Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501743.1
• Aligned Length: 1967
• Identities: 1535
• Gaps: 196

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG-------------------------------  709
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                               
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA  740

Query  710  --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  781
              |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  814

Query  782  AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC  855
            ||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC  888

Query  856  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAAT--------  921
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.||||||||||||        
Sbjct  889  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAATGTAAGCAG  962

Query  922  ---------AACT-------------------------------------------------------------  925
                     ||||                                                             
Sbjct  963  GTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTGGAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACA  1036

Query  926  ------------------------------------------------------------------CTCAGGAG  933
                                                                              |.||||||
Sbjct 1037  GTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGCCACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAGTAGCACCCAGGAG  1110

Query  934  CCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAGCTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGG  1007
            |||||||.|||...|||.||.||.|.||||||..|.|.||||..|.|.|||.|||..||.||||||...||..|
Sbjct 1111  CCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAG  1184

Query 1008  CAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAACTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCAC  1081
            |||.||...|||..|..|||||....|.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   |||||||||
Sbjct 1185  CAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCAC  1255

Query 1082  CAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCA  1155
            |.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..||
Sbjct 1256  CTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACA  1329

Query 1156  GTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGC  1228
            |.|||             | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1330  GGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAAC  1390

Query 1229  ACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGC  1301
            ||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||
Sbjct 1391  ACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGC  1463

Query 1302  ACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTG  1375
            .||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1464  TCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTG  1537

Query 1376  TAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAA  1449
            ||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1538  TAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAA  1611

Query 1450  AGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTG  1523
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1612  AGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTG  1685

Query 1524  TGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCC  1597
            ||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 1686  TGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCC  1759

Query 1598  TCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTAC  1671
            |.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1760  TTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATAC  1833

Query 1672  ACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAA  1745
            ||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1834  ACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAA  1907

Query 1746  GGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            |||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908  GGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1950