Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07930
- Subject:
- NM_144954.3
- Aligned Length:
- 1570
- Identities:
- 1348
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA 74
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||.
Sbjct 1 ATGGGGAAGCGACAGCACCAGAAGGACAAGATGTATATCACTTGTGCTGAGTACACTCATTTCTATGGTGGCAG 74
Query 75 GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG 148
||||||||||.||.||||.||||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 75 GAAGCCAGATATCTCACAGACAAGTTTTCGCCGCTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTCCAGCCTTTTG 148
Query 149 TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG 222
||||||||||||||||.||.||.||..|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TCTACCCAGTCTGCACCCCAGAAGGTGTCGTCTTTGACTTGCTGAACATTGTTCCCTGGCTTAAGAAGTATGGG 222
Query 223 ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG 296
||.||.|||||||.|||||||||.||.||.||||.||||.||||||||||||||||..|.||||||||.||.||
Sbjct 223 ACGAATCCCAGCACTGGAGAGAAACTTGATGGGAAGTCCTTGATCAAGCTGAACTTCGCAAAGAACAGCGAAGG 296
Query 297 GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA 370
|.||||||||||.||||||||||.|.||||||||||..||||||||||.||.|||||..|.|||||.||.||||
Sbjct 297 GCAGTACCACTGTCCAGTGCTGTATTCCGTGTTCACTGACAACACCCATATTGTGGCCATCAGGACAACTGGCA 370
Query 371 ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG 444
|.||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|||
Sbjct 371 ATGTCTACACCTATGAGGCAGTGGAGCAGCTAAACATCAAGGCCAAGAACTTGCGGGATCTGTTGACTGATGAG 444
Query 445 CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA 518
|||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||....|||||||.
Sbjct 445 CCCTTTTCCAGGCAAGACATCATCACCCTGCAGGACCCCACCAATTTGGACAAATTCAATGTTAGCAACTTCTT 518
Query 519 TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA 592
.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||
Sbjct 519 CCATGTGAAGAATAACATGAGAATAATAGACCCAGATGAGGAAAAGGCCAAACAAGACCCATCTTATTATTTGA 592
Query 593 AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA 666
||||.||||||.|.|||||..|||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||
Sbjct 593 AAAACACAAATTCGGAGACGAGAGAGACGCTACAGGAGCTCTACAAAGAGTTCAAAGGAGATGAGATTTTAGCA 666
Query 667 GCCACCATGAAGGCC-CCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCA 739
||.|||||| ||||| ||.|||||||||||.||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTACCATG-AGGCCACCTGAGAAGAAGAAGGTGGACCAACTGAATGCGGCCCACTACTCCACAGGGAAGGTCA 739
Query 740 GCGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTG 813
|.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||.|||
Sbjct 740 GTGCATCCTTCACCTCTACTGCCATGGTGCCCGAGACCACGCATGAAGCAGCTGTCATTGATGAAGATGTACTG 813
Query 814 CGCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCA 887
||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 814 CGCTACCAGTTTGTGAAGAAAAAGGGCTATGTAAGGCTTCACACCAACAAGGGCGACCTTAACTTAGAGCTGCA 887
Query 888 CTGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCT 961
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 888 CTGTGACCTGACACCAAAAACCTGTGAAAACTTCATCAAGCTCTGCAAGAAACAGTATTATGATGGTACCATCT 961
Query 962 TCCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATAC 1035
|.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||.|
Sbjct 962 TTCACAGGTCCATCAGGAACTTTGTGATCCAGGGCGGTGACCCCACAGGTACAGGCACAGGTGGAGAGTCATTC 1035
Query 1036 TGGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAA 1109
|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||
Sbjct 1036 TGGGGCAAGCCTTTCAAAGATGAGTTCCGTCCCAACCTTTCACACACGGGCCGTGGGGTGCTCAGCATGGCCAA 1109
Query 1110 CTCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATA 1183
.||.||||||||||.|||||..|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1110 TTCGGGGCCCAACACCAACAAATCTCAGTTCTTCATCACATTCCGATCCTGCGCTTACCTGGATAAGAAGCATA 1183
Query 1184 CCATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACT 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1184 CCATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACACGCTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCTAAAACT 1257
Query 1258 GACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATG--CCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCC 1329
|||||.|||||||||||..|.|.||| ||| |.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1258 GACCGTCCTAAGGAGGAAGTGCTCAT--ATGTACAACCACAGTGTTTGTGGACCCCTATGAGGAGGCTGATGCC 1329
Query 1330 CAGATTGCGCAGGAGCG---GAAGACACAGC-TCAAGATAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCC 1399
||||||||.|||||.|| ||||||||||| || ||.|.|..||.|||.||||.||.||||..||.|||||||
Sbjct 1330 CAGATTGCCCAGGAACGGAAGAAGACACAGCATC-AGGTGGATCCAGAGGCCAAGGTCAAGATGAGTCAGCCCC 1402
Query 1400 AGGCAGGGAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACGAAGCGA 1473
||.|.||.|.||||||.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1403 AGCCTGGAAACCAGGGACCCCAGACATACCGCCAGGGGGTGGGCAAGTACATCCACCCTGCGGCCACGAAACGA 1476
Query 1474 GCAGCAGAGGAAGAGCCCTCAACCAG---TGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGG 1544
.|||||||||||||.||.||.||||| |||||| |||||.|.|||||||.|.||||||||||||.|||||
Sbjct 1477 TCAGCAGAGGAAGAACCATCGACCAGCACTGCCAC---CCCCACGGCCAAGAAAAGGCCCAGTCGGGGCTTTGG 1547
Query 1545 GGACTTCAGCTCCTGG 1560
||||||||||||||||
Sbjct 1548 GGACTTCAGCTCCTGG 1563