Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07856
• Subject: XM_006520545.3
• Aligned Length: 1222
• Identities: 945
• Gaps: 95

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  ATGAATACTTCTTGCTGGAAGTCCATCACCCAGAGGCCAGCTTTCCCAACCGCCGGACGACAGCAGAGCGCCAT  74

Query    3  GACCC---AGGAGCCATTCAGAGAGGAGCTGGCCTATGACCGGATGCCCACGCTGGAGCGGGGCCGGCAAGA--  71
            |||.|   |||.||..|||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.||  
Sbjct   75  GACACGGGAGGGGCAGTTCAGGGAGGAACTGGGCTATGACCGGATGCCCACACTGGAGAGGGGTCGGCAGGATG  148

Query   72  --------------CCACGCCAGCTATGCCCCAGACGCGAAGCCGAGCGACCTGCAGCTGTCGAAGAGACTGCC  131
                          ||| |.||||||..||||.|||.|.|||||.|..||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  149  CAGGACGGCAGGACCCA-GGCAGCTACACCCCTGACTCAAAGCCCAAGGACCTGCAGCTGTCGAAGAGGTTGCC  221

Query  132  CCCCTGCTTCAGCCACAAGACGTGGGTCTTCTCTGTGCTGATGGGGAGCTGCCTCCTGGTGACCTCGGGGTTTT  205
            |||.|||||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  222  CCCGTGCTTCAGCTACAAGACATGGGTGTTCTCTGTGTTAATGGGGAGCTGCCTTCTTGTGACCTCTGGGTTTT  295

Query  206  CGCTGTACCTGGGGAACGTGTTCCCGGCTGAGATGGATTACTTGCGCTGTGCTGCAGGCTCTTGCATCCCCTCG  279
            ||||.|||.||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  296  CGCTCTACTTGGGGAACGTGTTCCCCTCCGAGATGGATTATTTGCGCTGTGCAGCAGGCTCTTGCATCCCCTCA  369

Query  280  GCAATTGTGAGCTTCACCGTCTCCAGGAGGAACGCCAATGTGATTCCCAACTTTCAGATATTGTTTGTTTCCAC  353
            |||||||||||||||.|.||....|||||.||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  GCAATTGTGAGCTTCGCTGTAGGGAGGAGAAATGTCAGTGCGATTCCCAACTTTCAGATATTGTTTGTTTCCAC  443

Query  354  GTTTGCTGTGACCACTACGTGTTTAATTTGGTTTGGATGCAAACTAGTCCTGAACCCATCAGCAATAAACATCA  427
            |||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||..|||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  444  GTTCGCTGTGACTACTACGTGTTTGATCTGGTTTGGGTGTAAACTGATCCTGAATCCTTCAGCCATAAACATTA  517

Query  428  ACTTCAACCTCATCCTGCTGCTCCTGCTGGAGCTGCTCATGGCGGCCACGGTGATCATCGCTGCACGGTCCAGC  501
            |.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||||||||||||||..|.||.||||||||.
Sbjct  518  ATTTCAACCTCATCCTGCTCCTGCTGTTGGAGCTCCTCATGGCAGCCACGGTGATCATTTCGGCCCGGTCCAGT  591

Query  502  GAGGAGGACTGCAAGAAAAAGAAGGGCTCCATGTCTGACAGCGCCAACATTCTGGACGAAGTGCCATTTCCTGC  575
            ||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||.||..||.|.|||||||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct  592  GAGGAGCCCTGCAAGAAGAAGAAGGGTTCCATCTCCGATGGCTCTAACATTCTGGATGAAGTGACGTTTCCTGC  665

Query  576  TCGGGTCCTGAAATCTTACTCAGTCGTCGAGGTAATCGCAGGCATCTCTGCCGTCCTCGGGGGGATCATTGCCC  649
            |||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.||..||||.||.||||||||.|||.|.||.||.|
Sbjct  666  TCGGGTCCTAAAGTCCTACTCTGTGGTAGAAGTAATTGCTGGTGTCTCCGCTGTCCTCGGTGGGGTGATCGCTC  739

Query  650  TGAACGTGGATGACTCAGTTTCAGGCCCACACCTCTCAGTGACGTTCTTTTGGATCCTAGTGGCCTGCTTTCCA  723
            |.|||||.||.||..|.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.|||||.
Sbjct  740  TAAACGTAGAGGAAGCTGTCTCGGGTCCACATCTCTCGGTGACGTTCTTTTGGATTTTAGTGGCTTGTTTTCCC  813

Query  724  AGTGCCATTGCCAGTCATGTGGCAGCAGAGTGTCCCAGCAAGTGTCTGGTGGAGGTCCTGATTGCCATAAGCAG  797
            ||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  814  AGTGCCATTGCCAGCCATGTGACAGCGGAATGTCCCAGCAAGTGTCTGGTTGAGGTGCTGATAGCCATCAGCAG  887

Query  798  CCTCACGTCTCCGCTGCTGTTCACAGCCTCTGGATATCTGTCATTCAGCATCATGAGAATCGTGGAGATGTTTA  871
            ||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..|.||||||.||||||||||.||||
Sbjct  888  CCTCACATCCCCACTGCTATTCACTGCCTCTGGATATCTGTCCTTCAGTGTGATGAGAGTCGTGGAGATTTTTA  961

Query  872  AGGATTACCCGCCAGCCATAAAACCATCCTACGATGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTAGTGCTCCTGCTGCAG  945
            |.|||||||||||||||||.||   |||.||.|||||.||.||||||||.|||.||||..||||.|||||.|||
Sbjct  962  AAGATTACCCGCCAGCCATCAA---ATCTTATGATGTTCTCCTGCTGCTCCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTTCAG  1032

Query  946  GCCGGCCTCAACACGGGCACCGCCATCCAGTGCGTGCGCTTCAAGGTCAGTGCAAGGCTGCAGGGTGCATCCTG  1019
            |..||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||..|||||||||.|||||||||
Sbjct 1033  GGGGGACTCAACACTGGCACCGCCATCCAGTGTGTGAGCTTCAAAGTCAGCGCCCGGCTGCAGGCTGCATCCTG  1106

Query 1020  GGACACCCAGAACGGCCCGCAGGAGCGCCTGGCTGGGGAGGTGGCCAGGAGCCCCCTGAAGGAGTTCGACAAGG  1093
            ||||.|||||..|.|.||.||||||||.|..||.||||||||||.|.|..|||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1107  GGACCCCCAGTCCTGTCCCCAGGAGCGGCCAGCAGGGGAGGTGGTCCGAGGCCCCCTCAAGGAGTTTGACAAAG  1180

Query 1094  AGAAAGCCTGGAGAGCCGTCGTGGTGCAAATGGCCCAG  1131
            ||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1181  AGAAAGCCTGGAGAGCTGTGGTGGTACAAATGGCCCAG  1218