Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07875
- Subject:
- XM_011243589.2
- Aligned Length:
- 3406
- Identities:
- 2965
- Gaps:
- 56
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGAAGAAAGCAAGCAGGAGTGT 23
|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1 ATGTTGGAACTAAGGTTTGGTTGTAAATGCATCACCAAGAGGCAGCCCAGAATGAAGAAAGCAAACAGGAGTGC 74
Query 24 TGGCTCAGTGCCTAAAGTGTCTGCAATAAGTAAAACGCAAACAGCAGAAAAAATTAAACCTGAAAACAGCTCTT 97
|||||||||||||||.|||||||..|||||.|||.|||||||||.|||.||||..||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TGGCTCAGTGCCTAAGGTGTCTGGGATAAGCAAACCGCAAACAGTAGAGAAAAGCAAGCCTGAGAACAGCTCTT 148
Query 98 CAGCATCTACGGGAGGCAAACTTGTAAAACCTGGAACAGCAGCATCATTGTCAAAGACCAAGAGCAGTGATGAC 171
|||||.|.||.||||.|||.|.|||.|..|||||..||||||||.|.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 149 CAGCACCCACAGGAGTCAAGCCTGTGAGGCCTGGGGCAGCAGCAGCCTTGTCAAAGACCAAGAGCAATGATGAC 222
Query 172 CTTTTAGCTGGAATGGCCGGAGGGGTAACGGTGACTAATGGTGTTAAAGGAAAGAAAAGCACCTGCCCATCTGC 245
|||||||||||||||||.|||||.||||..||||||||||||.||||||.|||||||||||||||..|||||||
Sbjct 223 CTTTTAGCTGGAATGGCTGGAGGAGTAAACGTGACTAATGGTATTAAAGCAAAGAAAAGCACCTGTTCATCTGC 296
Query 246 AGCACCTTCAGCATCTGCCCCTGCCATGACCACCGTGGAGAACAAATCCAAGATTAGCACAGGCAC-AGCTTCT 318
|||.||||||||..|.||||||||||||||||.|..|||||||||.||||||||.||||||||||| || |||.
Sbjct 297 AGCGCCTTCAGCCCCCGCCCCTGCCATGACCATCTCGGAGAACAAGTCCAAGATCAGCACAGGCACTAG-TTCC 369
Query 319 TCAACCAAGCGGAGCACTTCTACAGGTAATAAAGAATCCAGTTCTACTAGAGAAAGATTACGTGAACGTACCCG 392
|||.||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 370 TCAGCCAAACGGAGTACTTCGGCTGGTAATAAAGAGTCCAGTTCTACTAGAGAAAGATTACGTGAACGCACCCG 443
Query 393 ATTAAACCAGAGCAAAAAACTACCTTCTGCAGGTCAGGGAGCTAATGACATGGCATTGGCCAAACGTTCCCGCA 466
..|||||||||||||||||||.||.||||.|.||||||||||||||||..|||||.||||.||||||||.||||
Sbjct 444 GCTAAACCAGAGCAAAAAACTGCCCTCTGTAAGTCAGGGAGCTAATGATGTGGCACTGGCTAAACGTTCACGCA 517
Query 467 GTCGAACTGCTACAGAATGTGACGTTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCAGACAATCAGATCAGTGACAGAGCTGCT 540
|.||.||||||.||||..||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 518 GCCGCACTGCTGCAGAGGGTGATATTCGTATGAGCAAGTCTAAGTCGGACAATCAGATCAGTGACAAAGCTGCT 591
Query 541 TTGGAGGCCAAAGTGAAGGATCTTCTCACGCTGGCAAAAACCAAAGACGTAGAAATTTTACATTTGAGAAATGA 614
|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TTGGAAGCCAAGGTGAAAGATCTCCTCACACTGGCGAAAACCAAGGATGTGGAAATTTTACATTTGAGAAATGA 665
Query 615 ACTGCGAGACATGCGTGCCCAGCTGGGCATTAATGAGGATCATTCTGAGGGTGATGAAAAATCTGA---GAAGG 685
|||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||.|||.|||||.||.|..||||| |||||
Sbjct 666 ACTCCGAGACATGCGTGCTCAGCTGGGCATTAGTGAGGACCATTGTGAAGGTGAGGACAGGTCTGAGGTGAAGG 739
Query 686 AAACTATTATGGCTCACCAGCCGACTGATGTGGAGTCCACTTTATTGCAGTTGCAGGAACAGAATACTGCCATC 759
||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||.|..|||||.|||||||.||||||||.||||||
