Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07836
- Subject:
- XM_017317989.1
- Aligned Length:
- 2323
- Identities:
- 1886
- Gaps:
- 209
Alignment
Query 1 ATG------GGG--------------------CTCCCAGCGCTCGAGTTCAGCGACTGCTGCCTCGATAGTCCG 48
||| ||| ||||||| |||| |.|.|||||.
Sbjct 1 ATGCTAAGCGGGATGCTTGACACAGTTGGTCACTCCCAG-GCTC--------------------CAAAAGTCCT 53
Query 49 CACTTCCGAGAGACGCTCAAGTCGCACGAAGCAGA----GCTGGACAAGA---------CCAACAAATTCATCA 109
.||||||.| ||.|||..||.||| |.|..|||||| .||.|.|.||||
Sbjct 54 GACTTCCCA------------TCTCACACAGAAGAAATTGGTTTACAAGAACATTACTCTCACCTACTTCA--- 112
Query 110 AGGAGCTCATCAAGGA--CGGGAA-----GTCACTCATAAGCGCGCTCAAGAATTTGTCTTCAGCGAAGCGGAA 176
||| |||.| ||||.| |.| |||| |..||.|.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 113 --GAG------AAGAAAGCGGGTATTTTTGGC-----TAAG---GTACATGGATTTGTCTTCGGCAAAGCGGAA 170
Query 177 GTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGATGATGAGATGTGTATAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 GTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGTATAGGAGATGCCGAAACAGATGATGAGATGTGTATAG 244
Query 251 CAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATACGGATGATTGAGAATGCC 324
|.||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||.||||..||.|||||.|||||||||
Sbjct 245 CGAGATCTTTGCAAGAATTTGCTGCTGTTCTCAGGAATCTTGAAGACGAGCGGAGTCGAATGATCGAGAATGCC 318
Query 325 AGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCCAAGGAAGCCAAAAAGAA 398
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 319 AGCGAGGTGCTCATCACACCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAGCAGATTGGGGCCGCCAGGGAAGCCAAAAAGAA 392
Query 399 GTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAAGAAT 472
|||||||||||||||.||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 393 GTATGACAAAGAGACCGAGAAGTACTGCGGCACCTTAGAAAAACATTTGAATTTGTCTTCCAAAAAGAAGGAAT 466
Query 473 CTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAGTATCCCTGGAATATGTC 546
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 467 CCCAGCTACAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTTCGGCAACATTTCTACGAAGTATCCCTGGAGTATGTC 540
Query 547 TTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACT 620
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTTAAGGTGCAGGAAGTGCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTAGAGCCTCTGCTGGCCTTCCTGCAAGGACT 614
Query 621 CTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGACACAGTTAACCATTAGCA 694
||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 615 CTTCACTTTCTATCACCATGGTTATGAGCTGGCCAAGGATTTTGGTGACTTTAAGACACAGTTGACCATCAGCA 688
Query 695 TACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGAAAAAGATGAAGGAGAAT 768
||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 689 TACAAAATACAAGAAACCGCTTTGAAGGAACCAGGTCTGAGGTGGAATCGCTGATGAAGAAGATGAAGGAAAAC 762
Query 769 CCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAGGAGAAACGTCACTTTGG 842
|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 763 CCCCTGGAGCACAAGACCATCAGCCCGTACACCATGGAAGGGTACCTGTACGTGCAGGAGAAGCGTCACTTTGG 836
Query 843 AACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTACCATTTGACCAAA 916
||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 837 AACTTCCTGGGTGAAGCACTACTGTACCTACCAACGGGATTCCAAACAAATCACCATGGTTCCATTCGACCAAA 910
Query 917 AGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGCGGAAAACAGACTCCATT 990
|||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 911 AGTCAGGAGGAAAGGGGGGAGAAGACGAGTCCGTTACCCTCAAATCCTGCACACGGCGAAAGACAGACTCCATC 984
Query 991 GAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAAGCTTTGTCGGAAGA 1064
||||||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 985 GAGAAGCGATTCTGCTTTGACGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATGCAGGCGTTGTCGGAAGA 1058
Query 1065 GGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAACAAAGACAGCCAGAGTG 1138
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||.|
Sbjct 1059 GGACCGTAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTGTACAACTCCAACAGAGACAGCCAGAGCG 1132
Query 1139 AAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATGCTGTGGAAACCAGAGGG 1212
|||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1133 AAGGGACCGCACAATTGGACAGTATCGGCTTCAGCATAATAAGGAAATGCATCCATGCGGTGGAGACCAGAGGG 1206
Query 1213 ATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTGCTGAGTGTCCTGATGGA 1286
|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1207 ATCAATGAGCAGGGGCTCTACCGAATCGTGGGGGTCAACTCCAGGGTGCAGAAGTTGCTGAGCGTCCTGATGGA 1280
Query 1287 CCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGACCATCACTAGTGCTCTGA 1360
||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1281 CCCCAAAGCAGCTTCTGAGACAGAAACTGATATCTGTGCCGAATGGGAGATAAAGACCGTCACCAGTGCTCTGA 1354
Query 1361 AGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAA 1434
||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1355 AGACCTACCTGAGAATGCTCCCAGGACCCCTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTTTCATCAAAGCAGCAAAG 1428
Query 1435 CTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCAGAGAAAAATCGGCAGAT 1508
|||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1429 CTGGAAAACCAAGAGACTCGAGTGTCTGAGATCCACAGTCTTGTCCATCGGCTCCCGGAGAAGAATCGGCAGAT 1502
Query 1509 GTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTTGATGACGGTGGCAAACC 1582
|||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1503 GTTGCAGCTGCTCATGAACCACCTGGCCAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATCTGATGACTGTGGCAAACC 1576
Query 1583 TTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCATCATGGACATCAAATTT 1656
|.||.|||||||||||||||||..||||..||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1577 TGGGCGTGGTGTTTGGACCCACCTTGCTTCGGCCTCAGGAAGAAACTGTGGCGGCCATCATGGACATCAAGTTT 1650
Query 1657 CAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTGCCCGATATGCCTCTCAC 1730
||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1651 CAGAACATTGTCATCGAGATCTTAATCGAGAACCATGAGAAGATATTCAACACGGTGCCTGATGTGCCCCTCAC 1724
Query 1731 CAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTGCAGCGAGAGGCCCCTGA 1804
|||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1725 CAACGCCCAGCTACACCTGTCCCGGAAGAAAAGCAGTGACTCCAAGCCCCCATCCTGCAGCAAGAGGCCCCTGA 1798
Query 1805 CGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCT 1878
||||||||||..|.||.|..||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1799 CGCTCTTCCATGCTGTGCCATCCACAGAAAAACAGGAGCAGAGGAACAGCATCATCAACTCCAGTTTGGAATCG 1872
Query 1879 GTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATGAACTCCAGTGACCCAGA 1952
|||||.||.|.|.||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||..||||.|||||.|||.||.|
Sbjct 1873 GTCTCCTCGAGTGCAAACAGCATCCTTAACTCTAGCAGCAGCCTGCAGCCCAATCTGAATTCCAGCGACTCAAA 1946
Query 1953 CCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAACTTCACCCCTCTCGCCAT 2026
|||||.||||||||||||.|..|||||||..|||||
Sbjct 1947 CCTGGATGTGGTCAAACCTAGTCGGCCCAGTTCACT-------------------------------------- 1982
Query 2027 CTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCGACTCATCCCCCGTCAGC 2100
|
Sbjct 1983 -------------------------------------------------------------------------C 1983
Query 2101 ACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGG 2174
|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1984 ACACCATTCCGGAAGGCAAAGGCTTTGTACGCCTGCCAAGCTGAGCACGACTCGGAGCTCTCCTTCACAGCGGG 2057
Query 2175 CACGGTCTTCGATAATGTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCC 2248
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2058 CACCGTCTTCGATAATGTTCATCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAATGGAAAGACTGGCC 2131
Query 2249 TCATCCCTGAGAATTACGTGGAGTTCCTC 2277
|||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 2132 TCATCCCAGAGAACTACGTGGAATTCCTC 2160