Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07792
- Subject:
- XR_001741101.2
- Aligned Length:
- 3231
- Identities:
- 1778
- Gaps:
- 1452
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCGCGGGGGCCGCCGCCGCAGGTGGTGGCGCGCGGTGAGGAGAGCGCGGCGCCCCCTCCGGGGCGGATGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AACGCGGCTCGGCGGGCGGGCAGTGCCGGCGTCCGCGGCTGGAATGGTGCTGGCTGTGTTGGTCGGTGCCTGCG 148
Query 1 ------------------------ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCTGAAGCCCGAGAGGAGCCACAATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAA 222
Query 51 GCCTCTCGATTCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAG 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCTCTCGATTCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAG 296
Query 125 CTTTCAAAGTCATGAACGAATTAAGA------------------------------------------------ 150
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTTCAAAGTCATGAACGAATTAAGAAGACAATCTCACTCTGCCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGTGATCTC 370
Query 151 ------------------------------------------------------------------------AG 152
||
Sbjct 371 AGCTCACTGCAACCTCCGACTCCTGGGTTCAAGCGATTGTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAG 444
Query 153 TCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCG 226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCG 518
Query 227 CCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAA 592
Query 301 GAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAA 374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAA 666
Query 375 TGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGG 448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGG 740
Query 449 AATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTG 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTG 814
Query 523 AACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCAT 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCAT 888
Query 597 CGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAA 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAA 962
Query 671 TAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCT 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCT 1036
Query 745 TTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGA 818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGA 1110
Query 819 TTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCC 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCC 1184
Query 893 GGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGT 966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGT 1258
Query 967 GTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGGCAGG 1040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCAGAGTTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGGCAGG 1332
Query 1041 CATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATT 1114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATT 1406
Query 1115 CCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCT 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCT 1480
Query 1189 GTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAA 1262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAA 1554
Query 1263 CATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTG 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTG 1628
Query 1337 GAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAAT 1410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAAT 1702
Query 1411 GCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAA 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAA 1776
Query 1485 CAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCA 1850
Query 1559 CTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTG 1632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTG 1924
Query 1633 TTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAA 1706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAA 1998
Query 1707 ATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAG--------------------------- 1753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGCAGCCTGCTCAATGTGAAGAGACAAGGATG 2072
Query 1754 -------------------------------------GGGTCACAGTTATTGATAAACCATTA----------- 1779
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAGACCTTGATGATGATCCACTTCCCCTTAATGAATAGGGTCACAGTTATTGATAAACCATTATGAGCCTGAAG 2146
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2147 GACATTTTCAGCATATTTATACATGAGAAACAGCCTTCAACAAGTATTTGTGAAGTGACTGAGAATCTAGCACT 2220
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2221 TCTCCACTTGTAGCTGCACTTTAAGTCTCAGCAGAAGATACGATCGTCTGCCTTTATAGGCCTCAGATACTGAA 2294
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2295 GATTATTTTTGGTAGAAGCACCGTGTAGGCTTTTTCTGCAATGAGCAGCAGCTGACTGAATTTTCATAAGAAAC 2368
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2369 TTGGACTGCAGGACTTAATCTGTAGTCTTTAGACAACAGTTGCTTTCATAAAGACTAGTTCTTATCAACCTTGA 2442
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2443 ATGACTACAGATTATTTTGTGAAGGAGGATGAAGTAATGTGTGTTCTTGTAAAATTAAATTTTATCTTTATTTC 2516
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2517 TTCTAAAAATCTGTATACCAGGAACTGAAAATCTTTGAACAGATATTAAAATCTACGTAAGTATACAAACTAGT 2590
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2591 TGAGGGATACACTGTTTGCTTTTATAAAATAACTTTGATTACATGAATATAATAAATTATGTGCATATAAATGT 2664
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2665 GTGTCTATATGCTTTCCTTTAAATATGTTTGAAAAGATGTTTGAAACTTGATTATACTATTTATAATTGGCACA 2738
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2739 GTACTTTGAATTATGCCAGTACTACATTGTAAAACAGAGTTGTATTTTTTGATATTTAACAATGCTTAACACTT 2812
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2813 TAAATGCCACTTCTGAGGAATGGACCTGGTGTAACACACTTGAATATGTGTGATGCCAAACTTTTTAAAATACA 2886
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2887 ATATAAATTATGCTTATTTATTATTTTCTTTAGTTTAATCTTGGTCATGTTTTGGTGTGTATTTTTAATTTTTT 2960
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 2961 TCTTAAATTAACACTTTGGCATGAACATTACTGCAGGTTTTTGATGAATATAATGAATGTATGGAATTCAATTG 3034
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 3035 AATTTGCATGGTCTTCGGAATTTTTTCTGTGTGTATAAATTTAGCTGCTATTAACAGAAGAGAGAACTTTCTGT 3108
Query 1780 -------------------------------------------------------------------------- 1779
Sbjct 3109 GAGTAGCCATGTGTGTTGATCAGATACAGTTTTTCTGAGATCTTCAATTAATCTCACTTTAAAAATGACCAAAA 3182
Query 1780 ------------------------------------------------- 1779
Sbjct 3183 CATGTCTTTCTTGAATTAACTTTGAATAAAAGTTTGTATATTATTTGTT 3231