Sbjct 740 AAACTATTATTGCTCACCAGCCTACTGACGTGGAGTCTACTCTCCTGCAGCTGCAGGAGCAGAATACAGCCATC 813
Query 760 CGTGAAGAACTCAACCAGCTGAAAAATGAAAACAGAATGTTAAAGGACAGGTTGAATGCATTGGGCTTTTCCCT 833
||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||.||||||||||||||
Sbjct 814 CGCGAGGAGCTCAACCAGCTGAAGAATGAAAACAGAATGCTAAAGGACAGGCTCAATGCTTTGGGCTTTTCCCT 887
Query 834 AGAGCAGAGGTTAGACAATTCTGAAAAACTGTTTGGCTATCAGTCCCTGAGCCCAGAAATCACCCCTGGTAACC 907
||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGAGCAAAGGCTGGACAATTCTGAAAAACTATTTGGCTATCAGTCCCTGAGCCCAGAAATCACCCCTGGTAACC 961
Query 908 AGAGCGATGGAGGAGGAACTCTGACTTCTTCAGTGGAAGGCTCTGCCCCTGGCTCAGTGGAGGATCTCTTGAGT 981
||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||.|||||
Sbjct 962 AGAGTGACGGAGGAGGAACTCTGACATCTTCGGTAGAAGGTTCTGCTCCTGGGTCGGTGGAAGATCTCCTGAGT 1035
Query 982 CAGGATGAAAATACACTAATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAATTTAGACAGTGAGTGCAGTGAGGT 1055
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036 CAGGATGAAAATACACTCATGGACCATCAGCACAGTAACTCCATGGACAACCTGGACAGTGAGTGCAGCGAGGT 1109
Query 1056 CTACCAGCCCCTCACATCGAGCGATGATGCGCTGGATGCACCATCCTCCTCAGAGTCGGAAGGCATCCCCAGCA 1129
.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||.|.||.||||
Sbjct 1110 GTACCAGCCCCTCACTTCCAGCGATGATGCTCTGGACGCCCCCTCCTCTTCAGAGTCAGAGGGCGTGCCAAGCA 1183
Query 1130 TAGAGCGCTCCCGGAAGGGGAGCAGCGGGAATGCCAGTGAAGTGTCCGTGGCTTGCCTGACTGAACGGATACAC 1203
|.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1184 TTGAGCGCTCTCGGAAGGGGAGCAGTGGGAATGCCAGTGAGGTGTCCGTCGCTTGCCTGACAGAACGGATTCAC 1257
Query 1204 CAGATGGAAGAGAACCAACACAGTACAAGTGAGGAACTCCAGGCAACCCTGCAAGAGCTAGCTGATTTACAGCA 1277
|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1258 CAGATGGAAGAGAACCAGCACAGCACCAGTGAGGAGCTTCAGGCCACTCTACAGGAGCTGGCTGATCTCCAGCA 1331
Query 1278 GATTACCCAGGAACTGAATAGTGAAAACGAAAGGCTTGGAGAAGAGAAGGTTATTCTGATGGAGTCTTTATGTC 1351
||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct 1332 GATTACCCAGGAGCTCAACAGTGAGAACGAAAGGCTGGGAGAGGAGAAGGTCATTCTGATGGAGTCGCTGTGTC 1405
Query 1352 AGCAGAGCGATAAGTTGGAACACTTTAGTCGACAGATTGAATACTTCCGCTCTCTTCTAGATGAGCATCACATT 1425
|||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1406 AGCAGAGTGATAAGTTGGAACACTTTGGCCGGCAGATTGAGTATTTCCGTTCCCTTCTTGATGAGCATCACATT 1479
Query 1426 TCTTATGTCATAGATGAAGATGTAAAAAGTGGGCGCTATATGGAATTAGAGCAACGTTACATGGACCTCGCTGA 1499
||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||.||||||||..|.|||||
Sbjct 1480 TCCTATGTCATAGATGAAGACGTAAAGAGCGGGCGCTATATGGAACTAGAGCAGCGCTACATGGATTTGGCTGA 1553
Query 1500 GAATGCCCGTTTTGAACGGGAGCAGCTTCTTGGTGTCCAGCAGCATTTAAGCAATACTTTGAAAATGGCAGAAC 1573
|||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1554 GAATGCCCGTTTTGAGCGAGAGCAGCTTCTAGGTGTGCAGCAGCATTTAAGCAACACTTTGAAGATGGCAGAAC 1627
Query 1574 AAGACAATAAGGAAGCTCAAGAAATGATAGGGGCACTCAAAGAACGCAGTCACCATATGGAGCGAATTATTGAG 1647
||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1628 AAGATAACAAAGAAGCTCAAGAAATGATAGGTGCCCTCAAAGAGCGCAGCCACCACATGGAGCGGATTATTGAG 1701
