Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07585
- Subject:
- XM_006712195.3
- Aligned Length:
- 1312
- Identities:
- 1044
- Gaps:
- 236
Alignment
Query 1 ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC 74
Query 75 TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA 148
Query 149 AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC 222
Query 223 GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT 296
Query 297 CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA 370
Query 371 ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA 444
Query 445 GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT 518
Query 519 GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA 592
Query 593 GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC 666
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC 666
Query 667 CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT 740
Query 741 GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA 814
Query 815 GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC 888
Query 889 AAGATGCTGTTTGTCCTGGT------CGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCAT 956
||||||||||...|||.||| || |.|| ||| |||..|||| |||
Sbjct 889 AAGATGCTGTACTTCCAGGTTCTAGACG----GCTT----TCT-------CCCAATCCA-----------TCA- 935
Query 957 GTGGAGCGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTC-------ATCTCC 1023
|||| |||...||| |.|||.|| ||| ||
Sbjct 936 -----------------------------GCCT--------CCTCTGAGC---TTCACTTCTTTTCTGATC-CC 968
Query 1024 GGCATC--TTCTTCTACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCC-GAGA 1094
..|||| |||.|||||| ||| ||| || ||||| .|||| |||
Sbjct 969 ACCATCAGTTCATCTACC-------------------------CTA----CTC-TG-CCAGC--GTTCCTGAG- 1008
Query 1095 GACCTTCCAGGAGGCCCTGTGCCTCGGGGCCTG--------CTGCCATCGCCTCAGAC-CCCGCCACAGCTCCC 1159
|||| || ||| ||| |.|.||||.|||..|
Sbjct 1009 -------------------------GGGG--TGAAAGAGTTCTG-----------GACACTCTCCACTGCTGAC 1044
Query 1160 ACAGCCTC-------AGCAGGAT-GACCACAGGCAGCACCCTGTGTGATGTGGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCC 1225
| || | ||.||| ||||| ||| ||||||||| .
Sbjct 1045 A-----TCTATTGGTA-CATGATGGACCA-----AGC--------------------------CAGCTGGGT-G 1080
Query 1226 ACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAG-AGGCGCAGCAAGAGACCGATCCATCC 1278
|||| ||||..||.||.| |...|.||||||
Sbjct 1081 ACCC----------AACGTGGGACCTGTATCTGGAGCAAG-------------- 1110