Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07627
Subject:
NM_001301224.2
Aligned Length:
604
Identities:
509
Gaps:
71

Alignment

Query   1  ATGGGGAACAAGCAGACCATCTTCACCGAAGAGCAGCTAGACAACTACCAGGACTGCACCTTCTTCAATAAGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGGAACAAGCAGACCATCTTCACCGAAGAGCAGCTAGACAACTACCAGGACTGCACCTTCTTCAATAAGAA  74

Query  75  GGACATCCTCAAGCTGCATTCG-----CGATTCTATGAG----CTGGCCCCCAACCTCGTCCCAATGG--ACTA  137
           ||||||||||||     ||..|     |||..||..|||    .|||.|     .|||.|||  |.||  || |
Sbjct  75  GGACATCCTCAA-----ATGGGGAAACCGAGGCTCAGAGGGATTTGGTC-----ACTCCTCC--AGGGTCAC-A  135

Query 138  CAGGAAGAGCCCCATC-GTCCAC------------GTGCCCATGAGCCTCATCATCCAGATGCCAGAG------  192
           ||||           | ||||||            |.||||    .|||..|.||||.|...|||.||      
Sbjct 136  CAGG-----------CTGTCCACAGTCTGGCTCCGGGGCCC----TCCTGCTTATCCTGCACCCACAGTGATTG  194

Query 193  -------------CTCCGGGAGAATCCCTTCAAAGAAAGGATCGTGGCGGCGTTTTCCGAGGATGGTGAGGGGA  253
                        ||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195  CTGTGTGTGTTTTCTTCAGGAGAATCCCTTCAAAGAAAGGATCGTGGCGGCGTTTTCCGAGGATGGTGAGGGGA  268

Query 254  ACCTCACTTTCAACGACTTTGTGGACATGTTTTCCGTGCTCTGCGAGTCGGCTCCCCGAGAGCTCAAGGCAAAC  327
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269  ACCTCACTTTCAACGACTTTGTGGACATGTTTTCCGTGCTCTGCGAGTCGGCTCCCCGAGAGCTCAAGGCAAAC  342

Query 328  TATGCCTTCAAGATCTATGACTTCAACACTGACAACTTCATCTGCAAGGAGGACCTGGAGCTGACGCTGGCCCG  401
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343  TATGCCTTCAAGATCTATGACTTCAACACTGACAACTTCATCTGCAAGGAGGACCTGGAGCTGACGCTGGCCCG  416

Query 402  GCTCACTAAGTCAGAGCTGGATGAGGAGGAGGTGGTGCTTGTGTGCGACAAGGTCATTGAGGAGGCTGACTTGG  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417  GCTCACTAAGTCAGAGCTGGATGAGGAGGAGGTGGTGCTTGTGTGCGACAAGGTCATTGAGGAGGCTGACTTGG  490

Query 476  ATGGTGACGGCAAGCTGGGCTTTGCTGACTTCGAGGACATGATTGCCAAGGCCCCTGACTTCCTCAGCACTTTC  549
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491  ACGGTGACGGCAAGCTGGGCTTTGCTGACTTCGAGGACATGATTGCCAAGGCCCCTGACTTCCTCAGCACTTTC  564

Query 550  CACATCCGGATC  561
           ||||||||||||
Sbjct 565  CACATCCGGATC  576