Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07836
• Subject: XR_944313.3
• Aligned Length: 3216
• Identities: 2199
• Gaps: 977

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGG-  5
                                                                                .|||| 
Sbjct    1  CTTTTGCGTTCAGGGATGGTCGGGAGGTGACCCAGCGCGGGTGGTGCTCTGGGGCAGCGCGGGTGGGCGTGGGC  74

Query    6  --GC--------------TCCCAGC------GCTCGAGTTC--AGCG-ACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTC  54
              ||              |||||||      ||..||||.|  |||| .|.||.|||     ||...|||..||
Sbjct   75  GTGCGCGGCACGCAGGTGTCCCAGCAGTGGGGCCAGAGTGCCGAGCGCGCCGCAGCC-----AGCGGGCAGATC  143

Query   55  CGA--GAGAC----GCTCAAGTCGCAC---GAAGCAGAGCTGGACA--------AGACCAAC-----AAATTCA  106
            |.|  |.|.|    ||||.|| |.|.|   |..||||||.||..||        .|.|||||     .|||   
Sbjct  144  CCATCGTGTCCACAGCTCCAG-CTCCCTTAGGGGCAGAGTTGCTCAGCCTTGAGTGCCCAACCGTGAGAAT---  213

Query  107  TCAAGGAGCTCATCAAG---------GACGGGAAGTCACTCATAAGCGC--GCTC----------AAGAATTTG  159
                |||||       |         ||.|||             ||||  .|||          ||| |||||
Sbjct  214  ----GGAGC-------GTGCCCTGCCGAGGGG-------------GCGCTGCCTCCCCTTGGGAAAAG-ATTTG  262

Query  160  TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA  336

Query  234  TGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC  307
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  TGATGAGATGTGTATAGCAAGATCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC  410

Query  308  GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC  484

Query  382  AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC  558

Query  456  TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG  632

Query  530  TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG  706

Query  604  GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC  780

Query  678  ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA  854

Query  752  AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG  928

Query  826  GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT  1002

Query  900  GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC  1076

Query  974  GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG  1150

Query 1048  CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA  1224

Query 1122  CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG  1298

Query 1196  CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG  1269
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGTGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG  1372

Query 1270  CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC  1343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC  1446

Query 1344  CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT  1520

Query 1418  TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA  1594

Query 1492  GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT  1565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595  GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT  1668

Query 1566  GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA  1639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669  GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA  1742

Query 1640  TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG  1713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743  TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG  1816

Query 1714  CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG  1787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817  CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG  1890

Query 1788  CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA  1861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891  CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA  1964

Query 1862  ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG  1935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965  ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG  2038

Query 1936  AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC  2009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039  AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC  2112

Query 2010  TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG  2083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113  TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG  2186

Query 2084  ACTCATCCCCCGT-------------------------------------------------------------  2096
            |||||||||||||                                                             
Sbjct 2187  ACTCATCCCCCGTCAGGTCTGTTGCAGGGTTTGTTTGGTTTTCTGTTGCTGCCGTTGTTCTCTCATTGGCTCGG  2260

Query 2097  --------------------------------------------------------------------------  2096
                                                                                      
Sbjct 2261  TCCTCTCTTCATGCAGTGTTCAGCCTCCTCGTCAACTTTGTTCCCTGCCATCCAAACCTGCACTTGCTTTTTGA  2334

Query 2097  ------------------------------CAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAG  2140
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335  CAGGCCAGAAGAAGCGGTACATGAAGACTCCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAG  2408

Query 2141  CTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATA--------------------------  2188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 2409  CTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAACGCAGAGTGTCCTTCAGCTTCCACA  2482

Query 2189  ---ATGTTCAC--CCA-------------------------TCTCAGGAGCCTGG---------CTGG------  2217
               ||.|||||  |||                         |||||    |||||         ||||      
Sbjct 2483  GCCATCTTCACTGCCACACCGAAGCTCCGGGCACCTCCACCTCTCA----CCTGGGCACTTCCACTGGCCGCCT  2552

Query 2218  -----------------------TTG-------------------------------GAGGGGACTCTG---AA  2234
                                   |||                               |||.|..||.||   ||
Sbjct 2553  GACACATCTTCTCACATCTGCTCTTGCTGCCATAACCCCCTCTTTACAGAGCAGCGAGAGTGATCTTTGAAAAA  2626

Query 2235  CGGAAA----------------GACTGGCCT--CAT--CCCTGAGAATTACGT----GG-------------AG  2271
            ||||||                .|.||||||  |||  |.|||||||||||.|    ||             ||
Sbjct 2627  CGGAAATGGCATTAAAGCCCTTCAGTGGCCTCCCATTGCTCTGAGAATTACTTACAAGGCCCTCCAGGGCCCAG  2700

Query 2272  TTCCTC--------------------------------------------------------------------  2277
            |||||.                                                                    
Sbjct 2701  TTCCTGCCCCTCTGACCTCACGCCCTCACTTGACATACTACAGCCTCATGCCTTCTTCATGTTCTCAAGCAAGG  2774

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2775  TCGGCAAACTATGACCTGCCCGTCAAATCCAACCTGCCACCTGTCACCTAACAATTCTGTAACTGCTCCCACAT  2848

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2849  ACAACATGGTCGTCATCATAAATCCTATAGGTATTGTTGAGAGCAGGAGGAAAGTTTGGTTGAGTGAGTGAGAG  2922

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2923  ACCTTACCCAAGCCTTCCTGTGGTCTCTAGGAGTCATGGCAGAGTTCGCTGACACTGGTCTGCTTTTAACCAGC  2996

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2997  CTTGCCAGTGACCTTTCAAATTCCCTGAGGAGCAAAAGGCCAAATTGAACCTGAAAGAAAACACCTCTCAGTGT  3070

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 3071  TGACTGAGTTGCAGTAGAAAATGGACCTGACAAAACTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACT  3144

Query 2278  ----------------------------------  2277
                                              
Sbjct 3145  CTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAATT  3178