Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07652
• Subject: NM_001353969.1
• Aligned Length: 1277
• Identities: 1222
• Gaps: 52

Alignment

Query    1  ATGTCTGACCACGGAGATGTGAGCCTCCCGCCCGAAGACCGGGTGAGGGCTCTCTCCCAGCTGGGTAGTGCGGT  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGACCATGGAGATGTGAGCCTCCCGCCCGAAGACCGGGTGAGGGCTCTCTCCCAGCTGGGTAGTGCGGT  74

Query   75  AGAGGTGAATGAAGACATTCCACCCCGTCGGTACTTCCGCTCTGGAGTTGAGATTATCCGAATGGCATCCATTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGGTGAATGAAGACATTCCACCCCGTCGGTACTTCCGCTCTGGAGTTGAGATTATCCGAATGGCATCCATTT  148

Query  149  ACTCTGAGGAAGGCAACATTGAACATGCCTTCATCCTCTATAACAAGTATATCACGCTCTTTATTGAGAAACTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTCTGAGGAAGGCAACATTGAACATGCCTTCATCCTCTATAACAAGTATATCACGCTCTTTATTGAGAAACTA  222

Query  223  CCAAAACATCGAGATTACAAATCTGCTGTCATTCCTGAAAAGAAAGACACAGTAAAGAAATTAAAGGAGATTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAAAACATCGAGATTACAAATCTGCTGTCATTCCTGAAAAGAAAGACACAGTAAAGAAATTAAAGGAGATTGC  296

Query  297  ATTTCCCAAAGCAGAAGAGCTGAAGGCAGAGCTGTTAAAACGATATACCAAAGAATATACAGAATATAATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTTCCCAAAGCAGAAGAGCTGAAGGCAGAGCTGTTAAAACGATATACCAAAGAATATACAGAATATAATGAAG  370

Query  371  AAAAGAAGAAGGAAGCAGAGGAATTGGCCCGGAACATGGCCATCCAGCAAGAGCTGGAAAAGGAAAAACAGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAGAAGAAGGAAGCAGAGGAATTGGCCCGGAACATGGCCATCCAGCAAGAGCTGGAAAAGGAAAAACAGAGG  444

Query  445  GTAGCACAACAGAAGCAGCAGCAATTGGAACAGGAACAGTTCCATGCCTTCGAGGAGATGATCCGGAACCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAGCACAACAGAAGCAGCAGCAATTGGAACAGGAACAGTTCCATGCCTTCGAGGAGATGATCCGGAACCAGGA  518

Query  519  GCTAGAAAAAGAGCGACTGAAAATTGTACAGGAGTTTGGGAAGGTAGACCCTGGCCTAGGTGGCCCGCTAGTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTAGAAAAAGAGCGACTGAAAATTGTACAGGAGTTTGGGAAGGTAGACCCTGGCCTAGGTGGCCCGCTAGTGC  592

Query  593  CTGACTTGGAGAAGCCCTCCTTAGATGTGTTCCCCACCTTAACAGTCTCATCCATACAGCCTTCAGACTGTCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACTTGGAGAAGCCCTCCTTAGATGTGTTCCCCACCTTAACAGTCTCATCCATACAGCCTTCAGACTGTCAC  666

Query  667  ACAACTGTAAGGCCAGCTAAGCCACCTGTGGTGGACAGGTCCTTGAAACCTGGAGCACTGAGCAACTCAGAAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAACTGTAAGGCCAGCTAAGCCACCTGTGGTGGACAGGTCCTTGAAACCTGGAGCACTGAGCAACTCAGAAAG  740

Query  741  TATTCCCACAATCGATGGATTGCGCCATGTGGTGGTGCCTGGGCGGCTGTGCCCACAGTTTCTCCAGTTAGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTCCCACAATCGATGGATTGCGCCATGTGGTGGTGCCTGGGCGGCTGTGCCCACAGTTTCTCCAGTTAGCCA  814

Query  815  GTGCCAACACTGCCCGGGGAGTGGAGACATGTGGAATTCTCTGTGGAAAACTGATGAGGAATGAATTTACCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCCAACACTGCCCGGGGAGTGGAGACATGTGGAATTCTCTGTGGAAAACTGATGAGGAATGAATTTACCATT  888

Query  889  ACCCATGTTCTCATCCCCAAGCAAAGTGCTGGGTCTGATTACTGCAACACAGAGAACGAAGAAGAACTTTTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCCATGTTCTCATCCCCAAGCAAAGTGCTGGGTCTGATTACTGCAACACAGAGAACGAAGAAGAACTTTTCCT  962

Query  963  CATACAGGATCAGCAGGGCCTCATCACACTGGGCTGGATTCATACTCACCCCACACAGACCGCGTTTCTCTCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATACAGGATCAGCAGGGCCTCATCACACTGGGCTGGATTCATACTCACCCCACACAGACCGCGTTTCTCTCCA  1036

Query 1037  GTGTCGACCTACACACTCACTGCTCTTACCAGATGATGTTGCCAGAGTCAGTAGCCATTGTTTGCTCCCCCAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGTCGACCTACACACTCACTGCTCTTACCAGATGATGTTGCCAGAGTCAGTAGCCATTGTTTGCTCCCCCAAG  1110

Query 1111  TTCCAGGAAACTGGATTCTTTAAACTAACTGACCATGGACTAGAGGAGATTTCTTCCTGTCGCCAGAAAGGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCAGGAAACTGGATTCTTTAAACTAACTGACCATGGACTAGAGGAGATTTCTTCCTGTCGCCAGAAAGGATT  1184

Query 1185  TCATCCACACAGCAAGGATCCACCTCTGTT-----CTGTAGCTGCAGCCACGTGACTGTTGTGGACAGAGCAGT  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||.||.                           
Sbjct 1185  TCATCCACACAGCAAGGATCCACCTCTGTTCTGTCCTGTA-CTTCAA---------------------------  1230

Query 1254  GACCATCACAGACCTTCGA  1272
                               
Sbjct 1231  -------------------  1230