Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07819
• Subject: XM_017015945.2
• Aligned Length: 1176
• Identities: 974
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGTCTACGCGGGAGTCCTTTAACCCGGAAAGTTACGAATTGGACAAAAGCTTCCGGCTAACCAGATTCACTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTGAAGGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTGCAAAAATTGCTGGAATCTTTACAGGAGAACCACT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCCGTTATGCCAAGGCTTGGCATTGGAATGGATACTTGTGTCATTCCT  222
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGGATACTTGTGTCATTCCT  21

Query  223  TTGAGGCACGGTGGGCTTTCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  TTGAGGCACGGTGGGCTTTCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGAT  95

Query  297  GGGCAGGATAGCGTGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGACAATATGCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  GGGCAGGATAGCGTGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGACAATATGCTGA  169

Query  371  TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTGATGCCTCTGATTATCCAAGGTTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  TGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTGATGCCTCTGATTATCCAAGGTTTT  243

Query  445  AAAGACGCAGCTGAGGAAGCAGGAACGTCTGTAACAGGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  AAAGACGCAGCTGAGGAAGCAGGAACATCTGTAACAGGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGG  317

Query  519  AGGAGTGGCTACCACTGTCTGCCAACCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  AGGAGTGGCTACCACTGTCTGCCAACCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGG  391

Query  593  TGCTGACAAAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATCCCTGAGAAATGGAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TGCTGACAAAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATCCCTGAGAAATGGAAT  465

Query  667  AAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCGATGATGAACATGGCGAGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  AAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCGATGATGAACATGGCGAGGCT  539

Query  741  CAACAGGACAGCTGCAGGACTCATGCACACGTTCAATGCCCACGCCGCCACTGACATCACGGGCTTCGGGATTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CAACAGGACAGCTGCAGGACTCATGCACACGTTCAATGCCCACGCCGCCACTGACATCACGGGCTTCGGGATTT  613

Query  815  TGGGCCATGCGCAGAACCTGGCCAAGCAGCAGAGGAACGAGGTGTCGTTTGTAATTCACAACCTCCCGGTGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  TGGGCCATGCGCAGAACCTGGCCAAGCAGCAGAGGAACGAGGTGTCGTTTGTAATTCACAACCTCCCGGTGCTG  687

Query  889  GCCAAGATGGCTGCGGTGAGCAAGGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTCATGCACGGGACCTGCCCGGAGACTTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  GCCAAGATGGCTGCGGTGAGCAAGGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTCATGCACGGGACCTGCCCGGAGACTTC  761

Query  963  AGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATAAAGTCCCCCAAATATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  AGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCAGCTCGGTTCTGTGCAGAGATAAAGTCCCCCAAATATG  835

Query 1037  GTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGAATCATAGACAAACCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  GTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGCAACCGCACAGCCAGAATCATAGACAAACCC  909

Query 1111  CGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCCACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  CGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCCACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT  975