Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07874
Subject:
NM_178246.3
Aligned Length:
3054
Identities:
2701
Gaps:
9

Alignment

Query    1  ATGAGCCCAGGCCCCCCCACAGGGGAGAGCAGCGAGCCCGAAGCAAAAGTCCTCCACACTAAGCGGCTTTACCG  74
            |||||||.||||||.||..||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCAAGGCCCTCCTCCAGGGGAGAGCAGCGAACCCGAGGCAAAGGTCCTCCACACCAAGCGGCTTTACCG  74

Query   75  GGCTGTGGTGGAGGCTGTGCATCGACTTGACCTCATCCTTTGCAACAAAACTGCTTATCAAGAAGTATTCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  GGCTGTGGTGGAGGCTGTGCATCGGCTAGATCTCATCCTTTGCAACAAAGCTGCTTATCAGGAAGTGTTCAAAC  148

Query  149  CAGAAAACATTAGCCTGAGGAACAAGCTGCGTGAGCTCTGCGTCAAGCTTATGTTCCTGCACCCAGTGGACTAT  222
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.||||.|||||.||||||
Sbjct  149  CAGAGAACGTTAGCCTGAGGAACAAGCTACGAGAGCTCTGTGTGAAGCTTATGTTCTTGCATCCAGTAGACTAT  222

Query  223  GGGAGAAAGGCTGAGGAGCTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAGCTTATCAAGACTAACAAAAA  296
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGAGGAAGGCTGAGGAACTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAACTTATCAAGACTAACAAAAA  296

Query  297  GCACATCCACAGCCGGAGCACTTTGGAATGTGCCTACAGGACGCACCTGGTTGCTGGTATTGGCTTCTACCAGC  370
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCACATCCACAGTCGGAGCACCTTGGAATGTGCCTACAGGACTCATCTGGTCGCTGGCATTGGCTTCTACCAGC  370

Query  371  ATCTCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTGCAGTGCTGCATCGACTGGACCCATGTCACTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  ATCTCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTACAGTGCTGCATCGACTGGACTCACGTCACCGAT  444

Query  445  CCCCTCATAGGATGCAAGAAGCCAGTGTCTGCCTCAGGGAAGGAGATGGATTGGGCACAGATGGCATGTCACCG  518
            ||||||||.||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  445  CCCCTCATGGGATTCAAGAAGCCAGTATCTGCTTCAGGAAAGGAGATGGATTGGGCACAAATGGCTTGCCACCG  518

Query  519  ATGTCTGGTGTATCTGGGGGATTTGTCCCGATATCAGAATGAATTAGCTGGCGTAGATACCGAGCTGCTAGCCG  592
            |||.||||||||.|||||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  ATGCCTGGTGTACCTGGGGGATCTGTCACGCTATCAGAATGAGTTGGCTGGTGTGGACACCGAGCTGCTAGCTG  592

Query  593  AGAGATTTTACTACCAAGCCCTGTCAGTAGCTCCTCAGATTGGAATGCCCTTCAATCAGCTGGGCACCCTGGCA  666
            |||||||.|||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  AGAGATTCTACTATCAAGCCTTGTCAGTGGCTCCCCAGATTGGAATGCCCTTCAACCAGCTGGGTACCCTTGCA  666

Query  667  GGCAGCAAGTACTATAATGTGGAAGCCATGTATTGCTACCTGCGCTGCATCCAGTCAGAAGTGTCCTTTGAGGG  740
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAGCAAGTATTACAACGTGGAAGCCATGTATTGCTACTTGCGCTGCATCCAGTCGGAAGTGTCCTTTGAGGG  740

Query  741  AGCCTATGGGAACCTCAAGCGGCTGTATGACAAGGCAGCCAAAATGTACCACCAACTGAAGAAGTGTGAGACTC  814
            |||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||..
Sbjct  741  AGCCTATGGGAACCTCAAGAGACTATATGACAAGGCAGCCAAAATGTACCACCAGTTGAAGAAGTCTGAGACCA  814

