Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07836
- Subject:
- XM_017317988.1
- Aligned Length:
- 2402
- Identities:
- 1916
- Gaps:
- 253
Alignment
Query 1 ATG-------GGGCTCCCAG-CGCT--------CGAGTTCAGCGACTGCTGC-----------CTCGATAG--- 44
||| ||.||.|||| .||| |.||...|||.|||||.|| |..|||||
Sbjct 1 ATGTCTCACAGGTCTTCCAGAGGCTTCCAGAGGCCAGAGAAGCCACTGCAGCATGAGTTACTTCAAGATAGCTG 74
Query 45 ------TCC-------GCACTTC-CGAGAGAC----------GCTCAAGTCG----------CACGAAG----- 79
||| ||.|||| |..||||| ||| ||| || ||| ||
Sbjct 75 GGAGCCTCCACTGGCTGCTCTTCTCTTGAGACCACAGGAAATGCT-AAG-CGGGATGCTTGACAC--AGTTGGT 144
Query 80 ------CAGAGCTGGACAAGACC--------------------AACAAATTCAT---CAAGGA------GCTCA 118
||| |||..|.|||.|| ||.|||||..| ||||.| .||||
Sbjct 145 CACTCCCAG-GCTCCAAAAGTCCTGACTTCCCATCTCACACAGAAGAAATTGGTTTACAAGAACATTACTCTCA 217
Query 119 ------TCAAGGACGGGAAGTCACTCATAAGCG---------CGCT------CAAGAATTTGTCTTCAGCGAAG 171
||| |.|||| .||||| .||| ||.|.||||||||||.||.|||
Sbjct 218 CCTACTTCA-----GAGAAG-------AAAGCGGGTATTTTTGGCTAAGGTACATGGATTTGTCTTCGGCAAAG 279
Query 172 CGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGATGATGAGATGTG 245
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 280 CGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGTATAGGAGATGCCGAAACAGATGATGAGATGTG 353
Query 246 TATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATACGGATGATTGAGA 319
||||||.||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||.||||..||.|||||.||||
Sbjct 354 TATAGCGAGATCTTTGCAAGAATTTGCTGCTGTTCTCAGGAATCTTGAAGACGAGCGGAGTCGAATGATCGAGA 427
Query 320 ATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAA 393
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||.||||||||||
Sbjct 428 ATGCCAGCGAGGTGCTCATCACACCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAGCAGATTGGGGCCGCCAGGGAAGCCAAA 501
Query 394 AAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAA 467
||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 AAGAAGTATGACAAAGAGACCGAGAAGTACTGCGGCACCTTAGAAAAACATTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAA 575
Query 468 AGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAGTATCCCTGGAAT 541
.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 576 GGAATCCCAGCTACAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTTCGGCAACATTTCTACGAAGTATCCCTGGAGT 649
Query 542 ATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAA 615
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 ATGTCTTTAAGGTGCAGGAAGTGCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTAGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAA 723
Query 616 GGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGACACAGTTAACCAT 689
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 724 GGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTATGAGCTGGCCAAGGATTTTGGTGACTTTAAGACACAGTTGACCAT 797
Query 690 TAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGAAAAAGATGAAGG 763
.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 798 CAGCATACAAAATACAAGAAACCGCTTTGAAGGAACCAGGTCTGAGGTGGAATCGCTGATGAAGAAGATGAAGG 871
Query 764 AGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAGGAGAAACGTCAC 837
|.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 872 AAAACCCCCTGGAGCACAAGACCATCAGCCCGTACACCATGGAAGGGTACCTGTACGTGCAGGAGAAGCGTCAC 945
Query 838 TTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTACCATTTGA 911
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 946 TTTGGAACTTCCTGGGTGAAGCACTACTGTACCTACCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTTCCATTCGA 1019
Query 912 CCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGCGGAAAACAGACT 985
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1020 CCAAAAGTCAGGAGGAAAGGGGGGAGAAGACGAGTCCGTTACCCTCAAATCCTGCACACGGCGAAAGACAGACT 1093
Query 986 CCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAAGCTTTGTCG 1059
||||.||||||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1094 CCATCGAGAAGCGATTCTGCTTTGACGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAGGCGTTGTCG 1167
