Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07852
Subject:
NM_001278184.3
Aligned Length:
1144
Identities:
1112
Gaps:
31

Alignment

Query    1  -------------------------------MGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDAGSR  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MKGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDAGSR  74

Query   44  SSSGGRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRS  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  SSSGGRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRS  148

Query  118  FRPYHTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPS  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  FRPYHTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPS  222

Query  192  AMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGLSAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKEREREREKER  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGLSAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKEREREREKER  296

Query  266  EQEKEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEPSFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQLTPTRAEKLKDA  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  EQEKEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEPSFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQLTPTRAEKLKDA  370

Query  340  GLQAPKPVQHPLHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSE  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GLQAPKPVQHPLHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSE  444

Query  414  FRQQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAAPTALWNPVSLM  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FRQQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAAPTALWNPVSLM  518

Query  488  DNTLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKYQPPPPPPREGGSLEHQ  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  DNTLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKYQPPPPPPREGGSLEHQ  592

Query  562  PFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPYRPPVPRAPDPAYIYDEFLQQRRRLVSK  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPYRPPVPRAPDPAYIYDEFLQQRRRLVSK  666

Query  636  LDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQ  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQ  740

Query  710  KRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTHISAEKRKDKERLV  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  KRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTHISAEKRKDKERLV  814

Query  784  EMLRAMKQKALSAAVADSLTNSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGAAASLSDIPKAAEPGKLEQVRPQELS  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  EMLRAMKQKALSAAVADSLTNSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGVAASLSDIPKAAEPGKLEQVRPQELS  888

Query  858  RVQELAPASGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQST  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  RVQELAPASGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQST  962

Query  932  QKALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQELDRDSEEEEEEDD  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  QKALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQELDRDSEEEEEEDD  1036

Query 1006  EDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQLSHSVAELRSQKQKMV  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  EDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQLSHSVAELRSQKQKMV  1110

Query 1080  SERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR  1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  SERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR  1144