Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07930
• Subject: XM_006522443.3
• Aligned Length: 1570
• Identities: 1268
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA  74
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||.
Sbjct    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAGAAGGACAAGATGTATATCACTTGTGCTGAGTACACTCATTTCTATGGTGGCAG  74

Query   75  GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG  148
            ||||||||||.||.||||.||||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct   75  GAAGCCAGATATCTCACAGACAAGTTTTCGCCGCTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTCCAGCCTTTTG  148

Query  149  TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG  222
            ||||||||||||||||.||.||.||..|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TCTACCCAGTCTGCACCCCAGAAGGTGTCGTCTTTGACTTGCTGAACATTGTTCCCTGGCTTAAGAAGTATGGG  222

Query  223  ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG  296
            ||.||.|||||||.|||||||||.||.||.||||.||||.||||||||||||||||..|.||||||||.||.||
Sbjct  223  ACGAATCCCAGCACTGGAGAGAAACTTGATGGGAAGTCCTTGATCAAGCTGAACTTCGCAAAGAACAGCGAAGG  296

Query  297  GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA  370
            |.||||||||||.||||||||||.|.||||||||||..||||||||||.||.|||||..|.|||||.||.||||
Sbjct  297  GCAGTACCACTGTCCAGTGCTGTATTCCGTGTTCACTGACAACACCCATATTGTGGCCATCAGGACAACTGGCA  370

Query  371  ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG  444
            |.||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|||
Sbjct  371  ATGTCTACACCTATGAGGCAGTGGAGCAGCTAAACATCAAGGCCAAGAACTTGCGGGATCTGTTGACTGATGAG  444

Query  445  CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA  518
            |||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||....|||||||.
Sbjct  445  CCCTTTTCCAGGCAAGACATCATCACCCTGCAGGACCCCACCAATTTGGACAAATTCAATGTTAGCAACTTCTT  518

Query  519  TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA  592
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||
Sbjct  519  CCATGTGAAGAATAACATGAGAATAATAGACCCAGATGAGGAAAAGGCCAAACAAGACCCATCTTATTATTTGA  592

Query  593  AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA  666
            ||||.||||||.|.|||||..|||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||
Sbjct  593  AAAACACAAATTCGGAGACGAGAGAGACGCTACAGGAGCTCTACAAAGAGTTCAAAGGAGATGAGATTTTAGCA  666

Query  667  GCCACCATGAAGGCC-CCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCA  739
            ||.|||||| ||||| ||.|||||||||||.||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTACCATG-AGGCCACCTGAGAAGAAGAAGGTGGACCAACTGAATGCGGCCCACTACTCCACAGGGAAGGTCA  739

Query  740  GCGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTG  813
            |.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.|||||.|||
Sbjct  740  GTGCATCCTTCACCTCTACTGCCATGGTGCCCGAGACCACGCATGAAGCAGCTGTCATTGATGAAGATGTACTG  813

Query  814  CGCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCA  887
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct  814  CGCTACCAGTTTGTGAAGAAAAAGGGCTATGTAAGGCTTCACACCAACAAGGGCGACCTTAACTTAGAGCTGCA  887

Query  888  CTGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCT  961
            |||.||||                                                                  
Sbjct  888  CTGTGACC------------------------------------------------------------------  895

Query  962  TCCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATAC  1035
                                    |||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||.|
Sbjct  896  ------------------------TGATCCAGGGCGGTGACCCCACAGGTACAGGCACAGGTGGAGAGTCATTC  945

Query 1036  TGGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAA  1109
            |||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||..|.||||||||||||||
Sbjct  946  TGGGGCAAGCCTTTCAAAGATGAGTTCCGTCCCAACCTTTCACACACGGGCCGTGGGGTGCTCAGCATGGCCAA  1019

Query 1110  CTCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATA  1183
            .||.||||||||||.|||||..|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1020  TTCGGGGCCCAACACCAACAAATCTCAGTTCTTCATCACATTCCGATCCTGCGCTTACCTGGATAAGAAGCATA  1093

Query 1184  CCATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACT  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1094  CCATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACACGCTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCTAAAACT  1167

Query 1258  GACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATG--CCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCC  1329
            |||||.|||||||||||..|.|.|||  |||  |.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1168  GACCGTCCTAAGGAGGAAGTGCTCAT--ATGTACAACCACAGTGTTTGTGGACCCCTATGAGGAGGCTGATGCC  1239

Query 1330  CAGATTGCGCAGGAGCG---GAAGACACAGC-TCAAGATAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCC  1399
            ||||||||.|||||.||   ||||||||||| || ||.|.|..||.|||.||||.||.||||..||.|||||||
Sbjct 1240  CAGATTGCCCAGGAACGGAAGAAGACACAGCATC-AGGTGGATCCAGAGGCCAAGGTCAAGATGAGTCAGCCCC  1312

Query 1400  AGGCAGGGAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACGAAGCGA  1473
            ||.|.||.|.||||||.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1313  AGCCTGGAAACCAGGGACCCCAGACATACCGCCAGGGGGTGGGCAAGTACATCCACCCTGCGGCCACGAAACGA  1386

Query 1474  GCAGCAGAGGAAGAGCCCTCAACCAG---TGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGG  1544
            .|||||||||||||.||.||.|||||   ||||||   |||||.|.|||||||.|.||||||||||||.|||||
Sbjct 1387  TCAGCAGAGGAAGAACCATCGACCAGCACTGCCAC---CCCCACGGCCAAGAAAAGGCCCAGTCGGGGCTTTGG  1457

Query 1545  GGACTTCAGCTCCTGG  1560
            ||||||||||||||||
Sbjct 1458  GGACTTCAGCTCCTGG  1473