Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07845
- Subject:
- NM_027758.4
- Aligned Length:
- 3804
- Identities:
- 2697
- Gaps:
- 717
Alignment
Query 1 ATGTGGGTGAACCCGGAGGAGGTGTTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGGGCCAACCCATACTTCAT 74
|||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGTGGGTGAATCCGGAGGAGGTACTGCTGGCCAACGCGCTGTGGATCACCGAGAGAGCCAACCCCTACTTCAT 74
Query 75 CCTGCAGCGGAGGAAGGGCCACGCCGGCGATGGAGGCGGCGGCGGCGGACTGGCGGGCCTGCTGGTGGGTACCC 148
.|||||.||.|||||||||||||..|||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 TCTGCAACGAAGGAAGGGCCACGGGGGCGACGGGGGTGGCGGCGGCGGATTGGCGGGCCTCCTTGTGGGTACCC 148
Query 149 TTGATGTTGTGTTGGACTCCAGCGCCCGGGTCGCTCCTTACCGAATCTTGTACCAGACTCCAGACTCCCTGGTC 222
|.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 149 TCGATGTGGTATTGGACTCCAGTGCCCGAGTCGCACCGTACCGAATCCTTTATCAAACTCCAGACTCTCTAGTC 222
Query 223 TACTGGACCATCGCCTGTGGTGGTTCCAGGAAAGAAATCACTGAACACTGGGAATGGCTTGAGCAAAATCTCTT 296
||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||..|
Sbjct 223 TATTGGACCATTGCCTGTGGTGGCTCCAGGAAGGAGGTTACTGAGCACTGGGAATGGCTTGAACAGAACCTACT 296
Query 297 GCAGACACTCTCCATCTTTGAAAATGAGAATGATATCACCACATTTGTGAGAGGAAAAATACAGGGCATCATTG 370
|||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 GCAGACACTCTCCATCTTTGAGAATGAGAATGACGTCACCACATTTGTAAGAGGGAAAATACAGG--------- 361
Query 371 CAGAATACAACAAAATCAATGATGTAAAGGAAGATGATGACACGGAGAAGTTTAAAGAAGCCATTGTGAAATTT 444
Sbjct 362 -------------------------------------------------------------------------- 361
Query 445 CATAGGCTGTTTGGGATGCCAGAGGAAGAGAAACTCGTCAACTATTACTCTTGCAGCTATTGGAAGGGGAAGGT 518
Sbjct 362 -------------------------------------------------------------------------- 361
Query 519 CCCCCGTCAGGGTTGGATGTACCTCAGCATTAACCACCTTTGCTTTTATTCTTTTCTTATGGGAAGGGAAGCGA 592
|||||
Sbjct 362 ------------------------------TAACC--------------------------------------- 366
Query 593 AACTGGTCATCCGGTGGGTAGACATCACTCAGCTTGAGAAGAATGCCACCCTGCTTCTGCCTGATGTGATCAAA 666
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 667 GTGAGCACACGGTCCAGTGAGCATTTCTTCTCTGTATTCCTCAACATCAACGAGACCTTCAAGTTAATGGAGCA 740
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 741 GCTTGCCAACATAGCCATGAGGCAACTCTTAGACAATGAGGGATTTGAACAAGATCGATCCCTGCCCAAACTCA 814
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 815 AAAGGAAATCTCCTAAAAAAGTGTCTGCTCTAAAACGTGATCTTGATGCCAGGGCAAAGAGTGAGAGATACCGT 888
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 889 GCACTTTTCCGGCTGCCCAAAGATGAAAAATTAGATGGCCACACAGACTGCACTCTCTGGACTCCATTTAACAA 962
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 963 AATGCACATTTTGGGGCAGATGTTTGTGTCCACAAATTACATCTGTTTTACCAGCAAGGAGGAGAACTTATGTA 1036
Sbjct 367 -------------------------------------------------------------------------- 366
Query 1037 GCCTCATTATCCCGCTCCGTGAGGTGACAATTGTGGAAAAGGCAGACAGCTCCAGTGTGCTCCCCAGTCCCT-T 1109
||.|||||.|||||.|||||||.||||||||||||||| |||| |
Sbjct 367 -----------------------------ATCGTGGAGAAGGCCGACAGCTGCAGTGTGCTCCCCAG-CCCTCT 410
Query 1110 ATCCATCAGCACCCGAAACAGGATGACCTTCCTATTTGCCAACTTGAAAGATAGAGACTTTCTAGTGCAGAGGA 1183