Query  815  GGAAACTGTCTCCTGGCAAAAAGCGATGTAAAGACATTAAAAGGTTGCTAGTGAACTTTATGTATCTGCAAAGC  888
            ||||.||.||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  815  GGAAGCTCTCCCCTAGCAAAAAGCGATGCAAAGACATTAAGAGGTTGTTGGTGAACTTCATGTACCTACAAAGC  888

Query  889  CTCCTACAGCCCAAAAGCAGCTCCGTGGACTCAGAGCTGACCTCACTTTGCCAGTCAGTCCTGGAGGACTTCAA  962
            ||..|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  889  CTGTTACAGCCCAAAAGTAGCTCCGTGGACTCAGAACTGACCTCACTCTGCCAGTCAGTCCTAGAGGATTTCAA  962

Query  963  CCTCTGCCTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTCAGCCTGGCCAGTGAGGATGAGGAGGAGTATGAGAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||..|||..||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  963  CCTCTGCCTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTTGGTCTAACCAACGAGGATGAGGAGGAGTGTGAAAGTG  1036

Query 1037  GATATGCTTTCCTCCCGGACCTTCTCATCTTTCAAATGGTCATCATCTGCCTTATGTGTGTGCACAGCTTGGAG  1110
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||.||||||||||.||..||
Sbjct 1037  GATATGCTTTCCTCCCCGACCTGCTCATCTTTCAGATGGCCATCATCTGCCTCATGGGTGTGCACAGTTTAAAG  1110

Query 1111  AGAGCAGGATCCAAGCAGTACAGTGCAGCCATTGCCTTCACCCTGGCCCTCTTTTCCCACCTCGTCAATCATGT  1184
            |||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111  AGAGCAGGATCCAAGCATTATAGTGCAGCCATTGCTTTCACCCTGGCCCTCTTTTCCCACCTTATCAATCATGT  1184

Query 1185  CAACATACGGCTGCAGGCTGAGCTGGAAGAGGGCGAGAATCCCGTCCCGGCATTCCAGAGTGATGGCACAGATG  1258
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACATACGGCTGCAGGCGGAACTGGAAGAGGGCGAGAACCCTGTCTCAGCTTTTCAGAGTGATGGCACAGATG  1258

Query 1259  AACCAGAGTCCAAGGAACCTGTGGAGAAAGAGGAGGAGCCAGATCCTGAGCCTCCTCCTGTAACACCCCAAGTG  1332
            ||||||||||.||.|||.|..|.||.|||   |||||||||||.|||||||||||..||||...||||||||..
Sbjct 1259  AACCAGAGTCAAAAGAAGCACTAGAAAAA---GAGGAGCCAGAGCCTGAGCCTCCCACTGTGGTACCCCAAGCT  1329

Query 1333  GGTGAGGGCAGAAAGAGCCGTAAGTTCTCTCGCCTCTCCTGTCTCCGCCGTCGCCG------CCACCCACCCAA  1400
            |.||||||||||||||||||||||..|||.||.|||||.|||||.||.||||||||      |||.||.||.||
Sbjct 1330  GATGAGGGCAGAAAGAGCCGTAAGCACTCCCGACTCTCTTGTCTACGTCGTCGCCGCCGCCACCATCCTCCTAA  1403

Query 1401  AGTTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAAGGCTTTGAATCGGACTCAAGCCATGACTCAGCCCGGGCCAGTGAGG  1474
            ||.||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||.|
Sbjct 1404  AGCTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAGGGTTTTGAATCTGACTCTAGCCATGACTCTGCCCAGGCCAGTGACG  1477

Query 1475  GCTCAGACAGTGGCTCTGACAAGAGTCTTGAAGGTGGGGGAACGGCCTTTGATGCTGAAACAGACTCGGAAATG  1548
            |||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1478  GCTCAGACAGTGGCTCTGATAAGAGCCTGGAAGGCAGGGGCACTGCTTTTGATGCAGAGACAGACTCAGAAATG  1551