Query 1648 TCTGAGCAGAAAGGAAAAGCAGCCTTGGCAGCCACGTTAGAGGAATACAAAGCCACAGTGGCCAGTGACCAGAT 1721
|||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702 TCTGAGCAGAAGGGCAAAGCGGCCCTGGCAGCCACATTGGAGGAGTACAAAGCTACTGTGGCCAGTGACCAGAT 1775
Query 1722 AGAGATGAATCGCCTGAAGGCTCAGCTGGAGAATGAAAAGCAGAAAGTGGCAGAGCTGTATTCTATCCATAACT 1795
|||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1776 AGAGATGAATCGCTTGAAGGCCCAGCTGGAGAACGAAAAGCAGAAGGTGGCTGAGTTGTATTCTATCCATAACT 1849
Query 1796 CTGGAGACAAATCTGATATTCAGGACCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACAAAGAAAAAGCAGAGACTTTGGCT 1869
||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1850 CTGGAGACAAGTCCGATATCCAGGATCTCCTGGAGAGTGTCAGGCTGGACAAGGAAAAGGCGGAGACTTTGGCC 1923
Query 1870 AGTAGCTTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGATTACAGGATGCCATTGCTAAGGTAGA 1943
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1924 AGTAGCCTGCAGGAAGATCTGGCTCATACCCGAAATGATGCCAATCGGTTACAGGACACCATTGCTAAGGTAGA 1997
Query 1944 GGATGAATACCGAGCCTTCCAAGAAGAAGCTAAGAAACAAATTGAAGATTTGAATATGACGTTAGAAAAATTAA 2017
.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1998 AGATGAATACCGAGCTTTCCAGGAAGAGGCCAAGAAGCAGATTGAAGATTTGAATATGACATTAGAAAAACTAA 2071
Query 2018 GATCAGACCTGGATGAAAAAGAAACAGAAAGGAGTGACATGAAAGAAACCATCTTTGAACTTGAAGATGAAGTA 2091
|||||||..||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2072 GATCAGAGTTGGAGGAAAAGGACACGGAGAGGAGTGACATGAAGGAAACCATCTTTGAACTTGAAGATGAGGTG 2145
Query 2092 GAACAACATCGTGCTGTGAAACTTCATGACAACCTCATTATTTCTGATCTAGAGAATACAGTTAAAAAACTCCA 2165
||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2146 GAGCAGCACCGCGCCGTGAAGCTGCATGACAACCTCATTATCTCTGATCTAGAGAATACAGTTAAGAAACTCCA 2219
Query 2166 GGACCAAAAGCACGACATGGAAAGAGAAATAAAGACACTCCACAGAAGACTTCGGGAAGAATCTGCGGAATGGC 2239
.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2220 AGACCAAAAGCATGACATGGAAAGAGAAATCAAGACACTTCACAGGAGACTTCGGGAAGAGTCTGCAGAATGGC 2293
Query 2240 GGCAGTTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTAGTCATTGCAAATGACATTAAATCTGAAGCCCAAGAGGAGATT 2313
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2294 GGCAATTTCAGGCTGATCTCCAGACTGCAGTGGTCATTGCCAATGATATCAAGTCTGAAGCCCAAGAAGAGATC 2367
Query 2314 GGTGATCTAAAGCGCCGGTTACATGAGGCTCAAGAAAAAAATGAGAAACTCACAAAAGAATTGGAGGAAATAAA 2387
||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 GGTGATCTAAAGCGACGGCTACATGAGGCCCAAGAGAAAAATGAGAAACTCACAAAAGAATTGGAGGAAATAAA 2441
Query 2388 GTCACGCAAGCAAGAGGAGGAGCGAGGCCGGGTATACAATTACATGAATGCCGTTGAGAGAGATTTGGCAGCCT 2461
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2442 GTCACGCAAGCAAGAGGAAGAGCGTGGCCGGGTGTATAACTACATGAATGCTGTTGAAAGAGATTTGGCAGCCT 2515
Query 2462 TAAGGCAGGGAATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCGACTTCCTCAGAGCCAACTCCTACAGTAAAAACCCTCATC 2535
|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2516 TGAGGCAAGGGATGGGACTGAGTAGAAGGTCCTCCACTTCCTCAGAACCAACTCCCACAGTAAAAACCCTCATC 2589