Query 1060 GAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAACAAAGACAGCCA 1133
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 1168 GAAGAGGACCGTAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTGTACAACTCCAACAGAGACAGCCA 1241
Query 1134 GAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATGCTGTGGAAACCA 1207
|||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1242 GAGCGAAGGGACCGCACAATTGGACAGTATCGGCTTCAGCATAATAAGGAAATGCATCCATGCGGTGGAGACCA 1315
Query 1208 GAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTG 1281
||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1316 GAGGGATCAATGAGCAGGGGCTCTACCGAATCGTGGGGGTCAACTCCAGGGTGCAGAAGTTGCTGAGCGTCCTG 1389
Query 1282 ATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGACCATCACTAGTGC 1355
|||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1390 ATGGACCCCAAAGCAGCTTCTGAGACAGAAACTGATATCTGTGCCGAATGGGAGATAAAGACCGTCACCAGTGC 1463
Query 1356 TCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAG 1429
|||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 TCTGAAGACCTACCTGAGAATGCTCCCAGGACCCCTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAG 1537
Query 1430 CAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGG 1503
||||.|||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1538 CAAAGCTGGAAAACCAAGAGACTCGAGTGTCTGAGATCCACAGTCTTGTCCATCGGCTCCCGGAGAAGAATCGG 1611
Query 1504 CAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTTGATGACGGTGGC 1577
||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1612 CAGATGTTGCAGCTGCTCATGAACCACCTGGCCAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATCTGATGACTGTGGC 1685
Query 1578 AAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCATCATGGACATCA 1651
||||||.||.|||||||||||||||||..||||..||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1686 AAACCTGGGCGTGGTGTTTGGACCCACCTTGCTTCGGCCTCAGGAAGAAACTGTGGCGGCCATCATGGACATCA 1759
Query 1652 AATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTGCCCGATATGCCT 1725
|.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||.||||.
Sbjct 1760 AGTTTCAGAACATTGTCATCGAGATCTTAATCGAGAACCATGAGAAGATATTCAACACGGTGCCTGATGTGCCC 1833
Query 1726 CTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCC 1799
||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1834 CTCACCAACGCCCAGCTACACCTGTCCCGGAAGAAAAGCAGTGACTCCAAGCCCCCATCCTGCAGCAAGAGGCC 1907
Query 1800 CCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCAACTCCAGTTTGG 1873
|||||||||||||||..|.||.|..||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 CCTGACGCTCTTCCATGCTGTGCCATCCACAGAAAAACAGGAGCAGAGGAACAGCATCATCAACTCCAGTTTGG 1981
Query 1874 AATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATGAACTCCAGTGAC 1947
||||.|||||.||.|.|.||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||..||||.|||||.|||
Sbjct 1982 AATCGGTCTCCTCGAGTGCAAACAGCATCCTTAACTCTAGCAGCAGCCTGCAGCCCAATCTGAATTCCAGCGAC 2055
Query 1948 CCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAACTTCACCCCTCTC 2021
.||.||||||.||||||||||||.|..|||||||..|||||
Sbjct 2056 TCAAACCTGGATGTGGTCAAACCTAGTCGGCCCAGTTCACT--------------------------------- 2096
Query 2022 GCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCGACTCATCCCCCG 2095
Sbjct 2097 -------------------------------------------------------------------------- 2096
Query 2096 TCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACA 2169
||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||
Sbjct 2097 ----CACACCATTCCGGAAGGCAAAGGCTTTGTACGCCTGCCAAGCTGAGCACGACTCGGAGCTCTCCTTCACA 2166
Query 2170 GCAGGCACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGAC 2243
||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2167 GCGGGCACCGTCTTCGATAATGTTCATCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAATGGAAAGAC 2240
Query 2244 TGGCCTCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCCTC 2277
||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2241 TGGCCTCATCCCAGAGAACTACGTGGAATTCCTC 2274