Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07685
• Subject: NM_001293695.2
• Aligned Length: 1708
• Identities: 1693
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGACCGGAT----CTCAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCA  70
            |||.|||.|       |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAAG-------TCTTACTCAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCA  67

Query   71  CCCCACCCCGGAGGGTCCAGACTCCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTG  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  CCCCACCCCGGAGGGTCCAGACTCCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTG  141

Query  145  GGCGTGAAGAACTCAGAACCCTCGGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCG  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  GGCGTGAAGAACTCAGAACCCTCGGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCG  215

Query  219  GAGGGTGGAGCTCTCGGGCCCCAAGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGT  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  GAGGGTGGAGCTCTCGGGCCCCAAGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGT  289

Query  293  CCAAGCAGGTGGAGAACGCCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCCAC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  CCAAGCAGGTGGAGAACGCCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCCAC  363

Query  367  AAGACGCCAGAACCGGCCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGGAT  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  AAGACGCCAGAACCGGCCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGGAT  437

Query  441  GGAGCCCCCTGCCTCCAAGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCCCCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGTGGAGA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GGAGCCCCCTGCCTCCAAGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCCCCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGTGGAGA  511

Query  515  TCCAGATGCCCAAGCCTGCTGAGGCGCCCACCGCCCCCAGCCCAGCCCAGACCTTGGAGAATTCAGAGCCTGCC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TCCAGATGCCCAAGCCTGCTGAGGCGCCCACCGCCCCCAGCCCAGCCCAGACCTTGGAGAATTCAGAGCCTGCC  585

Query  589  CCTGTGTCTCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCCCCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTACACCCCGGAGCCA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  CCTGTGTCTCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCCCCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTACACCCCGGAGCCA  659

Query  663  GGAGGCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGATGCCGGGCTCAAGCAGG  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  GGAGGCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGATGCCGGGCTCAAGCAGG  733

Query  737  CGCCTGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACTCCATCCTGGAGCAGATG  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  CGCCTGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACTCCATCCTGGAGCAGATG  807

Query  811  CGCCGGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGCGGCTTGGGTAAATCCAC  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  CGCCGGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGCGGCTTGGGTAAATCCAC  881

Query  885  CTTAATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCAGAGGAGCGCATCCCCA  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  CTTAATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCAGAGGAGCGCATCCCCA  955

Query  959  AGACCATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGAAGCTGACAGTGATTGAC  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  AGACCATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGAAGCTGACAGTGATTGAC  1029

Query 1033  ACACCAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAGTTCATCAATGACCAGTA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  ACACCAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAGTTCATCAATGACCAGTA  1103

Query 1107  CGAGAAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACACCCGCGTCCACTGCTGCC  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CGAGAAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACACCCGCGTCCACTGCTGCC  1177

Query 1181  TCTACTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGAAACGCCTGAGCAAGGTG  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  TCTACTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGAAACGCCTGAGCAAGGTG  1251

Query 1255  GTCAACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTCCACTTCAAACAGCGGAT  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  GTCAACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTCCACTTCAAACAGCGGAT  1325

Query 1329  CACCGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGAGGACTCGGAGGACCGGC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  CACCGCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGAGGACTCGGAGGACCGGC  1399

Query 1403  TGGTGAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACGAGTACCAGGTCAACGGC  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TGGTGAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACGAGTACCAGGTCAACGGC  1473

Query 1477  AAGAGGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACACACTGTGAGTTTGCCTA  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  AAGAGGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACACACTGTGAGTTTGCCTA  1547

Query 1551  CCTGCGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAGCATCCACTTCGAGGCGT  1624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  CCTGCGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAGCATCCACTTCGAGGCGT  1621

Query 1625  ACCGTGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCGTGGAGGAGAAGGAGCCAGAAGCCCCG  1698
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  ACCGTGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCATGGAGGAGAAGGAGCCAGAAGCCCCG  1695

Query 1699  GAGAGG  1704
            ||||.|
Sbjct 1696  GAGATG  1701