Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07730
• Subject: XR_935716.2
• Aligned Length: 1724
• Identities: 1162
• Gaps: 438

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TCTTCCCTATTTCCCTGCATTTCTCTTCTGTGCTCACTGCCACACGCAGCTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGGTCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGAGGGACGACTGCCATGATGACAGCACCCCATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTG  222

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGACCCCC  9
                                                                             |||||||||
Sbjct  223  TCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCC  296

Query   10  ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA  83
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA  370

Query   84  GCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCC  157
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC  444

Query  158  TTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---ACAAGAGCCT  228
            ...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |||.||||.|
Sbjct  445  AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT  518

Query  229  GGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCAGTACTA---  299
            |.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||   |||||   
Sbjct  519  GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT---TACTATGG  589

Query  300  CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAA  366
            .|||.|    |||| ||      ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  590  TAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAA  659

Query  367  CCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTCTCACAGGT  440
            ||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  660  CCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGT  733

Query  441  GGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCATTCCCATG  514
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||
Sbjct  734  GGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATG  807

Query  515  CCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTAT  588
            |||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  808  CCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTAT  881

Query  589  GCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTC  662
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  882  GCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTC  955

Query  663  TAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTCT  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.||
Sbjct  956  TAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCT  1029

Query  737  CTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGTTGGCAG  810
            ||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||||....|||
Sbjct 1030  CTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAG  1103

Query  811  CCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATG  884
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATG  1177

Query  885  CTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGT  958
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||          
Sbjct 1178  CTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATC----------  1241

Query  959  TCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGT  1032
                                     ||||||||.||||||.||.|||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1242  -------------------------GCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGT  1290

Query 1033  CAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATC  1106
            |||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||...||..||||..||.|||.|||||
Sbjct 1291  CAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATC  1364

Query 1107  AGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACA  1180
            |..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1365  AACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACA  1438

Query 1181  GATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCA  1254
            |.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439  GGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCA  1512

Query 1255  GCATCC--CTAGG----CCAACACCCC--CAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGC  1320
            |.| ||  ||.||    |||.|.||||  ||       ||||    |...|.|.|||.|||        |||||
Sbjct 1513  GGA-CCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACA-------ACAG----GCCCCACCTCCACAT--------CTGGC  1566

Query 1321  TTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAG-----CACAGCCAGAGAAGCCTACAAGATGCA  1389
                 ||                         |||||..|||     |||..|||                   
Sbjct 1567  -----CC-------------------------TGAGGACCAGCCCCTCACCCCCA-------------------  1591

Query 1390  GCCGGGAGG-------------  1398
             |||||..|             
Sbjct 1592  -CCGGGTCGGATCCCCAGAGTG  1612