Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07729
• Subject: NM_006866.4
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1177
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGACCTCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCC  74
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAGTACCATCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCA  222
            ||||||||||..||.|..|||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||..||||.|||.||||||   |
Sbjct  149  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  219

Query  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCTATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCT----  292
            ||.||||.||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||..||    
Sbjct  220  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  293

Query  293  GTATCTATGGCAGCCACACTGTAGGC-CTC-TCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCT  364
            ||| |||   ||||||||.|     | ||| ||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  GTA-CTA---CAGCCACAAT-----CACTCATCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCT  358

Query  365  ACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGAC  438
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|
Sbjct  359  ACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTC  432

Query  439  TCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCA  512
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  433  TCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCA  506

Query  513  TTCCCATGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACA  586
            |||||||||||||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  507  TTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACA  580

Query  587  GGTGCTATGGTTATGACTCGCGCGCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCA  660
            |||||||||.||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  581  GGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCA  654

Query  661  GGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCGGGTCCTGTCGTGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCA  734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||..||||||.||||
Sbjct  655  GGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCA  728

Query  735  GTGTGGCTCTGATGCCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTACAAGGAGTGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTG  808
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  GTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTG  802

Query  809  GCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAG  882
            |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct  803  GTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAG  876

Query  883  TACACATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCAC  956
            ||||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  TACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCAC  950

Query  957  AGGACAGATCCGTGCCAGACCCTTCCTCTCCGTGCGGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCC  1030
            |||||||.||..||.||||||||..|||||.||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.||||||||||||
Sbjct  951  AGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCC  1024

Query 1031  TGCTGTGTCAGTCACAGGGAGGGATGCACACTTTCCTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGT  1104
            |||||||||||||||.|||...|.|.||||||||||||.||||||||||||||||||...||.||||.||||.|
Sbjct 1025  TGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCAT  1098

Query 1105  CTAAAATCAAAGCGCCAATCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGG  1178
            ||.|.||||.|||.||||.||||..||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1099  CTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGG  1172

Query 1179  GACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCG  1252
            |||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  GACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCG  1246

Query 1253  TGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGCCCACCAC-------AAAACA-AG------------TCCGACTCCA  1306
            |||||||||.|         .|||| ||.|||.|||       |..||| ||            ||||    ||
Sbjct 1247  TGGTCTCAGCA---------TCCCT-AGGCCAACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCG----CA  1306

Query 1307  AGG-----------------CTGGTGAG----------------------------------------------  1317
            .||                 |||||| |                                              
Sbjct 1307  TGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGGTG-GTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCT  1379

Query 1318  -------------------  1317
                               
Sbjct 1380  ACAAGATGCAGCCGGGAGG  1398