Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07746
• Subject: NM_019069.4
• Aligned Length: 1009
• Identities: 805
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCGACGGAGGAG--AAGAAGCCCGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCATCCGCCACT  72
            |||||.||..|||||  ||||              |.|||||.|||||||....|||..||.|||||.||||.|
Sbjct    1  ATGGCAACCAAGGAGTCAAGA--------------GACGCCAAAGCACAGTTGGCCCTCTCCTCATCGGCCAAT  60

Query   73  CAGAGCAAGCCTACA----CCTGTGAAGCCAAACTATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAG  142
            |||||||||    .|    ||||..||.||||||||||||||.||.|..||.||||..||.|||||..||||||
Sbjct   61  CAGAGCAAG----GAAGTGCCTGAAAACCCAAACTATGCTCTCAAATGTACTCTTGTGGGACACACGGAAGCAG  130

Query  143  TGTCCTCCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGG  216
            ||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||..||.||.|.|||||||
Sbjct  131  TGTCATCAGTTAAGTTTAGTCCTAATGGAGAATGGCTAGCAAGTTCTTCTGCTGATAGGCTAATCATAATTTGG  204

Query  217  GGCGCGTATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCTGGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTC  290
            ||.||.||||||||.||||.|||||||||..|.|.||||||.||..|||.||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  205  GGAGCATATGATGGAAAATATGAGAAAACACTCTATGGTCATAATTTGGAAATATCGGATGTTGCCTGGTCATC  278

Query  291  AGATTCTAACCTTCTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGGACGTGAGCTCGGGCAAGTGTC  364
            ||||||.|..|.|||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||.|||||.||.||.||.|||.
Sbjct  279  AGATTCCAGTCGTCTTGTTTCTGCCTCAGATGATAAAACTCTAAAATTATGGGATGTGAGATCTGGAAAATGTT  352

Query  365  TGAAAACCCTGAAGGGACACAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCC-CCAGTCCAACCTTATTGTCTC  437
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||| ||| |||||||||||..||||
Sbjct  353  TGAAAACACTGAAGGGGCACAGTAATTATGTCTTTTGTTGTAACTTCAATCCGCCA-TCCAACCTTATAATCTC  425

Query  438  AGGATCCTTTGACGAAAGCGTGAGGATATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCAGCTCACT  511
            .|||||.|||||.||.|..||.|..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct  426  GGGATCTTTTGATGAGACTGTAAAAATATGGGAGGTGAAAACAGGAAAGTGTCTCAAGACTTTGTCTGCTCATT  499

Query  512  CGGATCCAGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGTGATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCTGT  585
            |.||.|||||.||.||.||||||||||||.||..|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||
Sbjct  500  CTGACCCAGTTTCTGCTGTTCATTTTAATTGTAGTGGGTCCTTGATAGTGTCAGGTAGCTATGATGGCCTCTGT  573

Query  586  CGCATCTGGGACACCGCCTCGGGCCAGTGCCTGAAGACGCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGT  659
            .|.||||||||..|.||.||.||.|||||..|.||.||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  574  AGAATCTGGGATGCTGCATCAGGTCAGTGTTTAAAAACGCTCGTTGATGACGATAACCCTCCTGTCTCTTTTGT  647

Query  660  GAAGTTCTCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGGACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCA  733
            .||.||.||.||.||.||.||||||||.||..|.||.||..|||||||||||||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct  648  AAAATTTTCTCCAAATGGTAAATACATTCTCACTGCAACTTTGGACAACACTCTTAAACTATGGGATTATAGCA  721

Query  734  AGGGGAAGTGCCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGCATATTTGCCAATTTCTCTGTTACT  807
            ..||.|.|||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  722  GAGGCAGGTGCCTGAAAACATACACTGGTCATAAGAATGAGAAATATTGCATATTTGCCAATTTTTCAGTTACT  795

Query  808  GGTGGGAAGTGGATTGTGTCTGGCTCAGAGGATAACCTTGTTTACATCTGGAACCTTCAGACGAAAGAGATTGT  881
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  796  GGTGGAAAGTGGATTGTGTCTGGTTCCGAGGATAACCTGGTTTACATTTGGAACCTTCAGACTAAAGAGATTGT  869

Query  882  ACAGAAACTACAAGGCCACACAGATGTCGTGATCTCAACAGCTTGTCACCCAACAGAAAACATCATCGCCTCTG  955
            .||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.|
Sbjct  870  GCAGAAATTACAAGGCCATACAGATGTTGTGATCTCAGCAGCTTGTCATCCTACAGAAAACCTCATCGCATCAG  943

Query  956  CTGCGCTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGAAGAGTGACTGC  1002
            |.||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct  944  CAGCATTAGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGATGAGTAACCAC  990