Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07902
- Subject:
- XM_006529676.3
- Aligned Length:
- 2804
- Identities:
- 2124
- Gaps:
- 337
Alignment
Query 1 ATGCTGCTGTTCTTTACTTTGGGATTGCTTATACATTTTGTGTTCTTCGCCTCCATCTTTGACATTTATTTTAC 74
|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGCTGTTTTTTGCTTTGGGATTGCTTATCCATTTTGTGTTCTTCGCTTCCATCTTTGACATTTATTTTAC 74
Query 75 ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCTCAGTTTACACCATTGCCTCCTCCAGCGAGAAGATTAGTGTTGTTTG 148
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|.||||
Sbjct 75 ATCTCCTTTGGTTCATGGAATGACTCCCCAGTTTACACCTTTGCCTCCTCCAGCAAAAAGATTAGTGCTATTTG 148
Query 149 TTGCTGATGGCCTTCGAGCAGATGCACTTTACGAATTAGATGAAAATGGAAACTCTAGAGCACCGTTTATTAGG 222
|||||||||||||..||||||||.|.|||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 149 TTGCTGATGGCCTGAGAGCAGATACTCTTTATGAATTAGATGAAGATGGAAACTCCAGAGCACCTTTCATTAGG 222
Query 223 AATATCATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGCATATCTCATACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCAGGTCATGT 296
|||.|.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 AATGTTATAATGCATGAAGGCAGCTGGGGAGTATCTCACACACGTGTGCCAACAGAATCTCGGCCTGGCCATGT 296
Query 297 AGCTCTGATAGCTGGGTTTTATGAAGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAGGAAAATCCTGTAGAGTTTG 370
|||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 AGCCTTGATAGCTGGATTTTATGAGGATGTCAGTGCAGTTGCCAAAGGATGGAAAGAAAATCCTGTAGAATTTG 370
Query 371 ATTCTCTTTTTAATGAAAGTAAATACACATGGAGCTGGGGAAGCCCAGATATCCTGCCTATGTTTGCCAAAGGT 444
|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 ACTCTCTTTTTAATGAAAGCAAGTACACGTGGAGCTGGGGGAGTCCAGATATCTTGCCCATGTTTGCCAAAGGT 444
Query 445 GCTAGTGGAGACCACGTTTATACATATAGTTATGATGCTAAAAGAGAGGATTTTGGTGCTCAAGATGCAACAAA 518
||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 445 GCTAGTGGTGACCATGTCTATACATATAGTTACGATGCTCAAAGAGAAGATTTTGGTGCCCACGATGCCACAAA 518
Query 519 ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAATGTTAAGGACTTCTTTCATCATGCCAGAAACAACCAGTCTTTGTTTTCTA 592
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||..|||.|||||||||||.||||||||..|.|
Sbjct 519 ACTGGATACGTGGGTTTTTGATAAAGTTAAGGACTTCTTTGATGCTGCAAGAAACAACCAATCTTTGTTCACAA 592
Query 593 AAATAAATGAAGAGAAAATAGTTTTTTTCTTACATTTATTAGGAATAGATACAAACGGACATGCTCATCGACCA 666
||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGTAAATGAAGAAAAAGTAGTTTTTTTCTTACATTTATTGGGAATAGATACAAATGGACATGCTCATCGACCA 666
Query 667 TCCTCGAGAGACTACAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTTAAAGAAATCGTGTCTATGTTTAACCA 740
||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct 667 TCGTCAAGGGAATATAAGGACAATATTAAAAAAGTTGATGATGGAGTGAAGGAAATCGTATCAATTTTCAAGCA 740
Query 741 TTTCTATGGAAATGATGGGAAAACAACATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG 814
|||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTTATGGAGATGATGGGAAAACAGCATTTATCTTTACCTCTGACCATGGAATGACAGACTGGGGTTCCCATG 814
Query 815 GGGCTGGTCATCCTTCAGAGACTTTAACTCCTTTAGTCACTTGGGGAGCTGGAATCAAGTATCCCCAAAGAGTA 888
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.||||..|||
Sbjct 815 GGGCTGGTCATCCGTCAGAGACTTTAACTCCGTTCGTTACTTGGGGAGCTGGAATCAAATTTCCTCAAAATGTA 888
Query 889 TCAGCTCAGCAATTTGATGATGCATTTTTGAAAGAGTGGAGATTGGAGAATTGGAAGAGGCTAGATGTCAATCA 962
