Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501739.1
• Aligned Length: 2204
• Identities: 1557
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG------------------GCCCACCAAGAAA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                  |||||||||||||
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGGAAAATTCCACCTAAACGCCCACCAAGAAA  740

Query  723  ACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTG  796
            ||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct  741  ACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTG  814

Query  797  AGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACT  870
            ||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACT  888

Query  871  GGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---TAAC---TCTCAGGA-----G  933
            ||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.|||||||||||   |.||   ||||.|||     .
Sbjct  889  GGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAGTTCTCTGGAAGACCC  962

Query  934  CCTT-------------------------CTCCGCAG-------------------------------------  945
            ||||                         ||||.|||                                     
Sbjct  963  CCTTAAGAACGGACCACACCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAGTAGCCATAGTTTCTA  1036

Query  946  --------------------------------------------------------TTGG--------------  949
                                                                    ||||              
Sbjct 1037  AGGAAGCAGCCACTTACTCTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTGGAAGGCTTTGGAAAC  1110

Query  950  --------CTTC----------CTCGGTA-------------------------GCTTCCAC------------  968
                    ||||          ||.|.||                         |||.||||            
Sbjct 1111  TTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGCCACTGTGTCTGCTGC  1184

Query  969  -------------AC--GGAGCAT--GCCC-GAGAGC------------CTGGA------------CAG-----  995
                         ||  ||..|.|  |||| ||.|.|            |||||            |||     
Sbjct 1185  TCTCGCTGCGAAAACCAGGCTCTTCGGCCCTGAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCACTGTGCATCAGCACTG  1258

Query  996  --CCCAA--------------------------CCTCTG---------------------------------GC  1008
              |||||                          ||||||                                 ||
Sbjct 1259  TCCCCAAGCCTCTAGCTCTTTCCTGTCTTCAGTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTCCACGTTAAGAAGAGC  1332

Query 1009  AG-----ACCAGGGG--TT-------ACCAGCCTCA----------CAACT-----------------------  1035
            ||     .|||||.|  ||       |||.||.|||          ||.||                       
Sbjct 1333  AGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGA  1406

Query 1036  -------------------------------------------GCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTG  1066
                                                       ||.|||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct 1407  GAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCA  1480

Query 1067  GCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCT  1140
            |||   ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||.
Sbjct 1481  GCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCA  1551

Query 1141  GCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAG  1213
            ..||..|||||..|||.|||             | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1552  CGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTG  1612

Query 1214  TGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGA  1287
            ||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1613  TGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGA  1686

Query 1288  CC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGG  1360
            || .||||| |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1687  CCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGG  1759

Query 1361  CCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAA  1434
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1760  CCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAA  1833

Query 1435  TGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTT  1508
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1834  TGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTT  1907

Query 1509  TGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGA  1582
            |||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1908  TGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGA  1981

Query 1583  CTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTG  1656
            |.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1982  CAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTG  2055

Query 1657  GAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGAC  1730
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2056  GAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGAC  2129

Query 1731  CTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            .|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  ATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  2187