Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07792
• Subject: XM_011531576.3
• Aligned Length: 1779
• Identities: 1487
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTG  222
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTG  53

Query  223  GCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct   54  GCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTT------------------------------------------  85

Query  297  AAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAG  370
                                                                                      
Sbjct   86  --------------------------------------------------------------------------  85

Query  371  AAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTT  444
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  ------TACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTT  153

Query  445  TTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  154  TTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCT  227

Query  519  TCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  228  TCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTG  301

Query  593  GCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  302  GCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCA  375

Query  667  GTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  GTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTT  449

Query  741  ACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  ACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCA  523

Query  815  AAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  AAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGG  597

Query  889  ACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCG  671

Query  963  GAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  672  GAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGG  745

Query 1037  CAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  CAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTA  819

Query 1111  GATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  GATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGC  893

Query 1185  TGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  TGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCAT  967

Query 1259  ACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  ACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTT  1041

Query 1333  GTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  GTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTA  1115

Query 1407  TAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  TAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGT  1189

Query 1481  TAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  TAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCC  1263

Query 1555  ACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  ACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGG  1337

Query 1629  TCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338  TCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCG  1411

Query 1703  ATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412  ATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGGGGTCACAGTTATTGATAAACCA  1485

Query 1777  TTA  1779
            |||
Sbjct 1486  TTA  1488