Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07670
• Subject: XM_017011686.2
• Aligned Length: 3715
• Identities: 3670
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTTTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTGTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG  74

Query   75  TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATCCCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATACCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA  148

Query  149  CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG  222

Query  223  GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA  296

Query  297  TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGCAGTCTTTGGTAGATGAGTGGCTGGATAGCTACAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGCAGTCTTTGGTAGATGAGTGGCTGGATAGCTACAAGC  370

Query  371  AAGACCAGGATGCAGGATTTCTGGAGCTTGTTAACTTTTTCATCCAATCTTGCGGATGTAAAGGCATTGTGACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGACCAGGATGCAGGATTTCTGGAGCTTGTTAACTTTTTCATCCAATCTTGCGGATGTAAAGGCATTGTGACC  444

Query  445  CCTGAGATGTTCAAGAAGATGTCCAACTCAGAGATCATCCAGCACCTAACAGAGCAGTTTAATGAGGACTCGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTGAGATGTTCAAGAAGATGTCCAACTCAGAGATCATCCAGCACCTAACAGAGCAGTTTAATGAGGACTCGGG  518

Query  519  GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT  592

Query  593  TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC  666

Query  667  CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT  740

Query  741  AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC  814

Query  815  CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG  888

Query  889  ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG  962

Query  963  TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA  1036

Query 1037  AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG  1110

Query 1111  TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT  1184

Query 1185  CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG  1258

Query 1259  TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCCGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCAGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA  1332

Query 1333  GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA  1406

Query 1407  GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG  1480

Query 1481  CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG  1554

Query 1555  CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG  1628

Query 1629  GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA  1702

Query 1703  CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA  1776

Query 1777  GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG  1850

Query 1851  CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC  1924

Query 1925  TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC  1998

Query 1999  CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT  2072

Query 2073  AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA  2146

Query 2147  CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG  2220

Query 2221  GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC  2294

Query 2295  TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG  2368

Query 2369  ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG  2442

Query 2443  ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG  2516

Query 2517  CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA  2590

Query 2591  TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG  2664

Query 2665  GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT  2738

Query 2739  AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG  2812

Query 2813  AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG  2886

Query 2887  AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT  2960

Query 2961  CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC  3034

Query 3035  TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG  3108

Query 3109  CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA  3182

Query 3183  CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA  3256

Query 3257  GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC  3330

Query 3331  ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT  3404

Query 3405  TGCCCAGGGTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCACACA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  TGCCCAGGGTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCACACA  3478

Query 3479  ACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAGTTA  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  ACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAGTTA  3552

Query 3553  GAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAGTGA  3626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAGTGA  3626

Query 3627  GCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGAGGATTTC-------------------------  3675
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|                         
Sbjct 3627  GCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGA-GATTACTGAGAGTCTTCCGTTACTAGGGCAG  3699

Query 3676  ---------------  3675
                           
Sbjct 3700  AGGACTGCTGTTTGC  3714