.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 411 GTCCATCAGCACCAGGAACAGGATGACCTTCCTGTTCGCGAACTTGAAAGACAGAGACTTTCTGGTGCAGAGGA 484
Query 1184 TCTCAGATTTCCTGCAACAGACTACTTCCAAAATATATTCTGACAAGGAGTTTGCAGGAAGTTACAACAGTTCA 1257
|||||||||||.||||.||.||.|||||.|..||.||.||.|||||.||||||.|||||||.|.||||||.|||
Sbjct 485 TCTCAGATTTCTTGCAGCAAACGACTTCTAGGATCTACTCAGACAAAGAGTTTTCAGGAAGCTGCAACAGCTCA 558
Query 1258 GATGATGAGGTGTACTCTCGACCCAGCAGCCTCGTCTCCTCCAGCCCCCAGAGAAGCACGAGCTCTGATGCTGA 1331
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 559 GATGATGAGGTGTATTCTCGGCCCAGCAGCCTCGTTTCCTCCAGTCCCCAGAGAAGCACAAGCTCGGATGCTGA 632
Query 1332 TGGAGAGCGCCAGTTTAACCTAAATGGCAACAGCGTCCCCACAGCCACACAGACCCTGATGACCATGTATCGGC 1405
||||||.||||..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 633 TGGAGAACGCCCCTTTAACCTCAATGGCAACAGTGTCCCTACAGCCACCCAGACCCTCATGACCATGTACCGGC 706
Query 1406 GGCGGTCTCCCGAGGAGTTCAACCCGAAATTGGCCAAAGAGTTTCTGAAAGAGCAAGCCTGGAAGATTCACTTT 1479
||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 707 GGCGATCTCCTGAAGAATTCAACCCAAAATTGGCCAAAGAGTTTTTGAAAGAACAAGCCTGGAAGATTCACTTT 780
Query 1480 GCTGAGTATGGGCAAGGGATCTGCATGTACCGCACAGAGAAAACGCGGGAGCTGGTGTTGAAGGGCATCCCGGA 1553
||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 781 GCTGAGTATGGGCAGGGAATCTGCATGTACCGCACAGAGAAGACCCGGGAGCTGGTGCTGAAGGGCATCCCAGA 854
Query 1554 GAGCATGCGTGGGGAGCTCTGGCTGCTGCTGTCAGGTGCCATCAATGAGAAGGCCACACATCCTGGGTACTATG 1627
|||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 855 GAGCATGCGCGGAGAGCTCTGGCTGCTGCTTTCAGGGGCCATCAATGAAAAGGCCACACACCCCGGGTACTACG 928
Query 1628 AAGACCTAGTGGAGAAGTCCATGGGGAAGTATAATCTCGCCACGGAGGAGATTGAGAGGGATTTACACCGCTCC 1701
|.|.|||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 929 AGGGCCTCGTGGAGAAGTCGATGGGAAAGTACAATCTGGCCACCGAGGAGATTGAGAGAGACTTACACCGCTCC 1002
Query 1702 CTTCCAGAACACCCAGCTTTTCAGAATGAAATGGGCATTGCTGCACTAAGGAGAGTCTTAACAGCTTATGCTTT 1775
||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1003 CTTCCAGAACACCCAGCTTTCCAGAACGAAATGGGCATCGCGGCTCTGAGGAGAGTCTTAACGGCTTATGCTTT 1076
Query 1776 TCGAAATCCCAACATAGGGTATTGCCAGGCCATGAATATTGTCACTTCAGTGCTGCTGCTTTATGCCAAAGAGG 1849
|||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1077 TCGCAATCCCAACATAGGATACTGCCAGGCCATGAACATTGTCACTTCAGTGCTACTGCTGTATGCCAAAGAGG 1150
Query 1850 AGGAAGCTTTCTGGCTGCTTGTGGCTTTGTGTGAGCGCATGCTCCCAGATTACTACAACACCAGAGTTGTGGGT 1923
||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1151 AGGAGGCCTTCTGGCTGCTTGTGGCCTTGTGTGAGCGCATGCTTCCCGACTACTACAACACCAGAGTTGTAGGT 1224
Query 1924 GCACTGGTGGACCAAGGTGTCTTTGAGGAGCTAGCACGAGACTACGTCCCACAGCTGTACGACTGCATGCAAGA 1997
||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1225 GCCCTGGTGGACCAGGGAGTCTTCGAGGAGCTGGCTCGAGACTATGTCCCGCAGCTGTACGACTGCATGCAGGA 1298
Query 1998 CCTGGGCGTGATTTCCACCATCTCCCTGTCTTGGTTCCTCACACTATTTCTCAGTGTGATGCCTTTTGAGAGTG 2071
||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1299 CCTGGGGGTGATCTCTACCATCTCCCTGTCGTGGTTCCTCACACTCTTCCTCAGTGTGATGCCATTTGAGAGTG 1372
Query 2072 CAGTTGTGGTTGTTGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATTAAAGTGATATTCCAGTTGGCCCTAGCTGTGCTGGAT 2145
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1373 CAGTGGTGGTTGTGGACTGTTTCTTCTATGAAGGAATCAAAGTGATATTTCAGCTGGCTCTCGCTGTACTGGAT 1446
Query 2146 GCAAATGTGGACAAACTGTTGAACTGCAAGGATGATGGGGAGGCCATGACCGTTTTGGGAAGGTATTTAGACAG 2219
||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1447 GCCAACGTGGATAAACTCTTGAACTGCAAGGACGATGGAGAGGCCATGACTGTTTTGGGAAGGTACCTAGACAG 1520
Query 2220 TGTGACCAATAAAGACAGCACACTGCCTCCCATTCCTCACCTCCACTCCTTGCTCAGCGATGATGTGGAACCTT 2293
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||.||.||.||||..||.|
Sbjct 1521 TGTGACCAACAAAGACAGCACCCTGCCTCCCATCCCCCATCTCCACTCCCTGCTCAGTGACGACGTGGGGCCCT 1594
Query 2294 ACCCTGAGGTAGACATCTTTAGACTCATCAGAACTTCCTACGAGAAATTCGGAACTATCCGGGCAGATTTGATT 2367
||||||..||.||||||||.||||||||..|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1595 ACCCTGCCGTGGACATCTTCAGACTCATAGGGACGTCTTACGAGAAATTTGGAACTATCCGGGCCGATTTGATT 1668
Query 2368 GAACAGATGAGATTCAAACAGAGACTGAAAGTGATCCAGACGCTGGAGGATACTACGAAACGCAACGTGGTACG 2441
||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1669 GAGCAGATGCGATTCAAGCAGAGGCTGAAAGTGATCCAGACCCTGGAGGACACCACCAAACGCAATGTGGTACG 1742
Query 2442 AACCATTGTGACAGAAACTTCCTTTACCATTGATGAGCTGGAAGAACTTTATGCTCTTTTCAAGGCAGAACATC 2515
.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1743 GACCATTGTGACGGAGACGTCCTTCACCATCGATGAGCTGGAAGAACTGTACGCTCTTTTCAAGGCTGAGCATC 1816
Query 2516 TCACCAGCTGCTACTGGGGCGGGAGCAGCAACGCGCTGGACCGGCATGACCCCAGCCTGCCCTACCTGGAACAG 2589
|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1817 TGACCAGCTGCTACTGGGGTGGGAGCAGCAATGCCCTGGACCGACACGACCCCAGCCTGCCTTACCTGGAGCAG 1890
Query 2590 TATCGCATTGACTTCGAGCAGTTCAAGGGAATGTTTGCTCTTCTCTTTCCTTGGGCATGTGGAACTCACTCTGA 2663
||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|..||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1891 TACCGCATCGACTTTGAGCAGTTCAAGGGCATGTTCGTGCTGCTCTTTCCCTGGGCGTGTGGCACACACTCCGA 1964
Query 2664 CGTTCTGGCCTCCCGCTTGTTCCAGTTATTAGATGAAAATGGAGACTCTTTGATTAACTTCCGGGAGTTTGTCT 2737
.||.||||||||||||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1965 TGTGCTGGCCTCCCGCCTGTTCCAGCTGTTAGATGAGAATGGAGACTCCTTGATTAACTTCCGAGAGTTCGTCT 2038
Query 2738 CTGGGCTAAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAGCTCAAACTCCTGTACAAAATGCACGTCTTGCCT 2811
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2039 CTGGGCTGAGTGCTGCATGCCATGGGGACCTCACAGAGAAACTCAAACTCCTGTACAAGATGCACGTCTTGCCT 2112
Query 2812 GAGCCATCCTCTGATCAAGATGAACCAGATTCTGCTTTTGAAGCAACTCAGTACTTCTTTGAAGATATTACCCC 2885
||||||||||.||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 2113 GAGCCATCCTGTGATCAAGATGAGCCTGACTCCGCCTTTGAAGCCACTCAGTACTTTTTTGAAGACATCACCCC 2186
Query 2886 AGAATGTACACATGTTGTTGGATTGGATAGCAGAAGCAAACAGGGTGCAGATGATGGCTTTGTTACGGTGAGCC 2959
||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||.||||.||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 2187 AGAATGCACACATGTTGTTGGCTTGGACAGTAGAGGCAAGCAGAGTGCGGACGACGGCTTCGTCACAGTGAGCC 2260
