Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07729
• Subject: NM_001081639.3
• Aligned Length: 1955
• Identities: 1204
• Gaps: 640

Alignment

Query    1  ATGACCTCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCC  74
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAGTACCATCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCA  222
            |||||.|||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCTATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||..
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTATGGCAGCCACACTGTAGGCCTCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCA  370
            ||||||.|||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAG  444
            ||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT  592
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGGTTATGACTCGCGCGCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTT  666
            |||.||||||||||..|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCGGGTCCTGTCGTGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||.|||||..|||||..|.||||||||
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  CTCTGATGCCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTACAAGGAGTGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGC  814
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||..|||.||||||||||||.||||.|.|||||...|
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACA  962
            ||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962

Query  963  GATCCGTGCCAGACCCTTCCTCTCCGTGCGGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036
            |.||..||.||||..||.||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036

Query 1037  GTCAGTCACAGGGAGGGATGCACACTTTCCTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAA  1110
            ||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||...||||||||.|
Sbjct 1037  GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA  1110

Query 1111  TCAAAGCGCCAATCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTA  1184
            ||||.|..|||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111  TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA  1184

Query 1185  CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT  1258
            |||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT  1258

Query 1259  CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-CTCCAAGGCTGG---TGAG----------  1317
            |||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.||.| |||||...||||   ||||          
Sbjct 1259  CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCC  1330

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1331  TCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCC  1404

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1405  GTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGAC  1478

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1479  ATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGC  1552

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1553  AGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAG  1626

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1627  GATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAA  1700

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1701  ACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACA  1774

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1775  GACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCC  1848

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1849  CAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGT  1922

Query 1318  -------------------------------  1317
                                           
Sbjct 1923  GCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1953