Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501742.1
• Aligned Length: 2087
• Identities: 1535
• Gaps: 316

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG-------------------------------  709
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                               
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA  740

Query  710  --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  781
              |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  814

Query  782  AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC  855
            ||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC  888

Query  856  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---------  920
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.|||||||||||         
Sbjct  889  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAG  962

Query  921  --------------------------------------------------------------------------  920
                                                                                      
Sbjct  963  TTCTCTGGAAGACCCCCTTAAGAACGGACCACACCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAG  1036

Query  921  ----------------------------TAACTCT---------------------------------------  927
                                        |.|||||                                       
Sbjct 1037  TAGCCATAGTTTCTAAGGAAGCAGCCACTTACTCTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTG  1110

Query  928  --------------------------------------------------------------------------  927
                                                                                      
Sbjct 1111  GAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGC  1184

Query  928  ----------------------------------------CAGGAGCCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAG  961
                                                    |||||||||||||.|||...|||.||.||.|.||
Sbjct 1185  CACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAG  1258

Query  962  CTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAACT  1035
            ||||..|.|.||||..|.|.|||.|||..||.||||||...||..||||.||...|||..|..|||||....|.
Sbjct 1259  CTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCC  1332

Query 1036  GCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGT  1109
            ||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.
Sbjct 1333  GCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGC  1403

Query 1110  ACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGA  1182
            ||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..|||.|||             | ||.||||.
Sbjct 1404  ACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGG  1464

Query 1183  CAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGAT  1256
            |...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1465  CCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCAT  1538

Query 1257  GTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAA  1329
            |||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1539  GTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAA  1611

Query 1330  TTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGA  1403
            ||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1612  TTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGA  1685

Query 1404  GCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATG  1477
            |||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686  GCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATG  1759

Query 1478  CGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTT  1551
            |.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1760  CTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTC  1833

Query 1552  CACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGA  1625
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.|||||||||
Sbjct 1834  CACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGA  1907

Query 1626  ATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCT  1699
            |||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1908  ATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCT  1981

Query 1700  CAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCT  1773
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1982  CTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCT  2055

Query 1774  CATTCTGTGAATTTT  1788
            |||||||||||||||
Sbjct 2056  CATTCTGTGAATTTT  2070