Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07553
• Subject: XM_011514221.1
• Aligned Length: 1504
• Identities: 1146
• Gaps: 326

Alignment

Query    1  -----------------ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGA-CCAGCCTGGC-------------AGA--------  35
                             |||||.|||.|  .|||||||| ||||.||..|             |||        
Sbjct    1  ATGGCAGAAAGGCTGGAATGGCATCTCC--ACTCTGTGACCCAGTCTCCCACTTGCCCCCAAAAGAATATTTCT  72

Query   36  --TGA-AGT---CAACTG------CCCCATCTGTC------AGGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACT  91
              ||| |||   ||.|||      |.||| ||.||      ..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TCTGACAGTGGACAGCTGACATATCACCA-CTTTCCTTCTACTGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACT  145

Query   92  GCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGACCTGGAGGAGTCCCCT  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  GCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGACCTGGAGGAGTCCCCT  219

Query  166  ACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  ACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGA  293

Query  240  GAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAAGAGCACGGAGAGA  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  GAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAAGAGCACGGAGAGA  367

Query  314  AGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  AGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACC  441

Query  388  CACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAGTGTCTTAAATGTCTAAG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  CACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAGTGTCTTAAATGTCTAAG  515

Query  462  AAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGACTCAGGTGT  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  AAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGACTCAGGTGT  589

Query  536  CCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTC  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTC  663

Query  610  TTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGGA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  TTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGGA  737

Query  684  GATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACGG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACGG  811

Query  758  ACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTGTGTCGCCAGAGCTGGGC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTGTGTCGCCAGAGCTGGGC  885

Query  832  CAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGGAAAAACTATG  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGGAAAAACTATG  959

Query  906  CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCG  1033

Query  980  AGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAGCGTTTTGACCGGGCC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1034  AGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAACGTTTTGACCGGGCC  1107

Query 1054  ACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGTGGA---------TGGCC----A  1114
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||         |||||    .
Sbjct 1108  ACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGGTGAGTATAGACCTGGCCCATGG  1181

Query 1115  GGGTACCT--------------------------------------GGGGA-CTCAGGCTGCTGCCAG------  1143
            |||.|.||                                      ||||| ||..||||||.|||||      
Sbjct 1182  GGGCAGCTGCACCGTGGGCGTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCGGCTGCGGCCAGAGGAGG  1255

Query 1144  -----------------------------TTCTGCTCACCACCATCCGTGCT---------------TGGCACA  1173
                                         |||..|||..|    ||.|.|||               ||.|.|.
Sbjct 1256  GGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGC----TCTGGGCTCCTTCCCCACACGGCTGACCCT  1325

Query 1174  GAAGTAGCTGCA--------------------------------------------------------------  1185
            ||||.|||.||.                                                              
Sbjct 1326  GAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGGGTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGACCTTCACCAACGCTGTCA  1399

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1400  CCCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTCCCTTCTTTGGGCTCTGGGGCCGA  1473

Query 1186  ------------------------  1185
                                    
Sbjct 1474  GGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC  1497