Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07836
• Subject: XR_944317.3
• Aligned Length: 3080
• Identities: 2199
• Gaps: 841

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGGG-  5
                                                                                .|||| 
Sbjct    1  CTTTTGCGTTCAGGGATGGTCGGGAGGTGACCCAGCGCGGGTGGTGCTCTGGGGCAGCGCGGGTGGGCGTGGGC  74

Query    6  --GC--------------TCCCAGC------GCTCGAGTTC--AGCG-ACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTC  54
              ||              |||||||      ||..||||.|  |||| .|.||.|||     ||...|||..||
Sbjct   75  GTGCGCGGCACGCAGGTGTCCCAGCAGTGGGGCCAGAGTGCCGAGCGCGCCGCAGCC-----AGCGGGCAGATC  143

Query   55  CGA--GAGAC----GCTCAAGTCGCAC---GAAGCAGAGCTGGACA--------AGACCAAC-----AAATTCA  106
            |.|  |.|.|    ||||.|| |.|.|   |..||||||.||..||        .|.|||||     .|||   
Sbjct  144  CCATCGTGTCCACAGCTCCAG-CTCCCTTAGGGGCAGAGTTGCTCAGCCTTGAGTGCCCAACCGTGAGAAT---  213

Query  107  TCAAGGAGCTCATCAAG---------GACGGGAAGTCACTCATAAGCGC--GCTC----------AAGAATTTG  159
                |||||       |         ||.|||             ||||  .|||          ||| |||||
Sbjct  214  ----GGAGC-------GTGCCCTGCCGAGGGG-------------GCGCTGCCTCCCCTTGGGAAAAG-ATTTG  262

Query  160  TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  263  TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA  336

Query  234  TGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC  307
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  337  TGATGAGATGTGTATAGCAAGATCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC  410

Query  308  GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC  484

Query  382  AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC  558

Query  456  TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG  632

Query  530  TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG  706

Query  604  GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC  780

Query  678  ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA  854

Query  752  AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG  928

Query  826  GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT  1002

Query  900  GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC  1076

Query  974  GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG  1150

Query 1048  CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA  1224

Query 1122  CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG  1298

Query 1196  CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG  1269
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGTGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG  1372

Query 1270  CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC  1343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC  1446

Query 1344  CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT  1520

Query 1418  TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA  1594

Query 1492  GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT  1565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595  GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT  1668

Query 1566  GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA  1639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669  GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA  1742

Query 1640  TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG  1713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743  TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG  1816

Query 1714  CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG  1787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817  CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG  1890

Query 1788  CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA  1861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891  CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA  1964

Query 1862  ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG  1935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965  ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG  2038

Query 1936  AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC  2009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039  AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC  2112

Query 2010  TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG  2083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113  TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG  2186

Query 2084  ACTCATCCCCCGT------------------------------CAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTG  2127
            |||||||||||||                              |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187  ACTCATCCCCCGTCAGGCCAGAAGAAGCGGTACATGAAGACTCCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTG  2260

Query 2128  TATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATA-------------  2188
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 2261  TATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAACTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAACGCAGAGTGTCC  2334

Query 2189  ----------------ATGTTCAC--CCA-------------------------TCTCAGGAGCCTGG------  2213
                            ||.|||||  |||                         |||||    |||||      
Sbjct 2335  TTCAGCTTCCACAGCCATCTTCACTGCCACACCGAAGCTCCGGGCACCTCCACCTCTCA----CCTGGGCACTT  2404

Query 2214  ---CTGG-----------------------------TTG-------------------------------GAGG  2224
               ||||                             |||                               |||.
Sbjct 2405  CCACTGGCCGCCTGACACATCTTCTCACATCTGCTCTTGCTGCCATAACCCCCTCTTTACAGAGCAGCGAGAGT  2478

Query 2225  GGACTCTG---AACGGAAA----------------GACTGGCCT--CAT--CCCTGAGAATTACGT----GG--  2269
            |..||.||   ||||||||                .|.||||||  |||  |.|||||||||||.|    ||  
Sbjct 2479  GATCTTTGAAAAACGGAAATGGCATTAAAGCCCTTCAGTGGCCTCCCATTGCTCTGAGAATTACTTACAAGGCC  2552

Query 2270  -----------AGTTCCTC-------------------------------------------------------  2277
                       |||||||.                                                       
Sbjct 2553  CTCCAGGGCCCAGTTCCTGCCCCTCTGACCTCACGCCCTCACTTGACATACTACAGCCTCATGCCTTCTTCATG  2626

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2627  TTCTCAAGCAAGGTCGGCAAACTATGACCTGCCCGTCAAATCCAACCTGCCACCTGTCACCTAACAATTCTGTA  2700

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2701  ACTGCTCCCACATACAACATGGTCGTCATCATAAATCCTATAGGTATTGTTGAGAGCAGGAGGAAAGTTTGGTT  2774

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2775  GAGTGAGTGAGAGACCTTACCCAAGCCTTCCTGTGGTCTCTAGGAGTCATGGCAGAGTTCGCTGACACTGGTCT  2848

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2849  GCTTTTAACCAGCCTTGCCAGTGACCTTTCAAATTCCCTGAGGAGCAAAAGGCCAAATTGAACCTGAAAGAAAA  2922

Query 2278  --------------------------------------------------------------------------  2277
                                                                                      
Sbjct 2923  CACCTCTCAGTGTTGACTGAGTTGCAGTAGAAAATGGACCTGACAAAACTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTG  2996

Query 2278  ----------------------------------------------  2277
                                                          
Sbjct 2997  GTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGGCCTCATCCCTGAGAAT  3042