Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501746.1
• Aligned Length: 1823
• Identities: 1533
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA  296

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  297  ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG  370

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
            ||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct  445  GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA  518

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
            ..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct  519  CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA  592

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  666

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG-------------------------------  709
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                               
Sbjct  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA  740

Query  710  --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  781
              |||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA  814

Query  782  AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC  855
            ||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC  888

Query  856  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCA  929
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.|||||||||||||.|.|.||
Sbjct  889  CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAATAGCACCCA  962

Query  930  GGAGCCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAGCTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCT  1003
            |||||||||||.|||...|||.||.||.|.||||||..|.|.||||..|.|.|||.|||..||.||||||...|
Sbjct  963  GGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTT  1036

Query 1004  CTGGCAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAACTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAG  1077
            |..||||.||...|||..|..|||||....|.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   |||||
Sbjct 1037  CCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAG  1107

Query 1078  TCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGG  1151
            |||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||
Sbjct 1108  TCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGG  1181

Query 1152  ATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCT  1224
            ..|||.|||             | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.
Sbjct 1182  TACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCG  1242

Query 1225  GAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAG  1297
            ||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |
Sbjct 1243  GAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-G  1315

Query 1298  TGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGA  1371
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1316  TGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGC  1389

Query 1372  TTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATG  1445
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1390  TTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTG  1463

Query 1446  CCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAG  1519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1464  CCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGG  1537

Query 1520  CCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTAT  1593
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1538  CCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTAC  1611

Query 1594  GCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGG  1667
            |||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  GCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGG  1685

Query 1668  CTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCA  1741
            .|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1686  ATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCA  1759

Query 1742  AGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            |||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760  AGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1806