Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07641
• Subject: NR_029403.1
• Aligned Length: 1948
• Identities: 1479
• Gaps: 468

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATAGAGTAGCGGAAGTGGTCCGTTCTCTTCCTCTCCCGGCCCAAGCTTCTGGGTATTTCTATTGCGCGAGGCAT  74

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGAT  5
                                                                                 |||||
Sbjct   75  TGTGGGTTGCTGGGCGGCCCGGTCTCGGAGAAGAGGGGAGAGTGGCGGGCCGCTGAATAAGCTTCCAAAATGAT  148

Query    6  GCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAACATCA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAACATCA  222

Query   80  GTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTGTAGAT  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTGTAGAT  296

Query  154  GGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCTGCAGC  227
            |                                                                         
Sbjct  297  G-------------------------------------------------------------------------  297

Query  228  AAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTTGCTGG  301
                                                                                      
Sbjct  298  --------------------------------------------------------------------------  297

Query  302  CTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAGCTTTC  375
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  --GCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAGCTTTC  369

Query  376  CGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAAGTGGA  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAAGTGGA  443

Query  450  GCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGCTTTCT  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGCTTTCT  517

Query  524  TTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCAAGAAG  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCAAGAAG  591

Query  598  GTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTACGCTGG  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTACGCTGG  665

Query  672  GTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAAAGCTG  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAAAGCTG  739

Query  746  AGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGAACATT  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGAACATT  813

Query  820  CTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGGGATGT  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGGGATGT  887

Query  894  GGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAGGACAA  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAGGACAA  961

Query  968  TGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCCAGGTG  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCCAGGTG  1035

Query 1042  TTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGCACCTT  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGCACCTT  1109

Query 1116  CATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGATCGTCA  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGATCGTCA  1183

Query 1190  GGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACCTGCGG  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACCTGCGG  1257

Query 1264  GATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCTTATGCCAAGGCCTTGGAGATTATCCC  1337
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCATATGCCAAGGCCTTGGAGATTATCCC  1331

Query 1338  ACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGCCCAGG  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  ACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGCCCAGG  1405

Query 1412  GGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGGAGCCA  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGGAGCCA  1479

Query 1486  GCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAAACCAT  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  GCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAAACCAT  1553

Query 1560  CAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCAC----  1629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1554  CAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCACTGAG  1627

Query 1630  --------------------------------------------------------------------------  1629
                                                                                      
Sbjct 1628  AGGCACCCCACCCATCACATGGCTGGCTGGCTGCTGGGTGCACTTACCCTCCTTGGCTTGGTTACTTCATTTTA  1701

Query 1630  --------------------------------------------------------------------------  1629
                                                                                      
Sbjct 1702  CAAGGAAGGGGTAGTAATTGGCCCACTCTCTTCTTACTGGAGGCTATTTAAATAAAATGTAAGACTTCAGATAA  1775

Query 1630  ------------------------  1629
                                    
Sbjct 1776  CTTTGTAAATTAAAAAAAAAAAAA  1799