|||||||||||||.||||||||..|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||..||||||||||||
Sbjct 889 TCAGCTCAGCAATATGATGATGAGTTTTTAAAAGAATGGAGATTGGAAAACTGGAAAAGGAGAGATGTCAATCA 962
Query 963 GGCTGATATTGCACCATTGATGACTTCCCTTATTGGAGTTCCCTTTCCTCTTAACTCAGTGGGAATCCTTCCTG 1036
|||||||||||||||..|||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 GGCTGATATTGCACCTCTGATGGCATCCCTTATTGGAGTCCCCTTTCCTCTTAATTCGGTGGGAATACTTCCTG 1036
Query 1037 TGGATTATCTTAACAACACTGATCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACAAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG 1110
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGGTTATCTTAACAACACTGGTCTCTTCAAAGCAGAGAGCATGTTTACCAATGCAGTACAGATTCTTGAACAG 1110
Query 1111 TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAGAAAGAAGTTACTTTACCATTTTTGTTTACACCATTTAAACTGCTTTCTGA 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111 TTCAAGGTGAAAATGACTCAGAAAAAAGAAGCCACTTTACCGTTTTTGTTTACACCATTTAAGTTGCTTTCTGA 1184
Query 1185 TTCCAAACAGTTCAACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTATATAAAACACAG-AAAGTTTGATGAAGTGGTCTCC 1257
|||..||||..|..|||||||||||||||||||||||||.|||||||| || |||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1185 TTCTCAACAACTGGACATTTTAAGAAAAGCAAGATCTTACATAAAACA-AGAAAAATTTGATGAAGTAGTGTCC 1257
Query 1258 CTTTGCAAGGAGCTAATTCATCTTGCATTGAAAGGATTGTCCTATTATCACACATATGACAGATTCTTTTTGGG 1331
||.||..|||||||.|||.|.||.||..|||.||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||.||||
Sbjct 1258 CTCTGTGAGGAGCTGATTGACCTCGCCCTGAGAGGATTGTCCTATTATCATACTTATGACAGACTGTTTCTGGG 1331
Query 1332 CGTCAATGTTGTTATTGGTTTTGTGGGATGGATATCTTATGCCTCTTTGTTGATCATCAAGTCTCATTCCAACC 1405
|.|||||||||...|||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1332 CATCAATGTTGCAGTTGGTTTTGTGGGATGGATGTCTTATACTTCTTTGTTAATCATCAAGTCGCATTCTAA-- 1403
Query 1406 TTAT---AAAAGGTGTTAGTAAAGAAGTGAAGAAACCAAGCCATCTCCTGCCTTGTAGTTTTGTAGCTATTGGC 1476
||| ||||||...|||.||.||||..|||||.|||..|..||||||||.||.|||.||..||||||.|||.
Sbjct 1404 -TATCCCAAAAGGCACTAGGAAGGAAGGTAAGAAGCCACACTGTCTCCTGCTTTATAGCTTCATAGCTACTGGT 1476
Query 1477 ATTTTAGTAGCATTTTTTCTGCTGATTCAAGCCTGTCCCTGGACATATTATGTATATGGTTTGTTGCCACTGCC 1550
.|.||||||||||..||.|||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||..|.|||.|||||.||||
Sbjct 1477 GTCTTAGTAGCATGCTTCCTGATGATCCAAGCCTGTCCCTGGACTTACTATGTGTACTGCTTGCTGCCAGTGCC 1550
Query 1551 AATATGGTATGCGGTTCTAAGAGAATTTCAAGTTATTCAGGACCTTGTTGTATCAGTGTTGACCTATCCTCTGA 1624
.|||||||||||.||||||||||||..|.||||||||||.|||||.||||.||||.|.|||||.|.|||||.||
Sbjct 1551 TATATGGTATGCAGTTCTAAGAGAACATGAAGTTATTCAAGACCTGGTTGAATCACTATTGACTTTTCCTCGGA 1624
Query 1625 GCCATTTTGTTGGGTACCTGTTAGCCTTTACCCTGGGAATTGAAGTATTAGTTCTCAGTTTTTTCTACCGCTAT 1698
||||||||||||..|||.||.|.|.|||||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1625 GCCATTTTGTTGCCTACTTGCTTGTCTTTACCTTGGGTATTGAAGTACTGGTGCTCAGTTTCTTCTACCGCTAC 1698
Query 1699 ATGCTTACCGCTGGACTTACTGCCTTTGCAGCTTGGCCATTTCTCACTCGGCTGTGGACTCGAGCAAAGATGAC 1772
|||.|.||.||.|||||.|.||..|||||||..|||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1699 ATGTTGACAGCGGGACTGATTGTGTTTGCAGGCTGGCCGTTTCTCACTCAGCTGTGGACCCGAGCAAAGATCAC 1772
Query 1773 CTCACTGAGTTGGACTTTCTTCTCTTTGCTCCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCGGTTGTAGGTCGAAAGCCAG 1846
||..|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||.
