Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07701
• Subject: XM_024450548.1
• Aligned Length: 1342
• Identities: 1196
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAAGAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAAGAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGC  74

Query   75  TGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCGTGTGCAGGTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACAGCGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCGTGTGCAGGTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACAGCGGAGC  148

Query  149  CCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCATTTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  149  CCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCATTTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAA-  221

Query  223  GCCTGTGCCCCAGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGGGACTATATCCGGCT  296
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  -----------AGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGGGACTATATCCGGCT  284

Query  297  GGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAGCATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  GGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAGCATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCA  358

Query  371  AGGGCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATACATCACCACGGCTCTGCGTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  AGGGCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATACATCACCACGGCTCTGCGTGAC  432

Query  445  ACCCGGACCACCAGACGGTTCTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCGGAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  ACCCGGACCACCAGACGGTTCTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCGGAAT  506

Query  519  GCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAGCTTCTGTCTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  GCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAGCTTCTGTCTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGG  580

Query  593  TCATCGATTACACGCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAGCTACGACTACCTGACGGACGAGGAGGAGCGGCACAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  TCATCGATTACACGCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAGCTACGACTACCTGACGGACGAGGAGGAGCGGCACAGC  654

Query  667  GCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCGCCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGACGAGGACAGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  655  GCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCGCCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGATGAGGACAGCTG  728

Query  741  GTACAGCAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAGGGCTACCTGGAGGAGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GTACAGCAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAGGGCTACCTGGAGGAGCTGG  802

Query  815  TGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTGAAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  TGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTGAAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGCG  876

Query  889  GCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGGAGCTGCAGGAGCAGCTGACAGGTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  GCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGGAGCTGCAGGAGCAGCTGACAGGTCT  950

Query  963  GATCCCCAGTGACCACGCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCAATGGCCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  GATCCCCAGTGACCACGCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCAATGGCCCT  1024

Query 1037  CACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCAAGCTCTACCGGAGACACAGCTTCATGAGCACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  CACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCAAGCTCTACCGGAGACACAGCTTCATGAGCACG  1098

Query 1111  GAGCCGCTGTCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCACGCGGGACGAGGAGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  GAGCCGCTGTCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCACGCGGGACGAGGAGCC  1172

Query 1185  CTGGGGTCCCATC-GGAAGCTCAGAGCCAA--------AT----------------------------------  1215
            ||||||||||||| |||||    ||.||.|        ||                                  
Sbjct 1173  CTGGGGTCCCATCGGGAAG----GACCCCACGCCCTCCATGCTGGGCCTCTGCGGCTCCCTGGCCTCCATTCCC  1242

Query 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215
                                                                                      
Sbjct 1243  AGCTGCAAGTCCCTGGCGAGCTTCAAATCCAACGAGTGCCTGGTGAGCGACAGTCCCGAGGGCAGCCCAGCACT  1316

Query 1216  ----------  1215
                      
Sbjct 1317  GAGCCCCAGC  1326