Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07852
- Subject:
- NM_001134473.3
- Aligned Length:
- 3339
- Identities:
- 3338
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAAC 74
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Sbjct 1 ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAAC 74
Query 75 CAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGG 148
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Sbjct 75 CAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGG 148
Query 149 AACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGC 222
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Sbjct 149 AACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGC 222
Query 223 ACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCG 296
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Sbjct 223 ACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCG 296
Query 297 GCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCA 370
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Sbjct 297 GCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCA 370
Query 371 CCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCC 444
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Sbjct 371 CCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCC 444
Query 445 AGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAG 518
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Sbjct 445 AGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAG 518
Query 519 GTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCT 592
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Sbjct 519 GTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCT 592
Query 593 CTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTC 666
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Sbjct 593 CTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTC 666
Query 667 AGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCG 740
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Sbjct 667 AGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCG 740
Query 741 TGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTG 814
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Sbjct 741 TGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTG 814
Query 815 AGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCC 888
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Sbjct 815 AGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCC 888
Query 889 GCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCG 962
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Sbjct 889 GCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCG 962
Query 963 GGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGC 1036
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Sbjct 963 GGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGC 1036
Query 1037 CCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATC 1110
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Sbjct 1037 CCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATC 1110
Query 1111 TTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGC 1184
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Sbjct 1111 TTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGC 1184
Query 1185 GCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGG 1258
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Sbjct 1185 GCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGG 1258
Query 1259 AGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCA 1332
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Sbjct 1259 AGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCA 1332
Query 1333 GGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCC 1406
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Sbjct 1333 GGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCC 1406
Query 1407 CAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGC 1480
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Sbjct 1407 CAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGC 1480
Query 1481 GGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTG 1554
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Sbjct 1481 GGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTG 1554
Query 1555 GTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGA 1628
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Sbjct 1555 GTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGA 1628
Query 1629 CAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCG 1702
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Sbjct 1629 CAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCG 1702
Query 1703 GGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCG 1776
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Sbjct 1703 GGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCG 1776
Query 1777 GCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGA 1850
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Sbjct 1777 GCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGA 1850
Query 1851 CCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCA 1924
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Sbjct 1851 CCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCA 1924
Query 1925 GGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAG 1998
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Sbjct 1925 GGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAG 1998
Query 1999 GTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTT 2072
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Sbjct 1999 GTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTT 2072
Query 2073 TTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGA 2146
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Sbjct 2073 TTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGA 2146
Query 2147 GGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCG 2220
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Sbjct 2147 GGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCG 2220
Query 2221 CTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCAT 2294
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Sbjct 2221 CTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCAT 2294
Query 2295 CTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGA 2368
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Sbjct 2295 CTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGA 2368
Query 2369 AGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTG 2442
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Sbjct 2369 AGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTG 2442
Query 2443 AGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACAT 2516
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Sbjct 2443 AGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGTCTGACAT 2516
Query 2517 CCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTC 2590
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Sbjct 2517 CCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTC 2590
Query 2591 CTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATC 2664
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Sbjct 2591 CTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATC 2664
Query 2665 CGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCC 2738
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Sbjct 2665 CGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCC 2738
Query 2739 CTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGC 2812
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Sbjct 2739 CTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGC 2812
Query 2813 ATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCT 2886
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Sbjct 2813 ATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCT 2886
Query 2887 GAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGG 2960
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Sbjct 2887 GAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGG 2960
Query 2961 CCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGG 3034
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Sbjct 2961 CCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGG 3034
Query 3035 AGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAA 3108
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Sbjct 3035 AGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAA 3108
Query 3109 AATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGC 3182
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Sbjct 3109 AATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGC 3182
Query 3183 AGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCC 3256
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Sbjct 3183 AGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCC 3256
Query 3257 AGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGA 3330
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Sbjct 3257 AGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGA 3330
Query 3331 TATCCCAGG 3339
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Sbjct 3331 TATCCCAGG 3339