Query 2960 TAAAGCCAGACAAAGGGAAGAGAGCAAATTCCCAAGAAAATCGTAATTATTTGAGACTGTGGACTCCAGAAAAT 3033
|.||||..||||.||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||..|.|.|||.||||||.||||||||
Sbjct 2261 TGAAGCAGGACAGAGGGAAAAGGGCAAATTCTCAAGAAAACCGTAATTACCTAAAACTCTGGACTGCAGAAAAT 2334
Query 3034 AAATCTAAGTCAAAGAATGCAAAGGATTTACCCAAATTAAATCAGGGGCAGTTCATTGAACTGTGTAAGACAAT 3107
||.|||||||||||.|.|||.||||||||.|||||..|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 2335 AAGTCTAAGTCAAAAACTGCCAAGGATTTGCCCAAGCTGAACCAGGGGCAGTTTATTGAGCTCTGTAAGACCAT 2408
Query 3108 GTATAACATGTTCAGCGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCATGCCACGGCAGCAGTGACCAGCCTCCTGC 3181
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2409 GTACAACATGTTCAGTGAAGACCCCAATGAGCAGGAGCTGTACCATGCCACAGCTGCGGTGACCAGCCTCCTGC 2482
Query 3182 TGGAGATTGGGGAGGTCGGCAAGTTGTTCGTGGCCCAGCCTGCAAAGGAGGGCGGGAGCGGAGGCAG----TGG 3251
|||||||.||.|||||.||||||||.|||.|..|.|||||.|||||||| .||.|||| |||
Sbjct 2483 TGGAGATCGGAGAGGTTGGCAAGTTCTTCATTACTCAGCCGGCAAAGGA----------AGATGCAGTTCCTGG 2546
Query 3252 GCCGTCCTGCCACCAGGGCATCCCAGGCGTGCTCTTCCCCAAGAAAGGG-CCAGGCCAGCCTTACGTGGTGGAG 3324
.||..|||||..|||||.||||||||||.||||||||||.|||||.||| ||| |||||.|.||.|||||||||
Sbjct 2547 ACCACCCTGCGGCCAGGCCATCCCAGGCATGCTCTTCCCTAAGAAGGGGTCCA-GCCAGTCCTATGTGGTGGAG 2619
Query 3325 TCTGTTGAGCCCCTGCCGGCCAGCCTGGCCCCCGACAGCGAGGAACACTCCCTTGGAGGACAAATGGAGGACAT 3398
||....|||||.||..|.||.||||||||....|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 2620 TCCACAGAGCCACTCACAGCTAGCCTGGCAGTGGACAGTGAGGAGCACTCCCTGGGAGGGCAGATGGAGGACAT 2693
Query 3399 CAAGCTGGAGGACTCCTCGCCCCGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGCTGATCTCTGACGACGACACCAAGG 3472
.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 2694 TAAACTGGAGGACTCCTCACCCAGGGACAACGGGGCCTGCTCCTCCATGTTGATCTCCGATGATGACACCAAGG 2767
Query 3473 ACGACAGCTCCATGTCCTCATACTCGGTGCTGAGTGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAGCTGCACTGCGAGGAC 3546
|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2768 ATGACAGCTCCATGTCATCCTACTCGGTGCTGAGCGCCGGCTCCCACGAGGAGGACAAACTGCACTGTGAGGAC 2841
Query 3547 ATCGGAGAGGACACGGTCCTGGTGCGGAGCGGCCAGGGCACGGCGGCACTGCCCCGGAGCACCAGCCTGGACCG 3620
||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.|..||..|.||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 2842 ATTGGAGAGGACACAGTCCTGGTGCGTAGCAGTCAGGGTAGAGCCACCCTGCCCAGGAGCAGCAGCCTGGACCG 2915
Query 3621 GGACTGGGCCATCACCTTCGAGCAGTTCCTGGCCTCCCTCTTAACTGAGCCTGCCCTGGTCAAGTACTTTGACA 3694
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|.|||||||||||
Sbjct 2916 GGACTGGGCCATCACCTTTGAGCAGTTCCTGGCCTCGCTCTTGACGGAGCCCGCTCTCGTGAGGTACTTTGACA 2989
Query 3695 AGCCCGTGTGCATGATGGCCAGGATTACCAGTGCAAAAAACATCCGGATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCGGCC 3768
||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2990 AGCCAGTGTGCATGATGGCCAGGGTCACCAGTGCGAAGAACATCCGTATGATGGGCAAGCCCCTCACCTCAGCC 3063
Query 3769 AGTGACTATGAAATCTCGGCCATGTCCGGC 3798
|||||||||||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 3064 AGTGACTATGAAATCTCTGCCCTGTCGGGC 3093