Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07930
• Subject: XM_011530042.3
• Aligned Length: 1723
• Identities: 1555
• Gaps: 167

Alignment

Query    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGAAGCGACAGCACCAAAAGGACAAAATGTACATTACCTGTGCTGAATACACTCACTTTTATGGTGGCAA  74

Query   75  GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCCAGATCTCCCACAAACAAATTTTCGTCGTTTACCTTTTGACCACTGCAGTCTCTCTCTGCAGCCCTTTG  148

Query  149  TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTACCCAGTCTGCACTCCCGATGGCATCGTCTTTGACTTACTGAACATTGTTCCATGGCTTAAGAAGTACGGG  222

Query  223  ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCAACCCCAGCAATGGAGAGAAGCTGGACGGGAGGTCCCTGATCAAGCTGAACTTTTCCAAGAACAGTGAGGG  296

Query  297  GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGTACCACTGCCCAGTGCTGTTTACCGTGTTCACCAACAACACCCACATCGTGGCTGTGAGGACGACCGGCA  370

Query  371  ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGTCTACGCCTATGAGGCAGTGGAACAGCTAAATATCAAGGCCAAGAACTTCCGGGACCTGCTGACCGACGAG  444

Query  445  CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCTCCCGGCAGGACATCATCACCCTCCAGGACCCCACCAATTTGGACAAGTTCAATGTCTCTAACTTCTA  518

Query  519  TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCATGTGAAGAATAACATGAAAATAATAGACCCAGATGAAGAGAAGGCCAAACAGGACCCGTCTTATTATCTGA  592

Query  593  AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAATACAAATGCCGAGACCCGAGAGACCCTGCAGGAGCTCTACAAGGAGTTCAAAGGGGACGAGATTCTGGCA  666

Query  667  GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCACCATGAAGGCCCCGGAGAAGAAGAAAGTGGACAAGCTGAACGCTGCCCACTATTCCACAGGGAAGGTCAG  740

Query  741  CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCTTCCTTCACCTCCACCGCGATGGTCCCGGAGACCACACATGAAGCAGCTGCCATCGACGAGGATGTGCTGC  814

Query  815  GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTACCAGTTTGTGAAGAAGAAGGGCTACGTGCGGCTGCACACCAACAAGGGCGACCTCAACCTGGAGCTGCAC  888

Query  889  TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCGACCTGACACCAAAAACCTGCGAAAACTTCATCAGGCTTTGCAAGAAGCATTATTACGATGGCACCATCTT  962

Query  963  CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACAGATCCATCCGGAACTTTGTGATCCAAGGGGGCGACCCCACAGGCACAGGCACGGGTGGGGAGTCATACT  1036

Query 1037  GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGGGAAGCCCTTCAAAGACGAGTTCCGGCCCAACCTCTCGCACACGGGCCGCGGCATCCTCAGCATGGCCAAC  1110

Query 1111  TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCGGGCCCAACAGCAACAGGTCTCAATTCTTCATCACGTTTCGCTCCTGTGCCTACCTGGACAAGAAGCATAC  1184

Query 1185  CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTTTGGACGGGTTGTTGGGGGCTTTGACGTACTGACAGCCATGGAGAATGTGGAGAGTGACCCCAAAACTG  1258

Query 1259  ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCGCCCTAAGGAGGAGATCCGCATTGATGCCACTACAGTGTTCGTGGACCCCTATGAGGAGGCCGATGCCCAG  1332

Query 1333  ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGATAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGCGCAGGAGCGGAAGACACAGCTCAAGGTAGCCCCGGAGACCAAAGTGAAGAGCAGCCAGCCCCAGGCAGG  1406

Query 1407  GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCACGAAGCGAGCAGCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||
Sbjct 1407  GAGCCAGGGCCCCCAGACCTTCCGCCAGGGCGTGGGCAAGTACATCAACCCAGCAGCCAC----CGAGCAGCAG  1476

Query 1481  AGGAAGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  AGGAAGAGCCCTCAACCAGTGCCACTGTCCCCATGTCCAAGAAGAAGCCCAGTCGGGGTTTTGGGGACTTCAGC  1550

Query 1555  TCCTGG--------------------------------------------------------------------  1560
            ||||||                                                                    
Sbjct 1551  TCCTGGTAGCAGCAGCAACTTGCAGGCTGTACCTCTGCCCTTCCTTTTCTCATCAATCACTGATGCTGAAGCTG  1624

Query 1561  --------------------------------------------------------------------------  1560
                                                                                      
Sbjct 1625  CAGGCCTGAGCCCTTTGTCTCCCTGGATGCTGGGTGGCGCCTCATCTGCATCTCTGCCTCACCCCATCCACTGC  1698

Query 1561  ---------------------  1560
                                 
Sbjct 1699  CACAGGCTGCCTGATGACCAC  1719