Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07608
- Subject:
- NM_001038613.1
- Aligned Length:
- 1401
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGCCAGGTCGTTGGAGGTGGCAGCGAGACATGCACCCGGCCCGGAAGCTCCTCAGCCTCCTCTTCCTCATCCT 74
|||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|..|
Sbjct 1 ------------------------------ATGCAACCGGCCCGGAAGCTCCTCAGCCTCCTGGTCCTCCTGGT 44
Query 75 GATGGGCACTGAACTCACTCAAGTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCAGG 148
|||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 GATGGGCACCGAACTCACCCAAGTGTTGCCCACCAACCCCGAGGAGAGCTGGCAGGTGTACAGCTCTGCCCAGG 118
Query 149 ACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCACAGCAGACCATGTGTTCACGGGATGCCCGCACAAAA 222
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 119 ACAGTGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCCCAGCAGACCATGTGTTCGCGGGATGCCCGCACAAAA 192
Query 223 CAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTTGGACAGGCGGACCCAGAG 296
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 193 CAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAAAACATGTCTCAATCCATAGAAGTCTTGGACAGGCGAACTCAGAG 266
Query 297 AGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGTTCAAACAGGTGGAGGAGA 370
||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 267 AGACCTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAGATGAAAGGCCTGGAGACCAAGTTCAAGCAGGTGGAGGAGA 340
Query 371 GTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATACCT 444
|.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 341 GCCATAAGCAGCATCTAGCCAGGCAGTTCAAGGCAATAAAAGCGAAAATGGATGAACTTAGGCCTTTGATTCCT 414
Query 445 GTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCAGT 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 GTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAGGAGGAGGTCCAGAATCTGACGTCAGT 488
Query 519 GCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGAAG 592
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 GCTTAACGAACTGCAAGAGGAGATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCAGAGTGTCCAATCTTGAAG 562
Query 593 AAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGTGACCCCGTGACTGTCAAG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 563 AAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCCTGCGGGAAGCTGACAGGCATAAGTGACCCAGTGACTGTCAAG 636
Query 667 ACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGATAACCGGGTGTGGTACAT 740
|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 637 ACCTCTGGCTCAAGGTTCGGGTCCTGGATGACAGACCCGCTGGCCCCAGAAGGCGATAACCGGGTCTGGTACAT 710
Query 741 GGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCATGAACACGGACAATTTCA 814
|||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 711 GGATGGTTATCACAACAACCGCTTCGTCCGTGAGTACAAGTCCATGGTGGACTTCATGAACACGGACAACTTTA 784
Query 815 CCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGTTCTATCTACTTCAACAAG 888
||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 785 CCTCTCACCGTCTCCCACACCCCTGGTCAGGTACGGGCCAGGTGGTCTACAATGGCTCCATCTATTTCAACAAA 858
Query 889 TTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGACCCGCAGCCTGGACTATGC 962
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 859 TTCCAGAGTCACATTATCATTAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACGATTCTGAAGACGCGCAGCCTGGACTATGC 932
Query 963 CGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAGCGGGC 1036
.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 933 TGGCTACAACAATATGTATCACTATGCCTGGGGCGGCCACTCAGACATCGACCTCATGGTGGACGAGAATGGGC 1006
Query 1037 TGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTGGACCCCGTGTCCCTGCAG 1110
|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||..||||.|.||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 1007 TCTGGGCTGTCTATGCCACAAACCAGAACGCAGGCAACATTGTCATCAGCAAGCTGGATCCTGTCTCACTGCAG 1080
Query 1111 ACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACGCTGTA 1184
|.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1081 ATCCTCCAGACCTGGAACACCAGCTACCCCAAGCGCAGTGCCGGTGAGGCCTTCATCATCTGCGGCACCCTCTA 1154
Query 1185 CGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATGCCTCCACCTATGAATACA 1258
.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1155 TGTCACCAACGGTTACTCGGGGGGCACCAAGGTCCACTATGCCTACCAAACCAACGCCTCGACCTACGAGTACA 1228
Query 1259 TCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCCAAGGACCGGGCCCTGTAT 1332
|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1229 TTGACATCCCCTTCCAGAACAAATACTCTCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCTAAAGACCGCGCGCTGTAC 1302
Query 1333 GCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCGCTCCGACGAGTTG 1401
|||||||||||.|||||.||||.||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1303 GCCTGGAACAATGGCCATCAGACCCTCTATAATGTCACCCTCTTCCATGTCATCCGCTCCGATGAGTTG 1371