Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07648
• Subject: XM_006501748.1
• Aligned Length: 1808
• Identities: 1243
• Gaps: 364

Alignment

Query    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct   75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query  149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
            ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query  223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA  296
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||                 
Sbjct  223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTT-----------------  279

Query  297  ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG  370
                                                |||      |||||                        
Sbjct  280  ------------------------------------TCC------GTCCA------------------------  287

Query  371  CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT  444
                                                                                      
Sbjct  288  --------------------------------------------------------------------------  287

Query  445  GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT  518
                                                                                      
Sbjct  288  --------------------------------------------------------------------------  287

Query  519  GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA  592
                                                                                      
Sbjct  288  --------------------------------------------------------------------------  287

Query  593  AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG  666
                                  |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  288  ----------------------GAAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG  339

Query  667  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG------------------GCCCACCAAGAAA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||                  |||||||||||||
Sbjct  340  GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGGAAAATTCCACCTAAACGCCCACCAAGAAA  413

Query  723  ACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTG  796
            ||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct  414  ACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTG  487

Query  797  AGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACT  870
            ||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  488  AGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACT  561

Query  871  GGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCA  944
            ||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.|||||||||||||.|.|.|||||||||||||.|||
Sbjct  562  GGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAATAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCA  635

Query  945  GTTGGCTTCCTCGGTAGCTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGG  1018
            ...|||.||.||.|.||||||..|.|.||||..|.|.|||.|||..||.||||||...||..||||.||...||
Sbjct  636  ACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGCGTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGG  709

Query 1019  TTACCAGCCTCACAACTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAA  1092
            |..|..|||||....|.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||   ||||||||||.||||||||.
Sbjct  710  TGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGCCTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAG  780

Query 1093  CGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGC  1166
            ||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||||.|||||||..||...||..|||||..|||.|||      
Sbjct  781  CGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGAATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC------  848

Query 1167  CAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCA  1239
                   | ||.||||.|...||||||||||||||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct  849  -------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTGACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCG  915

Query 1240  GGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAAT  1312
            ||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.|
Sbjct  916  GGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAACCAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGT  988

Query 1313  CTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAA  1386
            |.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  989  CCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATTGCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAG  1062

Query 1387  GGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCT  1460
            |||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1063  GGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAGTTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCT  1136

Query 1461  TGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCA  1534
            ||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1137  TGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTGGCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCA  1210

Query 1535  TTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACT  1608
            ||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct 1211  TTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCGAGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACA  1284

Query 1609  ATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGA  1682
            |||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1285  ATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGA  1358

Query 1683  CACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCC  1756
            .|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1359  TACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCAC  1432

Query 1757  TGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1788
            |.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  TTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT  1464