Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07792
• Subject: XR_001741102.1
• Aligned Length: 2654
• Identities: 1778
• Gaps: 875

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGCGGATGGAACGCGGCTCGGCGGGCGGGCAGTGCCGGCGTCCGCGGCTGGAATGGTGCTGGCTGTGTTGGTCG  74

Query    1  ---------------------------------ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGG  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGCCTGCGTTCTGAAGCCCGAGAGGAGCCACAATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGG  148

Query   42  TCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATA  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAATACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATA  222

Query  116  TGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAAGAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAA  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAAGAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAA  296

Query  190  GACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTGGCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGA  370

Query  264  GATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATT  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAATAAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATT  444

Query  338  ATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGAAGAAAATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAG  518

Query  412  TTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCG  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTACAGGATGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCG  592

Query  486  GGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAG  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCTTTTGCTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAG  666

Query  560  ATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTT  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGTTGTACTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTT  740

Query  634  ACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCATTTCTTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGA  814

Query  708  GTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTTATGGCCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAG  888

Query  782  AGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCA  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAAGCATTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCA  962

Query  856  ACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGT  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGAGCAGCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGT  1036

Query  930  GGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGGTTGGGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACC  1110

Query 1004  AAGTAGCAGAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGT  1077
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGTAGCAGAGTTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGT  1184

Query 1078  GGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGC  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTTTAATGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGC  1258

Query 1152  TAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTG  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAACATGAGAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTG  1332

Query 1226  ATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATG  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGGAGTACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATG  1406

Query 1300  AATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGC  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AATACAAGGAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGC  1480

Query 1374  ATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGA  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCACGTCAGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGA  1554

Query 1448  GCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCT  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCACCAGGCGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCT  1628

Query 1522  TTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTG  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTAGTACGAAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTG  1702

Query 1596  CAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACT  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGAAGAAATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACT  1776

Query 1670  TGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGA  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGGCGTCAGTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGA  1850

Query 1744  AGTTATGCAG----------------------------------------------------------------  1753
            ||||||||||                                                                
Sbjct 1851  AGTTATGCAGCCTGCTCAATGTGAAGAGACAAGGATGAAGACCTTGATGATGATCCACTTCCCCTTAATGAATA  1924

Query 1754  GGGTCACAGTTATTGATAAACCATTA------------------------------------------------  1779
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 1925  GGGTCACAGTTATTGATAAACCATTATGAGCCTGAAGGACATTTTCAGCATATTTATACATGAGAAACAGCCTT  1998

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 1999  CAACAAGTATTTGTGAAGTGACTGAGAATCTAGCACTTCTCCACTTGTAGCTGCACTTTAAGTCTCAGCAGAAG  2072

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2073  ATACGATCGTCTGCCTTTATAGGCCTCAGATACTGAAGATTATTTTTGGTAGAAGCACCGTGTAGGCTTTTTCT  2146

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2147  GCAATGAGCAGCAGCTGACTGAATTTTCATAAGAAACTTGGACTGCAGGACTTAATCTGTAGTCTTTAGACAAC  2220

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2221  AGTTGCTTTCATAAAGACTAGTTCTTATCAACCTTGAATGACTACAGATTATTTTGTGAAGGAGGATGAAGTAA  2294

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2295  TGTGTGTTCTTGTAAAATTAAATTTTATCTTTATTTCTTCTAAAAATCTGTATACCAGGAACTGAAAATCTTTG  2368

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2369  AACAGATATTAAAATCTACGTAAGTATACAAACTAGTTGAGGGATACACTGTTTGCTTTTATAAAATAACTTTG  2442

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2443  ATTACATGAATATAATAAATTATGTGCATATAAATGTGTGTCTATATGCTTTCCTTTAAATATGTTTGAAAAGA  2516

Query 1780  --------------------------------------------------------------------------  1779
                                                                                      
Sbjct 2517  TGTTTGAAACTTGATTATACTATTTATAATTGGCACAGTACTTTGAATTATGCCAGTACTACATTGTAAAACAG  2590

Query 1780  ----------------------------------------------------------------  1779
                                                                            
Sbjct 2591  AGTTGTATTTTTTGATATTTAACAATGCTTAACACTTTAAATGCCACTTCTGAGGAATGGACCT  2654