Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07730
- Subject:
- NM_001278398.2
- Aligned Length:
- 1919
- Identities:
- 1246
- Gaps:
- 538
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A 219
|||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||| |
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 220 CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA 293
||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT-- 294
Query 294 GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 357
||||| .|||.| |||| || ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 363
Query 358 TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT 431
||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 364 TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA 437
Query 432 CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC 505
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 438 CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC 511
Query 506 ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC 579
|..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 512 AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC 585
Query 580 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 586 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT 659
Query 654 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC 727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct 660 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC 733
Query 728 AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT 801
||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct 734 AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT 807
Query 802 GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA 875
||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 808 GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA 881
Query 876 GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCA 949
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 882 GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG 955
Query 950 CAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACC 1023
||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||.||||||.||.|||.|||||.|||||||||||
Sbjct 956 CAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACC 1029
Query 1024 CTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCA 1097
||||||||||||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||...||..||||..||.
Sbjct 1030 CTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCG 1103
Query 1098 TCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGG 1171
|||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1104 TCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGG 1177
Query 1172 GGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC 1245
||||||||||.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 GGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC 1251
Query 1246 GTGGTCTCAGCA-TCCCT-------AGGCCAACACCCCCA-------GGAT-TACACAGTGGAGAATCT----- 1298
|||||||||||| .|||| ||.||..|||||||| |||| ..||.||||| |||
Sbjct 1252 GTGGTCTCAGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGG----TCTGGGAA 1321
Query 1299 --CATCCGCATGGG---TGTGGCTGG---CTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC----------------- 1338
|| |.|||| ||||...|| ||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1322 GGCA----CCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTT 1391
Query 1339 ------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT----------- 1353
||| |..|| ||| ||||
Sbjct 1392 CCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTG 1465
Query 1354 --GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTACA----AGATGCAGCCGGG------------AGG 1398
|.|||| ||| |||||.||||| ||||.|| ||.|.|||||..| |||
Sbjct 1466 CAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGG 1537
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1538 AAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACAC 1611
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1612 GATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCC 1685
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1686 TTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGG 1759
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1760 CTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACT 1833
Query 1399 --------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1834 GAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1902
