Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501738.1
• Aligned Length: 2219
• Identities: 1557
• Gaps: 448

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG-------------------------------  709
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                               
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA  740

Query  710  --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  781
              |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  814

Query  782  AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC  855
            ||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC  888

Query  856  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---TAAC--  924
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.|||||||||||   |.||  
Sbjct  889  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAG  962

Query  925  -TCTCAGGA-----GCCTT-------------------------CTCCGCAG----------------------  945
             ||||.|||     .||||                         ||||.|||                      
Sbjct  963  TTCTCTGGAAGACCCCCTTAAGAACGGACCACACCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAG  1036

Query  946  -----------------------------------------------------------------------TTG  948
                                                                                   |||
Sbjct 1037  TAGCCATAGTTTCTAAGGAAGCAGCCACTTACTCTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTG  1110

Query  949  G----------------------CTTC----------CTCGGTA-------------------------GCTTC  965
            |                      ||||          ||.|.||                         |||.|
Sbjct 1111  GAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGC  1184

Query  966  CAC-------------------------AC--GGAGCAT--GCCC-GAGAGC------------CTGGA-----  992
            |||                         ||  ||..|.|  |||| ||.|.|            |||||     
Sbjct 1185  CACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAGGCTCTTCGGCCCTGAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCAC  1258

Query  993  -------CAG-------CCCAA--------------------------CCTCTG--------------------  1006
                   |||       |||||                          ||||||                    
Sbjct 1259  TGTGCATCAGCACTGTCCCCAAGCCTCTAGCTCTTTCCTGTCTTCAGTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTC  1332

Query 1007  -------------GCAG-----ACCAGGGG--TT-------ACCAGCCTCA----------CAACT--------  1035
                         ||||     .|||||.|  ||       |||.||.|||          ||.||        
Sbjct 1333  CACGTTAAGAAGAGCAGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGC  1406

Query 1036  ----------------------------------------------------------GCAGCTGCCTTCAAGC  1051
                                                                      ||.|||||.|||||||
Sbjct 1407  GTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGC  1480

Query 1052  CTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGA  1125
            |||||||||||||..|||   ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||
Sbjct 1481  CTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGA  1551

Query 1126  ATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTG  1198
            ||.|||||||..||...||..|||||..|||.|||             | ||.||||.|...||||||||||||
Sbjct 1552  ATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTG  1612

Query 1199  ACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAAC  1272
            ||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1613  ACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAAC  1686

Query 1273  CAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACT  1345
            ||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1687  CAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATT  1759

Query 1346  GCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAA  1419
            |||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1760  GCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAG  1833

Query 1420  TTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTG  1493
            ||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1834  TTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTG  1907

Query 1494  GCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTG  1567
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1908  GCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCG  1981

Query 1568  AACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCT  1641
            |.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1982  AGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCT  2055

Query 1642  GGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAG  1715
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2056  GGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAG  2129

Query 1716  TTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  TTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  2202