Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07729
- Subject:
- XM_017026190.1
- Aligned Length:
- 2003
- Identities:
- 1204
- Gaps:
- 688
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGACCTCCATCCTCACGGTCCT 23
||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT 74
Query 24 GATCTGTCTCGGGCTGAGCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCCCCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 97
||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 148
Query 98 CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAG 171
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||
Sbjct 149 CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG 222
Query 172 TACCATCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 245
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 296
Query 246 GTTCCCCATCCTATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTATCTATGGCAGCCACACTGTAGGCC 319
|||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||..||||||.|||.||||||.|||||
Sbjct 297 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC 370
Query 320 TCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCC 393
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 371 GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC 444
Query 394 AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 467
|||||.|||||||.|||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 518
Query 468 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCATGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCA 541
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA 592
Query 542 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGGTTATGACTCGCGCGCTCCC 615
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||..|.|||||
Sbjct 593 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 666
Query 616 TATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 689
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 740
Query 690 GCAGCCGGGTCCTGTCGTGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGGCTCTGATGCCGGCTACGACAGAT 763
||||||.||||||.||||||||||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 741 GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT 814
Query 764 TTGTTCTGTACAAGGAGTGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 837
||||||||||.|||||..|||.||||||||||||.||||.|.|||||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 888
Query 838 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC 911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC 962
Query 912 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCCGTGCCAGACCCTTCCTCT 985
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||.||||..||.|||||
Sbjct 963 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT 1036
Query 986 CCGTGCGGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGAGGGATGCAC 1059
|.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1037 CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA 1110
Query 1060 ACTTTCCTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAATCAAAGCGCCAATCTCATAAGTA 1133
|||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||...||||||||.|||||.|..|||||||||.||.||
Sbjct 1111 ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA 1184
Query 1134 CCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT 1207
|||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185 CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT 1258
Query 1208 CCAACCCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC 1281
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259 CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC 1332
Query 1282 -CCACCACAAAACAAGTCCGA-CTCCAAGGCTGG---TGAG--------------------------------- 1317
||.|.|| ||||.|.||.| |||||...|||| ||||
Sbjct 1333 TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCC 1404
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1405 CAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCT 1478
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1479 CCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATT 1552
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1553 TCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCC 1626
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1627 GATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCG 1700
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1701 GAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGG 1774
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1775 CCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATG 1848
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1849 GACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACG 1922
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1923 GGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCA 1996
Query 1318 ----- 1317
Sbjct 1997 TCCAC 2001