Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07592
- Subject:
- NM_001293694.1
- Aligned Length:
- 1255
- Identities:
- 1137
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGAGTGGGCATCGATCAACAAGGAAAAGATGTGGAGATTCTCACCCGGAGTCCCCAGTGGGCTTCGGGCATAT 74
||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGGGCATCGGTCAACAAGGAAACGATGTGGAGATTCTCACCCAGAGTCCCCTGTGGGCTTTGGGCATAT 74
Query 75 GAGTACTACAGGATGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCAACACCACCATTGTCAAGACACCAACTAAAGC 148
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||.|
Sbjct 75 GAGTACTACAGGGTGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCGACACCACCACTGTCAAGACACCAGTTAAAAC 148
Query 149 GGCTAGAAGAACACAGATATCAAAGTGCTGGACGGTCCCTGCTTGAGCCCTTAATGCAAGGGTATTGGGAATGG 222
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 149 GGCTAGAAGAACACAGGTATCAGAGTGCTGGACGGTCCCTTCTCGAGCCCTTAATGCAAGGATACTGGGAATGG 222
Query 223 CTCGTTAGAAGAGTTCCCTCCTGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTGTCAATAAACATCTGTAC 296
||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 223 CTAGTTGGAAGAGTACCCTCATGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTATCAATAAATATCTGTAC 296
Query 297 AACTATTTTATTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCATATATTGCTTGTGCCT 370
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 AACTATTTTGTTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCTTATATTGCCTGTGCTT 370
Query 371 GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTTTGGATGCTATTGATGGGAAACAGGCAAGAAGAACCAATAGTAGTTCTCCT 444
|||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTCTGGATGCCATAGATGGGAAACAGGCCAGAAGAACTAACAGTAGCTCTCCT 444
Query 445 CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGATTCACTATCAACAGTTTTTGTGGTTCTCGGAACTTGTATTGCAGT 518
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGACTCACTATCGACAGTTTTTGTGGTTCTTGGAACTTGTATTGCAGT 518
Query 519 GCAGCTGGGGACAAACCCTGATTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCGGGGACATTTATGTTCTATTGTGCGCACT 592
.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 519 ACAACTTGGGACAAATCCTGACTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCTGGGACATTCATGTTCTATTGTGCACACT 592
Query 593 GGCAAACGTATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATAATTGATGTGACTGAAGT-GCAAATCTTCATAATAAT 665
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.| ||| .||.|||.|.||.|||.|
Sbjct 593 GGCAAACATATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATATTCGATGTTACAG-AGTCCCAGATCCTAATTATATT 665
Query 666 CATGCATTTGCTGGCAGTGA---TTGGAGGACCACCT---TTTTGGCAATCTATGATTCCAGTGCTGAATATTC 733
..|.||..|.||..||| || .|||.| ||| ||.|||.|.|..|.||||||.|||.|||||||||
Sbjct 666 ATTCCAGCTTCTCTCAG-GAACCGTGGGG-----CCTTGGTTCTGGAACTTCACGATTCCTGTGTTGAATATTC 733
Query 734 AAATGAAAATTTTTCCTGCACTTTGTACTGTAGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATC 807
||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 AAATGAAACTTCTTCCTGCACTTTGTACTGTGGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATC 807
Query 808 TTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGATCAACAATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTCCATATTGG 881
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 808 TTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGGTCAACCATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTGCATATTGG 881
Query 882 ATCAGTGATTACATTAGCTGCAATGATCTACAAGAAATCTGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCCTGTCTTT 955
|||||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 882 ATCAGTGATCACGTTAGCTGTTATGATCTACAAGAAATCAGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCATGTCTTT 955
Query 956 ATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCTGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCACACATGACGAAAAGTGAA 1029
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 956 ATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCGGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCTCACATGACGAAAAGTGAA 1029
Query 1030 ATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCGGCACTTTTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTTATTGA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1030 ATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCAGCACTTCTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTCATTGA 1103
Query 1104 TGAATATATTGTACTTTGGATTGCCCTGGTTTTCTCTTTCTTTGATTTGATCCGCTACTGTGTCAGTGTTTGCA 1177
|||||||||.|||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TGAATATATAGTACTTTGGATTGCCTTGATCTTCTCTTTCTTTGATTTGATTCGTTACTGTGTCAGTGTTTGCA 1177
Query 1178 ATCAGATTGCGTCTCACCTGCACATACATGTCTTCAGAATCAAGGTCTCTACAGCTCATTCTAATCATCAT 1248
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1178 ATCAGATTGCATCTCACCTGCATATACATGTCTTCAGAATTAAAGCCTCTACAGCTCACTCTAATCATCAC 1248