
Query 1647 AGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACGTTATCACCAAATTTGAGC 1720
.|||||.||||...|.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1604 TGAGATCTTTGTTGGAGGTCAAAGCATTGGGAAGCTAGGCGTCCTTCATCCTGATGTTATCACCAAATTTGAGC 1677
Query 1721 TGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG--------------------------- 1767
|||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1678 TGACCATGCCCTGTTCCTCTCTGGAAATCAATATTGAGCCCTTTTTGTGAGGTTGGTCTCTGAGTGTCCCTTTC 1751
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1752 TGCTCCTGTGGTGTCCTTCAGCCCTCTTTTACAGCACATATCCATTTGTGCGTTAATGTTTAATAAAGTGAAAT 1825
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1826 GTGCTATCTGACTCCTTGCGTAGCTGCATTAGGCCAGCGTGTGGAACAGCTGGTGTGTATCTGCATGTACCACA 1899
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1900 TTGGGGAGAGGTGCCCTAGACAGGCAGGGTGAGTTCTGGGAGCGGAAGTTTTGCTTGGCCTTCAGAGTATTGGT 1973
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1974 TACTTCTGACTCCTCCTGAATAGAAGGAAACAACTCATCAACTAGAACACATGTTGTACAGCCTTAAGCCTTTT 2047
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 2048 CTAAACCTGATAAGTATTAATCAATAAAACATTTTAGGAAAATGTTTTCAGAATCAGTATGACCAAGCAGTGAC 2121
Query 1768 ------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 2122 AACCTTTCAAGTCATCTTTTTTAAGTTGATTTATATGTGAATATATGTGTATCTG 2176
