Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07746
Subject:
NM_080848.2
Aligned Length:
1002
Identities:
878
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCGACGGAGGAGAAGAAGCCCGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCATCCGCCACTCA  74
            |||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGCCACAGAGGAGAAGAAGCCAGAGACAGAGGCTGCAAGAGCACAGCCCACTCCTTCCTCATCAGCCACACA  74

Query   75  GAGCAAGCCTACACCTGTGAAGCCAAACTATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAGTGTCCT  148
            |||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GAGCAAGCCCACACCAGTTAAGCCAAACTATGCCCTGAAGTTCACCCTGGCTGGCCACACCAAAGCTGTGTCCT  148

Query  149  CCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGGGGCGCG  222
            |.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  149  CTGTGAAGTTCAGCCCCAATGGGGAATGGTTGGCAAGTTCATCTGCTGATAAACTCATTAAAATTTGGGGAGCA  222

Query  223  TATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCTGGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTCAGATTC  296
            ||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  TATGATGGAAAGTTTGAGAAAACTATATCTGGTCACAAACTGGGAATATCTGATGTAGCGTGGTCATCAGATTC  296

Query  297  TAACCTTCTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGGACGTGAGCTCGGGCAAGTGTCTGAAAA  370
            ||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  297  TAACCTCCTTGTGTCTGCCTCTGATGATAAAACTTTGAAGATTTGGGACGTGAGTTCCGGGAAGTGTCTGAAGA  370

Query  371  CCCTGAAGGGACACAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCCCCAGTCCAACCTTATTGTCTCAGGATCC  444
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  371  CCCTGAAGGGCCACAGTAACTACGTCTTCTGCTGCAACTTCAACCCCCAGTCCAACCTCATCGTCTCAGGGTCT  444

Query  445  TTTGACGAAAGCGTGAGGATATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCAGCTCACTCGGATCC  518
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct  445  TTTGATGAAAGTGTGAGGATATGGGACGTGAAGACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCCTGCCCATTCGGACCC  518

Query  519  AGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGTGATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCTGTCGCATCT  592
            ||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  AGTCTCAGCCGTTCATTTCAACCGTGATGGATCATTGATTGTTTCCAGTAGCTATGATGGCCTCTGCCGAATCT  592

Query  593  GGGACACCGCCTCGGGCCAGTGCCTGAAGACGCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGTGAAGTTC  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  593  GGGACACCGCCTCTGGCCAGTGTCTGAAGACACTCATTGATGATGACAATCCTCCAGTGTCCTTCGTGAAGTTC  666

Query  667  TCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGGACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCAAGGGGAA  740
            ||.||.||.|||||||||||||||||.||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTCCAAATGGCAAATACATCCTGGCTGCAACTTTGGACAACACACTGAAGCTCTGGGACTACAGCAAGGGGAA  740

Query  741  GTGCCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGCATATTTGCCAATTTCTCTGTTACTGGTGGGA  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct  741  GTGCCTGAAGACATACACTGGCCACAAGAATGAGAAGTACTGCATATTTGCCAACTTCTCCGTGACAGGCGGGA  814

Query  815  AGTGGATTGTGTCTGGCTCAGAGGATAACCTTGTTTACATCTGGAACCTTCAGACGAAAGAGATTGTACAGAAA  888
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct  815  AGTGGATTGTGTCTGGTTCTGAAGATAACCTGGTGTATATCTGGAATCTGCAGACCAAGGAGATTGTGCAGAAG  888

Query  889  CTACAAGGCCACACAGATGTCGTGATCTCAACAGCTTGTCACCCAACAGAAAACATCATCGCCTCTGCTGCGCT  962
            .|.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|
Sbjct  889  TTGCAGGGTCACACAGATGTTGTGATTTCCACGGCTTGTCACCCGACAGAGAACATCATTGCCTCAGCAGCGTT  962

Query  963  AGAAAATGACAAAACAATTAAACTGTGGAAGAGTGACTGC  1002
            |||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGAACGACAAAACAATCAAACTGTGGAAGAGTGACTGC  1002