Query 1549  AATAGCCAGGAGTCCCGATCAGACTTGGAAGATATGGAGGAAGAGGAGGGGACACGGTCACCAACCCTGGAGCC  1622
            ||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.|.||.|||.|||.||||||
Sbjct 1552  AACAGCCAGGAGTCCCGGTCAGACCTGGAAGATATGGAGGATGAGGAGGGGACAAGATCTCCAGCCCAGGAGCC  1625

Query 1623  CCCTCGGGGCAGATCAGAGGCTCCCGATTCCCTCAATGGCCCACTGGGCCCCAGTGAGGCTAGCATTGCCAGCA  1696
            |||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1626  CCCTCAGGCCAGATCAGAGGTTCCAGATTCCCTCAATGGCCCCCTGGGCCCCAGTGAAGCAAGCATTGCCAGCA  1699

Query 1697  ATCTACAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACTAAGCGCTGCTTCCGACTGGCCCCCACCTTTAGCAACCTG  1770
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1700  ATTTACAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACCAAGCGCTGCTTCCGACTGGCTCCCACTTTCAGCAACCTG  1773

Query 1771  CTCCTCCAGCCCACCACCAACCCTCATACCTCGGCCAGCCACAGGCCTTGCGTCAATGGGGATGTAGACAAGCC  1844
            |||||.|||||||||||..|.|||.|.|....||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||
Sbjct 1774  CTCCTGCAGCCCACCACGGAACCTAACAGTGTGGCCAGTCACAGGCCTTGTGTCAACGGGGATATGGACAAGCC  1847

Query 1845  TTCAGAGCCAGCCTCTGAGGAGGGCTCTGAGTCGGAGGGGAGTGAGTCCAGTGGACGCTCCTGTCGGAATGAGC  1918
            ||.|||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||....|||||||||||.||.||||
Sbjct 1848  TTTAGAACCAGCCTCTGAGGATGGCTCCGAGTCAGAGGGGAGCGAGTCCAGCAACCGCTCCTGTCGCAACGAGC  1921

Query 1919  GCAGCATCCAGGAGAAGCTTCAGGTCCTGATGGCCGAAGGTCTGCTTCCTGCTGTGAAAGTCTTCCTGGACTGG  1992
            |||||.|.|||||||||||.||||.|||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1922  GCAGCCTTCAGGAGAAGCTGCAGGCCCTGATGGCTGAGGGCCTCCTTCCTGCTGTGAAGGTCTTCCTGGACTGG  1995

Query 1993  CTTCGGACCAACCCCGACCTCATCATCGTGTGTGCGCAGAGCTCTCAAAGTCTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTT  2066
            ||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTGCGAACCAACCCTGACCTCATCATCGTGTGTGCACAGAGCTCTCAAAGTTTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTT  2069

Query 2067  GCTGAATCTGTTGCCTGCTGCTGGTGAACTCCAGGAGTCTGGCCTGGCCTTGTGTCCTGAGGTCCAAGATCTTC  2140
            |||||||||||||||.||..|||.|||.||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||||.|||.|
Sbjct 2070  GCTGAATCTGTTGCCAGCATCTGCTGAGCTCCAGGATTCTGGCCTGGCTCTGTGTTCCGAAGTCCAAGGTCTCC  2143

Query 2141  TTGAAGGTTGTGAACTGCCTGACCTCCCCTCTAGCCTTCTGCTCCCAGAGGACATGGCTCTTCGTAACCTGCCC  2214
            |||||||.||.||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 2144  TTGAAGGCTGCGAGCTGCCTGACCTCCCTGCCAGCCTGCTGCTCCCAGAGGACATGGCACTGCGTAACCTACCT  2217

