Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07852
- Subject:
- XM_017023083.1
- Aligned Length:
- 3642
- Identities:
- 3338
- Gaps:
- 303
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCCATGAGCCCAAGTCCCCTTCGCTAGGGATGCTTTCCACCGCGACCAGGACCACCGCCACCGTCAACCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTCACCCCCTCGCCGCTCAATGGCGCCCTGGTGCCCAGCGGCAGCCCCGCCACCAGCAGCGCGCTGTCGGCCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGCCGCGCCATCCTCCAGCTTTGCCGCCGCGCTGCGCAAGCTCGCCAAACAGGCGGAGGAGCCCAGAGGGTCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCACTGAGCAGCGAGTCGTCCCCCGTGTCCTCTCCGGCCACCAACCACAGCTCCCCCGCCAGCACACCCAAGCG 296
Query 1 -------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCG 67
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Sbjct 297 CGTGCCCATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCG 370
Query 68 CTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGA 141
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Sbjct 371 CTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGA 444
Query 142 GGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCT 215
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Sbjct 445 GGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCT 518
Query 216 GCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACC 289
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Sbjct 519 GCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACC 592
Query 290 TCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTAC 363
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Sbjct 593 TCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTAC 666
Query 364 CACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTA 437
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Sbjct 667 CACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTA 740
Query 438 CCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTG 511
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Sbjct 741 CCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTG 814
Query 512 CCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTG 585
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Sbjct 815 CCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTG 888
Query 586 CACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTC 659
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Sbjct 889 CACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTC 962
Query 660 TGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGC 733
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Sbjct 963 TGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGC 1036
Query 734 GTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAG 807
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Sbjct 1037 GTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAG 1110
Query 808 GAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCT 881
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Sbjct 1111 GAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCT 1184
Query 882 GCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTG 955
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Sbjct 1185 GCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTG 1258
Query 956 AGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCG 1029
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Sbjct 1259 AGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCG 1332
Query 1030 CCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCA 1103
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Sbjct 1333 CCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCA 1406
Query 1104 TGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGT 1177
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Sbjct 1407 TGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGT 1480
Query 1178 GGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAG 1251
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Sbjct 1481 GGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAG 1554
Query 1252 GTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCAC 1325
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Sbjct 1555 GTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCAC 1628
Query 1326 CAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGA 1399
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Sbjct 1629 CAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGA 1702
Query 1400 TTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTG 1473
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Sbjct 1703 TTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTG 1776
Query 1474 GAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGT 1547
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Sbjct 1777 GAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGT 1850
Query 1548 GCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCC 1621
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Sbjct 1851 GCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCC 1924
Query 1622 CTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCC 1695
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Sbjct 1925 CTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCC 1998
Query 1696 GGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCC 1769
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Sbjct 1999 GGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCC 2072
Query 1770 ACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGG 1843
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Sbjct 2073 ACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGG 2146
Query 1844 CCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAG 1917
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Sbjct 2147 CCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAG 2220
Query 1918 GAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGA 1991
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Sbjct 2221 GAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGA 2294
Query 1992 GGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGC 2065
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Sbjct 2295 GGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGC 2368
Query 2066 TAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAG 2139
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Sbjct 2369 TAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAG 2442
Query 2140 CGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAG 2213
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Sbjct 2443 CGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAG 2516
Query 2214 ACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCC 2287
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Sbjct 2517 ACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCC 2590
Query 2288 TGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGT 2361
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Sbjct 2591 TGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGT 2664
Query 2362 GCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGT 2435
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Sbjct 2665 GCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGT 2738
Query 2436 CTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGT 2509
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Sbjct 2739 CTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGT 2812
Query 2510 CTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAG 2583
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Sbjct 2813 CTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAG 2886
Query 2584 CTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCA 2657
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Sbjct 2887 CTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCA 2960
Query 2658 CTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGT 2731
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Sbjct 2961 CTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGT 3034
Query 2732 GGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTG 2805
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Sbjct 3035 GGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTG 3108
Query 2806 CAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAA 2879
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Sbjct 3109 CAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAA 3182
Query 2880 CATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAA 2953
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Sbjct 3183 CATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAA 3256
Query 2954 GGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAA 3027
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Sbjct 3257 GGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAA 3330
Query 3028 GATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGA 3101
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Sbjct 3331 GATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGA 3404
Query 3102 AGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCC 3175
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Sbjct 3405 AGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCC 3478
Query 3176 TGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAG 3249
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Sbjct 3479 TGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAG 3552
Query 3250 CGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCT 3323
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Sbjct 3553 CGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCT 3626
Query 3324 GAAGGGATATCCCAGG 3339
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Sbjct 3627 GAAGGGATATCCCAGG 3642