Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07858
- Subject:
- XM_006524150.2
- Aligned Length:
- 3384
- Identities:
- 2677
- Gaps:
- 381
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAGTGTGGCCGGGGCGCCGCAGGAGGGGCCCTGCCCACCTCCCCGAGCCCGGCCCTAGGCGCCAAGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGCCCTGAAAGCCGGAGCCGGGGAAGGCGGAGGTGGTGGCGGGGGAGGTCGCCTCGGCCACGGGCGGGCGCGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGACAGCGGCGGGGTTTCCAACGGAGACTGCAGCCTCGGCGTGTCCGGGGACGAAGCCCGGACCAGCCCTGGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AGGGGACCTCTAGGCGTGGCGCTCGCGCGGACCCCTAGCCCAGCTGCCGGTCCGGTCCCCAGGGACAGCAAACC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGGCGGCCTGCCCCGCCGGAGCAGCATCATCAAGGATGGCACGAAGCAGAAAAGGGAGCGGAAGAAGACGGTGT 370
Query 1 -----------ATGCCAACAGAGAAGAAGATCAGCAGTGCAAGTGATTGTATTAATTCAATGGTTGAGGGTTCA 63
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 371 CATTCAGCAGCATGCCGACAGAGAAGAAGATCAGCAGCGCAAGTGACTGTATCAACTCAATGGTTGAGGGCTCT 444
Query 64 GAACTCAAAAAGGTTCGCTCCAACTCTAGAATTTATCATAGGTACTTTTTACTGGATGCTGACATGCAGAGCCT 137
|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 445 GAACTCAAAAAGGTTCGTTCTAACTCCAGAATTTACCATCGGTATTTTCTGCTGGACGCCGACATGCAAAGCCT 518
Query 138 AAGGTGGGAGCCATCTAAGAAGGATTCTGAGAAAGCCAAGATTGACATTAAATCCATCAAGGAAGTGAGAACAG 211
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGGTGGGAGCCATCTAAGAAGGATTCTGAGAAAGCCAAGATTGATATCAAATCTATCAAGGAAGTGAGAACAG 592
Query 212 GAAAAAACACAGACATATTCCGCAGCAATGGCATTTCTGACCGGATATCTGAAGATTGTGCGTTTTCCGTCATA 285
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 593 GAAAGAACACAGATATATTCCGCAGCAATGGCATTTCTGAGCAGATCTCTGAAGATTGTGCATTTTCAGTCATA 666
Query 286 TATGGAGAGAATTATGAGTCACTGGATTTGGTTGCCAACTCCGCAGATGTTGCAAACATCTGGGTTACAGGACT 359
||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 TATGGAGAAAATTATGAGTCACTTGATTTGGTTGCCAATTCTGCAGATGTTGCAAACATCTGGGTGACAGGACT 740
Query 360 GCGGTACCTAATTTCTTATGGAAAACATACACTTGATATGTTAGAAAGTAGCCAAGATAACATGAGGACTTCTT 433
.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCTACCTGATTTCTTATGGGAAACATACACTTGATATGCTAGAAAGTAGCCAAGACAACATGAGGACTTCTT 814
Query 434 GGGTTTCACAAATGTTTAGTGAAATTGATGTAGATAACCTTGGACATATAACTCTGTGTAATGCTGTGCAATGT 507
||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||
Sbjct 815 GGATTTCACAAATGTTTAGTGAAATTGATGTAGATGGTCTTGGACATATAACTCTGTGTCATGCTGTCCAGTGT 888
Query 508 ATCAGAAACCTCAATCCTGGTTTAAAAACGAGCAAAATTGAGCTTAAGTTCAAAGAATTGCATAAATCAAAGGA 581
|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCAGAAACCTCAATCCTGGTCTAAAAACAAGCAAAATTGAGCTTAAGTTCAAAGAATTGCATAAATCAAAGGA 962