Query 2215  CCGCTCCGAGCTGCCCACAGACGCTTTAACTTTGACACGGATCGGCCCCTGCTCAGCACCTTAGAGGAGTCAGT  2288
            ||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct 2218  CCTCTGCGGGCTGCTCATAGACGCTTTAACTTTGACGCAGATCGGCCCCTGCTCAGTGCTTTAGAGGAGTCGGT  2291

Query 2289  GGTGCGCATCTGCTGCATCCGCAGCTTTGGTCATTTCATCGCCCGCCTGCAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAACC  2362
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|.||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2292  GGTGCGCATCTGCTGTATCCGCAGCTTTGGGCACTTTGTTGCTCGCTTACAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAATC  2365

Query 2363  CAGAGGTTGGCATCTTCGTCAGCATTGCCCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTGCAGCAGGCCCAGGCACAGTTC  2436
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2366  CAGAGGTCGGCATCTTCGTCAGCATTGCTCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTGCAGCAGGCCCAGGCCCAGTTT  2439

Query 2437  CGAATGGCACAGGAGGAAGCTCGTCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGACTTCAGCTCGAAGT  2510
            ||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||
Sbjct 2440  CGTATGGCAGAGGAGGAGGCTCGGCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGATTACAGCTCGAGGT  2513

Query 2511  GTCTCAGCTGGAGGGCAGCCTGCAGCAGCCCAAGGCCCAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCGTCCCTGACACCC  2584
            .||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2514  CTCCCAACTGGAAGGGAGCCTACAGCAGCCCAAAGCTCAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCATCCCTGACACCC  2587

Query 2585  AGGCCCTCTGCCACCATCTCCCTGTCATCCGCCAACTGGCCACCAGTGGCCGCTTCATTGTCATCATCCCAAGG  2658
            |||||||||||.||||.||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||
Sbjct 2588  AGGCCCTCTGCTACCACCTCCCTCTTATCCGCCAGCTTGCCACCAGTGGCCGCTTCATCATCATCATTCCAAGG  2661

Query 2659  ACAGTGATCGATGGCCTGGATTTGCTGAAGAAGGAACACCCAGGGGCCCGGGATGGGATTCGGTACCTGGAGGC  2732
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2662  ACAGTGATTGATGGCCTGGATTTGCTGAAGAAAGAACAGCCAGGGGCCAGGGATGGCATCCGGTACCTGGAGGC  2735

Query 2733  AGAGTTTAAAAAAGGAAACAGGTACATTCGCTGCCAGAAAGAGGTGGGAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAGCTGA  2806
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2736  AGAGTTTAAAAAGGGAAACAGATACATTCGCTGCCAGAAGGAGGTGGGAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAACTGA  2809

Query 2807  AGAGGCAGGATGCAGATGCCTGGACTCTCTATAAGATCCTAGACAGCTGCAAACAGCTGACTCTGGCCCAGGGG  2880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2810  AGAGGCAGGATGCAGATGCCTGGACTCTCTATAAGATCCTGGACAGCTGCAGACAGCTAACTCTGGCCCAGGGG  2883

Query 2881  GCAGGTGAGGAGGATCCGAGTGGCATGGTGACCATCATCACAGGCCTTCCACTGGACAACCCCAGCGTGCTTTC  2954
            |||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||...||||||.||||||.|..||.||
Sbjct 2884  GCAGGGGAGGAGGACCCAAGTGGCATGGTGACCATTATCACAGGCCTTCATTTGGACAGCCCCAGTGCACTCTC  2957

Query 2955  AGGCCCCATGCAGGCAGCCCTGCAGGCCGCTGCCCACGCCAGTGTGGACATCAAGGATGTTCTGGACTTCTACA  3028
            .||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||.|.|||||.||||||||||
Sbjct 2958  TGGGCCCATGCAGGCTGCCCTGCAAGCTGCTGCCCATGCCAGTGTGGACGTCAAGAACGTTCTAGACTTCTACA  3031

Query 3029  AGCAGTGGAAGGAAATTGGT  3048
            .||||||||||||.||||||
Sbjct 3032  GGCAGTGGAAGGAGATTGGT  3051