Query 2536 AAGTCCTTTGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACCCTGCTGCAGCTGCAATTCCTCGAACGCCCCTGAGCCCAAG 2609
|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2590 AAGTCTTTCGACAGTGCATCTCAAGTACCAAACGCTGCTGCAGCTGCGATCCCTCGAACACCTCTGAGTCCAAG 2663
Query 2610 TCCTATGAAAACCCCTCCTGCAGCAGCTGTGTCCCCTATGCAGAGACATTCCATAAGTGGACCAATCTCAACAT 2683
|||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2664 TCCCATGAAAACCCCTCCTGCAGCTGCCGTTTCTCCCATGCAGAGACATTCCATAAGTGGTCCAATCTCAACCT 2737
Query 2684 CCAAACCCCTGACAGCCCTGTCAGATAAGAGACCAAACTATGGGGAAATCCCTGTTCAAGAGCATCTGTTAAGA 2757
||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||..|.|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2738 CCAAGCCTCTGACAGCCTTGTCAGATAAGAGATCAAACTATGGAGAGCTTCCTGTACAAGAGCATCTACTAAGA 2811
Query 2758 ACATCTTCAGCCAGCCGGCCTGCTTCCCTGCCAAGAGTGCCTGCGATGGAAAGTGCCAAGACCCTCTCAGTGTC 2831
|||||||||.||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2812 ACATCTTCAACCAGCCGGCCCGCCTCTCTCCCAAGAGTCCCTGCTATGGAAAGTGCCAAGACCATCTCAGTGTC 2885
Query 2832 TCGACGAAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATTTCTGCACAGGAGGGAGCGTCGCCAGCCTCTCTGATGGCTA 2905
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||...|||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2886 TCGACGGAGTAGTGAAGAAATGAAACGGGACATCTCTGCATCTGAGGGCGCGTCACCAGCCTCTCTCATGGCTA 2959
Query 2906 TGGGAACCACGTCTCCACAGCTTTCCCTGTCCTCTTCTCCAACGGCATCTGTGACTCCCACCACCCGAAGCCGA 2979
||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|.||||||.||||||
Sbjct 2960 TGGGCACCACGTCACCACAGCTCTCCCTCTCTTCCTCTCCCACTGCATCTGTCACTCCAAGCACCCGGAGCCGA 3033
Query 2980 ATAAGAGAAGAAAGGAAAGACCCTCTCTCAGCATTGGCCAGAGAATATGGAGGATCAAAGAGGAACGCCTTGCT 3053
|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 3034 ATAAGGGAAGAAAGGAAAGACCCCCTCTCAGCATTGGCAAGAGAATATGGAGGCTCCAAGAGGAACGCCTTGTT 3107
Query 3054 GAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATTACAAACTTCAGCAGCAGCTGGAATGATG 3127
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3108 GAAGTGGTGTCAGAAGAAAACAGAAGGCTATCAGAATATTGACATCACAAACTTCAGCAGCAGCTGGAACGACG 3181
Query 3128 GGCTGGCCTTCTGTGCCCTCCTGCATACATATCTCCCTGCCCACATTCCATATCAAGAACTGAACAGCCAGGAT 3201
|||||||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 3182 GGCTGGCTTTCTGCGCATTGCTTCATACCTATCTCCCAGCCCACATACCATATCAAGAACTGAACAGTCAAGAT 3255
Query 3202 AAGAGAAGGAACTTCATGCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTCGGCATCAAATCCACACTGGACATTAATGA 3275
||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 3256 AAGAAAAGGAACTTCACCCTGGCTTTCCAGGCAGCTGAAAGTGTTGGAATCAAATCGACGCTGGACATCAATGA 3329
Query 3276 AATGGTACGGACTGAACGACCCGACTGGCAGAACGTGATGCTGTATGTGACGGCGATCTACAAGTACTTTGAGA 3349
|||||..||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 3330 AATGGCGCGTACTGAACGGCCCGACTGGCAGAACGTCATGCTGTATGTTACAGCCATCTACAAGTACTTTGAAA 3403
Query 3350 CC 3351
||
Sbjct 3404 CC 3405