Sbjct 1773 CTTCCTGAGTTGGGCTTTCTTCTCTTTGCTTCTGGCAGTGTTCCCACTGATGCCTGTCGTGGGTAGAAAGCCAA 1846
Query 1847 ACATCTCTCTAGTGATGGGTGCAGGCTTGCTGGTTCTTCTGTTATCCCTGTGTGTTGTAACATCTCTCATGAAA 1920
||.|.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||..||||||||||.|||||...|||
Sbjct 1847 ACCTTTCTCTAGTAATGGGTGCTGGATTCCTGGTTCTTCTGCTGTCGCTGGCTGTTGTAACAACTCTCGGAAAA 1920
Query 1921 AGAAAAGATAGCTTTATAAAGGAAGAGCTATTGGTACATCTGTTACAGGTGCTGAGCACAGTGCTCTCCATGTA 1994
|||||...||..||..||||||..|||||.|||||||.||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1921 AGAAACATTAAATTGGTAAAGGGCGAGCTGTTGGTACTTCTGTTACAGATGCTGAGTACAGTGCTCTCTATGTA 1994
Query 1995 TGTTGTGTATAGCACTCAGAGTAGTCTACTCAGGAAGCAAGGACTGCCTCTCATGAATCAAATTATTAGCTGGG 2068
|||.|||||||||||.||....|||||..|.|.|||..||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 1995 TGTGGTGTATAGCACCCACCACAGTCTGTTAAAGAAAGAAGGCCTGCCTCTTATGAATCAGATTGTGAGCTGGG 2068
Query 2069 CAACATTAGCCTCTTCCTTGGTTGTGCCACTACTGAGTTCTCCAGTTCTCTTTCAGCGATTGTTCAGCATACTT 2142
||||||||||||||||..||||.|..|||||.|||||.||..|||.|||||.|||||||.||..|||||||||.
Sbjct 2069 CAACATTAGCCTCTTCTCTGGTGGCACCACTCCTGAGCTCCACAGCTCTCTCTCAGCGACTGGCCAGCATACTC 2142
Query 2143 CTTTCATTGATGTCAACCTACCTACTTCTAAGCACAGGGTATGAAGCTCTCTTTCCACTAGTGTTGTCTTGTTT 2216
||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||.||||.|||||
Sbjct 2143 CTCTCCTTGATGTCCACCTACCTGCTCCTAAGCACTGGGTATGAAGCTCTCTTTCCTTTAGTGCTGTCCTGTTT 2216
Query 2217 GATGTTTGTCTGGATAAACATAGAACAAGAAACTCTACAACAATCTGGTGTTTGCTGTAAACAAAAGCTCACCA 2290
|||||||||||||||..|..|.||||||||.||.||.|||||..|||||||||..||||||||.||||||||||
Sbjct 2217 GATGTTTGTCTGGATCCAAGTGGAACAAGAGACCCTTCAACAGCCTGGTGTTTCTTGTAAACAGAAGCTCACCA 2290
Query 2291 GTATCCAGTTCTCTTATAATACTGATATAACTCAGTTTCGACAGCTATATCTGGATGACATCCGTAGGGCCTTT 2364
|.|||||||||.|.|.|.|.|||||||||.|||||||.||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GCATCCAGTTCACCTGTGACACTGATATAGCTCAGTTCCGACAGCTCTGTCCGGATGACATCCGTAGGGCCTTT 2364
Query 2365 TTCCTTGTTTTCTTCTTAGTGACAGCATTTTTTGGAACTGGAAATATAGCTTCTATTAACAGCTTTGATCTTGC 2438
||||| |||||.| ||||||||.|
Sbjct 2365 TTCCT-------------------------------------AATATTG---------------TTGATCTTTC 2386
Query 2439 CTCTGTCTATTGCTTTCTGACTGTGTTCAGTCCTTTTATGATGGGAGCCCTGATGATGTGG------AAGATTT 2506
||||.||| |||.|| || ||.||| ||||.|
Sbjct 2387 --------------------CTGTATTC-------TTAAGA------CC------ATTTGGCTACAAAAGAAT- 2420
Query 2507 TAATCCCCTTTGTTCTTGTTATGTGTGCTTTTGAAGCAGTTCAGTT-GACTACTCAGTTATCGTCAAAAAGCCT 2579
|||.| |||.||| |.|.| || ||||
Sbjct 2421 ---------------------------------AAGGA-TTCTGTTAGCCCA---AG--------AAAA----- 2444
Query 2580 TTTTCTCATTGTTCTCGTCATATCAGACATTATGGCTTTGCATTTTTTCTTCTTGGTCAAGGATTATGGCAGCT 2653
||.||||.| ||||| |.|.||| ||| .|||.||||
Sbjct 2445 --TTATCATAG-----GTCAT--------TAAAGGC--TGC------------------------CTGGGAGCT 2477
Query 2654 GGCTTGATATTGGGACAAGCATCAGCCACTATGTGATTGTCATGTCCATGACCATCTTTTTGGTGTTCCTCAAT 2727
|
Sbjct 2478 G------------------------------------------------------------------------- 2478
Query 2728 GGCCTGGCCCAGCTGCTCACAACGAAGAAACTCAGACTATGTGGCAAACCCAAAAGTCACTTCATG 2793
Sbjct 2479 ------------------------------------------------------------------ 2478