Query 582 CAAAGCTGGTACCGAGGTCACAAAGGAAGAATTTATTGAGGTTTTTCATGAGCTTTGTACTAGACCTGAAATTT 655
||||||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAAGCTGGTACTGAAATCACAAAGGAGGAATTTATTGAGGTCTTTCATGAACTTTGTACTAGACCTGAAATTT 1036
Query 656 ATTTCCTTTTAGTTCAGTTTTCAAGCAATAAAGAATTCCTTGATACCAAGGACCTTATGATGTTTCTTGAGGCA 729
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACTTCCTTTTAGTTCAGTTTTCAAGCAATAAAGAATTCCTTGATACCAAGGACCTTATGATGTTTCTTGAGGCA 1110
Query 730 GAACAGGGTGTGGCACATATAAATGAGGAAATAAGCCTTGAAATTATTCACAAATATGAACCATCCAAAGAGGG 803
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1111 GAACAGGGTGTAGCACATATCAATGAGGAAATAAGCCTGGAAATTATTCACAAATACGAGCCATCCAAAGAAGG 1184
Query 804 TCAGGAAAAGGGCTGGCTCTCCATAGACGGGTTCACTAATTACCTTATGTCACCTGACTGTTATATATTCGATC 877
.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1185 CCAGGAAAAGGGCTGGCTCTCCATAGATGGATTCACTAACTACCTGATGTCACCTGATTGTTACATCTTTGATC 1258
Query 878 CAGAACATAAGAAGGTCTGTCAGGATATGAAGCAACCTCTGTCTCATTACTTTATAAACTCATCTCATAATACA 951
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGAACATAAGAAGGTCTGTCAGGATATGAAGCAACCTCTGTCTCATTACTTTATAAACTCATCTCATAATACA 1332
Query 952 TACTTAATAGAGGATCAGTTCCGAGGTCCCTCCGACATCACAGGATATATTCGAGCTCTTAAAATGGGTTGCCG 1025
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|
Sbjct 1333 TACTTAATAGAGGATCAGTTCCGGGGTCCCTCTGACATCACGGGATATATCCGCGCTCTGAAAATGGGTTGCAG 1406
Query 1026 GAGTGTTGAATTAGATGTATGGGATGGGCCGGACAATGAACCTGTAATTTACACAGGCCACACCATGACCTCTC 1099
|||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCGTTGAATTAGATGTGTGGGATGGGCCAGATAATGAGCCTGTGATTTACACAGGCCACACCATGACCTCTC 1480
Query 1100 AGATAGTTTTCCGCAGTGTCATTGATATTATTAACAAGTATGCATTCTTTGCTTCAGAGTATCCTCTTATCTTG 1173
|||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481 AGATAGTCTTCCGCAGCGTCATCGACATCATTAACAAGTACGCGTTCTTTGCTTCTGAGTATCCTCTCATCTTA 1554
Query 1174 TGTTTAGAAAACCACTGTTCCATTAAACAACAGAAGGTAATGGTTCAGCACATGAAGAAACTTTTAGGAGACAA 1247
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1555 TGTTTAGAAAACCACTGCTCTATTAAACAACAGAAGGTGATGGTTCAACACATGAAGAAAATTTTAGGAGACAA 1628
Query 1248 GCTCTATACAACATCACCCAATGTTGAGGAATCTTATCTACCATCCCCAGATGTCCTGAAAGGGAAAATACTAA 1321
|||.|||||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTGTATACGACATCACCCAACATGGAGGAATCTTATCTACCATCCCCAGATGTCCTGAAAGGGAAAATACTAA 1702
Query 1322 TTAAAGCAAAGAAGCTGTCCTCAAATTGCTCTGGGGTAGAAGGAGATGTTACTGACGAAGATGAAGGAGCAGAA 1395
|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAAAGCAAAGAAGCTGTCTTCAAATTGCTCCGGCGTGGAAGGGGATGTTACTGATGAGGATGAAGGAGCAGAA 1776
Query 1396 ATGTCTCAGAGGATGGGAAAAGAGAACATGGAGCAACCCAATAATGTGCCTGTGAAGCGATTTCAGCTTTGTAA 1469
|||||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1777 ATGTCTCAGAGGATGGGGAAAGAGAATGTGGAACAACCCAACCATGTGCCTGTGAAGCGGTTTCAGCTTTGCAA 1850
Query 1470 AGAACTGTCTGAACTGGTCAGCATCTGCAAATCAGTTCAGTTCAAAGAATTTCAGATGTCGTTTCAGGTTCAGA 1543
|||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 1851 AGAACTGTCCGAGCTGGTCAGCATCTGTAAATCCGTCCAGTTCAAGGAGTTTCAGGTGTCGTTTCAGGTGCAGA 1924
Query 1544 AGTACTGGGAAGTCTGTTCCTTTAATGAAGTGCTTGCCAGCAAGTACGCCAATGAAAATCCAGGGGACTTTGTA 1617
|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1925 AGTACTGGGAAGTGTGCTCCTTTAATGAAGTACTTGCGAGTAAATACGCCAATGAGAACCCCGGGGACTTTGTG 1998
Query 1618 AATTACAACAAACGTTTTCTTGCTAGGGTTTTTCCCAGTCCAATGAGAATTGATTCCAGTAACATGAATCCTCA 1691
||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1999 AATTACAATAAGCGTTTCCTCGCCAGGGTCTTCCCTAGTCCAATGAGAATTGACTCAAGCAACATGAACCCTCA 2072
Query 1692 AGATTTTTGGAAATGTGGTTGCCAAATTGTAGCCATGAACTTTCAGACACCAGGACTGATGATGGACCTGAATA 1765
.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||..
Sbjct 2073 GGATTTTTGGAAATGTGGCTGTCAGATTGTAGCCATGAACTTCCAGACTCCAGGGCTGATGATGGACCTAAACG 2146
Query 1766 TTGGCTGGTTTAGGCAGAACGGAAACTGTGGCTATGTCCTCCGGCCAGCCATCATGAGGGAGGAGGTCTCCTTC 1839
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2147 TTGGCTGGTTTAGGCAGAATGGAAACTGTGGCTATGTTCTTCGACCAGCCATCATGAGGGAAGAAGTCTCCTTC 2220
Query 1840 TTCAGCGTCAATACAAAAGACTCTGTCCCAGGGGTCTCACCTCAACTTCTTCACATTAAAATCATCAGTGGGCA 1913
|||||.|.|||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2221 TTCAGTGCCAACACCAAGGACTCTGTCCCAGGAGTTTCACCTCAGTTGCTTCACATCAAAATCATCAGCGGCCA 2294
Query 1914 GAACTTTCCCAAGCCCAAAGGATCAGGTGCCAAAGGTGATGTGGTAGATCCTTATGTCTATGTTGAAATCCATG 1987
||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2295 GAACTTTCCCAAACCCAAAGGGTCGGGTGCCAAAGGTGACGTGGTGGACCCTTATGTCTATGTGGAAATCCACG 2368
Query 1988 GAATCCCTGCTGATTGTGCAGAACAAAGGACAAAAACAGTGCACCAGAATGGAGACGCTCACATTTTTGATGAA 2061
||||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||||..||||||||.||.
Sbjct 2369 GAATTCCTGCCGACTGCGCGGAGCAAAGGACAAAAACGGTGAACCAGAATGGAGATGCTCCTATTTTTGACGAG 2442
Query 2062 AGCTTTGAATTTCAAATCAACCTGCCTGAACTGGCCATGGTGCGCTTTGTAGTGCTGGATGATGACTACATTGG 2135
||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 2443 AGCTTTGAGTTTCAGATTAACCTCCCTGAACTAGCCATGGTGCGCTTTGTCGTGCTGGACGACGACTACATCGG 2516
Query 2136 GGATGAATTCATCGGCCAGTACACAATTCCCTTTGAATGTTTACAGACGGGCTACCGCCATGTCCCCCTGCAGT 2209
.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2517 CGATGAGTTCATCGGCCAGTACACCATTCCCTTCGAGTGTTTACAGACGGGCTACCGCCATGTGCCTCTGCAGT 2590
Query 2210 CCTTAACTGGAGAGGTCCTTGCACATGCTTCTTTATTTGTCCACGTGGCTATTACTAACCGAAGAGGAGGAGGA 2283
||.|.||||||||||||||.||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.
Sbjct 2591 CCCTGACTGGAGAGGTCCTCGCCCACGCTTCTCTGTTCGTCCACGTGGCTATTACTAACAGGAGAGGGGGAGGG 2664
Query 2284 AAGCCTCGTAAAAGGGGCCTTTCTGTGAGAAAAGGGAAGAAATCCAGGGAATATGCATCTTTGAGAACACTGTG 2357
|||||||..|||.||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||.||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 2665 AAGCCTCACAAACGGGGCCTTTCCGTGAGGAAAGGAAAAAAGTCCCGGGAATATGCCTCTCTGAGAACACTGTG 2738
Query 2358 GATTAAAACCGTGGATGAGGTATTCAAGAATGCCCAGCCCCCTATACGGGATGCCACAGATCTGAGAGAAAACA 2431
|||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 2739 GATTAAAACTGTAGACGAGGTGTTCAAGAACGCCCAGCCCCCCATACGGGATGCCACGGACCTGAGAGAGAACA 2812
Query 2432 TGCAGAATGCGGTGGTGTCATTCAAGGAGCTGTGTGGCCTCTCCTCTGTGGCCAATCTCATGCAGTGCATGTTG 2505
||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct 2813 TGCAGAATGCAGTGGTGTCGTTCAAAGAGTTGTGTGGCCTCTCCTCCGTGGCCAACCTCATGCAGTGCATGCTT 2886
Query 2506 GCGGTGTCTCCCCGCTTTCTGGGGCCCGATAACACACCCCTAGTGGTCCTAAATCTCAGCGAGCAGTACCCCAC 2579
||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.|..|||||.||||||.|.||.||.||.||||..||||||||
Sbjct 2887 GCCGTGTCTCCTCGATTCCTGGGGCCTGACAATAACCCCCTGGTGGTCTTGAACCTTAGTGAGCCCTACCCCAC 2960
Query 2580 AATGGAGCTGCAGGGAATTGTGCCGGAGGTTCTGAAGAAGATCGTAACAACTTATGACATGATGATTCAGTCCC 2653
.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2961 CATGGAGCTGCAAGCCATCGTGCCTGAGGTGCTGAAGAAGATTGTAACAACTTATGACATGATGATGCAGTCCC 3034
Query 2654 TCAAGGCGTTGATTGAAAATGCAGATGCTGTATATGAAAAGATCGTACATTGTCAGAAGGCAGCCATGGAATTC 2727
|||||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3035 TCAAGGCACTGATTGAAAATGCAGACGCTGTGTATGAAAAGATCGTGCACTGTCAGAAGGCAGCCATGGAATTT 3108
Query 2728 CATGAACACTTGCACAGCATAGGCACCAAGGAAGGTTTGAAGGAAAGAAAACTACAAAAAGCAGTGGAGAGCTT 2801
||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 3109 CATGAACACTTGCACAGCATAGGCACCAAGGAGGGGCTGAAGGAACGGAAACTACAGAAGGCAGTGGAGAGCTT 3182
Query 2802 TACCTGGAATATTACCATCTTAAAGGGACAAGCAGATCTTTTGAAATATGCTAAGAATGAGACATTGGAGAACC 2875
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 3183 TACCTGGAATATTACAATCTTAAAGGGGCAAGCGGATCTTCTGAAATATGCTAAGAATGAGACCCTGGAGAACC 3256
Query 2876 TGAAACAAATCCATTTTGCTGCTGTTTCATGTGGACTGAATAAACCAGGCACCGAAAATGCTGATGTCCAGAAG 2949
||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||..|.||.|.|||||||
Sbjct 3257 TGAAGCAGATCCACTTTGCAGCTGTTTCCTGTGGACTGAACAAACCAGGCACTGAAAACTCCGAGGCCCAGAAG 3330
Query 2950 CCACGCCGGAGCTTGGAAGTCATACCCGAAAAAGCAAACGATGAAACTGGAGAA 3003
||||||||||||.|.||||.|||.|||||.|||||.|..|||||||.||||||.
Sbjct 3331 CCACGCCGGAGCCTAGAAGCCATCCCCGAGAAAGCCAGTGATGAAAATGGAGAC 3384
