Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07685
Subject:
NM_006640.4
Aligned Length:
1704
Identities:
1702
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGGACCGGATCTCAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCACCCC  74
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Sbjct    1  ATGGAGAGGGACCGGATCTCAGCCTTGAAAAGATCTTTTGAGGTCGAGGAGGTCGAGACACCCAACTCCACCCC  74

Query   75  ACCCCGGAGGGTCCAGACTCCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTGGGCG  148
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Sbjct   75  ACCCCGGAGGGTCCAGACTCCCCTACTCCGAGCCACTGTGGCCAGCTCCACCCAGAAATTCCAGGACCTGGGCG  148

Query  149  TGAAGAACTCAGAACCCTCGGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCGGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGAACTCAGAACCCTCGGCCCGCCATGTGGACTCCCTAAGCCAACGCTCCCCCAAGGCGTCCCTGCGGAGG  222

Query  223  GTGGAGCTCTCGGGCCCCAAGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGTCCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGAGCTCTCGGGCCCCAAGGCGGCCGAGCCGGTGTCCCGGCGCACTGAGCTGTCCATTGACATCTCGTCCAA  296

Query  297  GCAGGTGGAGAACGCCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCCACAAGA  370
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Sbjct  297  GCAGGTGGAGAACGCCGGGGCCATCGGCCCGTCCCGGTTCGGGCTCAAGAGGGCCGAGGTGTTGGGCCACAAGA  370

Query  371  CGCCAGAACCGGCCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGGATGGAG  444
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Sbjct  371  CGCCAGAACCGGCCCCTCGGAGGACGGAGATCACCATCGTCAAACCCCAGGAGTCAGCCCACCGGAGGATGGAG  444

Query  445  CCCCCTGCCTCCAAGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCCCCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGTGGAGATCCA  518
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Sbjct  445  CCCCCTGCCTCCAAGGTCCCCGAGGTGCCCACTGCCCCTGCCACCGACGCAGCCCCCAAGAGGGTGGAGATCCA  518

Query  519  GATGCCCAAGCCTGCTGAGGCGCCCACCGCCCCCAGCCCAGCCCAGACCTTGGAGAATTCAGAGCCTGCCCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGCCCAAGCCTGCTGAGGCGCCCACCGCCCCCAGCCCAGCCCAGACCTTGGAGAATTCAGAGCCTGCCCCTG  592

Query  593  TGTCTCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCCCCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTACACCCCGGAGCCAGGAG  666
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Sbjct  593  TGTCTCAGCTGCAGAGCAGGCTGGAGCCCAAGCCCCAGCCCCCTGTGGCTGAGGCTACACCCCGGAGCCAGGAG  666

Query  667  GCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGATGCCGGGCTCAAGCAGGCGCC  740
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Sbjct  667  GCCACTGAGGCGGCTCCCAGCTGCGTTGGCGACATGGCCGACACCCCCAGAGATGCCGGGCTCAAGCAGGCGCC  740

Query  741  TGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACTCCATCCTGGAGCAGATGCGCC  814
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Sbjct  741  TGCATCACGGAACGAGAAGGCCCCGGTGGACTTCGGCTACGTGGGGATTGACTCCATCCTGGAGCAGATGCGCC  814

Query  815  GGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGCGGCTTGGGTAAATCCACCTTA  888
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Sbjct  815  GGAAGGCCATGAAGCAGGGCTTCGAGTTCAACATCATGGTGGTCGGGCAGAGCGGCTTGGGTAAATCCACCTTA  888

Query  889  ATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCAGAGGAGCGCATCCCCAAGAC  962
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Sbjct  889  ATCAACACCCTCTTCAAATCCAAAATCAGCCGGAAGTCGGTGCAGCCCACCTCAGAGGAGCGCATCCCCAAGAC  962

Query  963  CATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGAAGCTGACAGTGATTGACACAC  1036
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Sbjct  963  CATCGAGATCAAGTCCATCACGCACGATATTGAGGAGAAAGGCGTCCGGATGAAGCTGACAGTGATTGACACAC  1036

Query 1037  CAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAGTTCATCAATGACCAGTACGAG  1110
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Sbjct 1037  CAGGGTTCGGGGACCACATCAACAACGAGAACTGCTGGCAGCCCATCATGAAGTTCATCAATGACCAGTACGAG  1110

Query 1111  AAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACACCCGCGTCCACTGCTGCCTCTA  1184
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Sbjct 1111  AAATACCTGCAGGAGGAGGTCAACATCAACCGCAAGAAGCGCATCCCGGACACCCGCGTCCACTGCTGCCTCTA  1184

Query 1185  CTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGAAACGCCTGAGCAAGGTGGTCA  1258
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Sbjct 1185  CTTCATCCCCGCCACCGGCCACTCCCTCAGGCCCCTGGACATCGAGTTTATGAAACGCCTGAGCAAGGTGGTCA  1258

Query 1259  ACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTCCACTTCAAACAGCGGATCACC  1332
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Sbjct 1259  ACATCGTCCCTGTCATCGCCAAGGCGGACACACTCACCCTGGAGGAGAGGGTCCACTTCAAACAGCGGATCACC  1332

Query 1333  GCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGAGGACTCGGAGGACCGGCTGGT  1406
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Sbjct 1333  GCAGACCTGCTGTCCAACGGCATCGACGTGTACCCCCAGAAGGAATTTGATGAGGACTCGGAGGACCGGCTGGT  1406

Query 1407  GAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACGAGTACCAGGTCAACGGCAAGA  1480
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Sbjct 1407  GAACGAGAAGTTCCGGGAGATGATCCCATTTGCTGTGGTGGGCAGTGACCACGAGTACCAGGTCAACGGCAAGA  1480

Query 1481  GGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACACACTGTGAGTTTGCCTACCTG  1554
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Sbjct 1481  GGATCCTTGGGAGGAAGACCAAGTGGGGTACCATCGAAGTTGAAAACACCACACACTGTGAGTTTGCCTACCTG  1554

Query 1555  CGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAGCATCCACTTCGAGGCGTACCG  1628
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Sbjct 1555  CGGGACCTTCTCATCAGGACGCACATGCAGAACATCAAGGACATCACCAGCAGCATCCACTTCGAGGCGTACCG  1628

Query 1629  TGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCGTGGAGGAGAAGGAGCCAGAAGCCCCGGAGA  1702
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Sbjct 1629  TGTGAAGCGCCTCAACGAGGGCAGCAGCGCCATGGCCAACGGCATGGAGGAGAAGGAGCCAGAAGCCCCGGAGA  1702

Query 1703  GG  1704
            .|
Sbjct 1703  TG  1704