Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07541
- Subject:
- XM_011510466.2
- Aligned Length:
- 1767
- Identities:
- 1468
- Gaps:
- 297
Alignment
Query 1 ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAACTATGTTTTGAATTTGGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTAATGTAAAGGCAGCAGGAGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGTGTCTGGAAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -ATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAG 73
Query 371 CAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAG 147
Query 445 AATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 AATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTA 221
Query 519 TACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGA 295
Query 593 TGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 TGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTT 369
Query 667 ATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAA 443
Query 741 TACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCA 517
Query 815 CCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCA 591
Query 889 CATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 CATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAG 665
Query 963 AGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATC 739
Query 1037 AGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATT 813
Query 1111 GCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAA 887
Query 1185 GCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCC 961
Query 1259 AAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACA 1035
Query 1333 GCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCC 1109
Query 1407 CCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACT 1183
Query 1481 ACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATT 1257
Query 1555 ATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTT 1331
Query 1629 CTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACG 1702
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATCTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACG 1405
Query 1703 TTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1406 TTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATGTTGGACCCTTTTTG 1470