Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07949
- Subject:
- NM_001162369.1
- Aligned Length:
- 1434
- Identities:
- 1275
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTAC 74
|||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCTTAAATTTTATCAAATGAAATATATTTTTCAAATATTGGATAAAATGAGATGCTTGCGAAAACGGTCTAC 74
Query 75 AGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG 148
|||||||||||||||.||||||||..|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTGTCATTCTTGGGGGTTCTTGTTGTTTTTCTACTATTCATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG 148
Query 149 AAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAG 222
||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAGGCGACAAGCAACTTATAAGGGAAACATCGACACACCAACTTAATTCTGAACGCTATGTTCACACTTTCAAG 222
Query 223 GATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCG 296
||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 GATTTATCAAACTTCTCAGGAACCATAAATGTCACTTATCGCTATCTGGCTGCCACACCTTTACAGAGAAAACG 296
Query 297 GTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTT 370
.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 ATATCTCACAATTGGACTTTCATCAGTGAAACGAAAAAAAGGAAATTATTTACTTGACACAATCAAGTCAATTT 370
Query 371 TTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGG 444
||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 371 TTGAACAGTCCAGCTATGAAGAACTAAAGGAAATTTCAGTCGTAGTACATCTAGCAGACTTCAATTCATCATGG 444
Query 445 CGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA 518
||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGAGATGCCATGGTCCAAGACATTACACAGAAATTTGCCCATCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA 518
Query 519 TGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAAT 592
||||||.||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 519 TGCTCCTGAAGAATATTATCCAGTTCTGGATGGTCTTAAAAGAAATTACAATGACCCAGAAGATAGAGTCAGAT 592
Query 593 TTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATG 666
||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 593 TTCGCTCCAAGCAAAACGTAGATTATGCTTTTCTGCTAAATTTCTGTGCCAATACTTCTGACTATTACGTGATG 666
Query 667 CTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAAC 740
||||||||.||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct 667 CTTGAAGACGATGTTCGGTGTTCCAGAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATAGCATCCTTGGAAGGAAC 740
Query 741 TTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTT 814
.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 741 ATACTGGGTAACTCTTGAGTTCTCTAAACTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCACGATCTCCCACGTC 814
Query 815 TGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTG 888
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct 815 TGGCCCATTTCTTATTAATGTTCTATCAAGAAATGCCCTGCGATTGGCTATTGACTCATTTCCGAGGGCTGCTG 888
Query 889 GCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGAC 962
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 889 GCTCAGAAAAATGTGATTCGATTTAAACCTTCTCTCTTTCAGCACATGGGGTATTATTCATCCTATAAAGGAAC 962
Query 963 GGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGT 1036
.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct 963 AGAGAATAAACTGAAGGATGATGACTTTGAAGAAGAGTCCTTTGACATCCCTGATAACCCCCCAGCGAGTTTCT 1036
Query 1037 ACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGG 1110
||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037 ACACCAACATGAATGTCTTTGAAAACTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTATTTTTGGGGA 1110
Query 1111 AAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAA 1184
||..|||||||||..||||||...||.||.|||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111 AAGTCACCTTCAATGGGAGATACGTTCGTTATTGTATTTGAAAATCCGATTACAATTAAAAAAATTAAAGTGAA 1184
Query 1185 TACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTA 1258
||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||...||
Sbjct 1185 TACTGGAACAGAGGACCGGCAGAATGACATCTTACAACATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAAACTTATTTTTA 1258
Query 1259 GCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGT 1332
|||||||||..|||||||||..||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1259 GCAAACAAATAAGACAATGTGATACTTACTTAAGACTAGGGGAATTCAAAAATGGATACTTTGAAATGTCAGAT 1332
Query 1333 GTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAAT 1406
||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1333 GTGAATCAAAAAATTCCCTTTGACATACATTGCATGAGGATATGTGTTACCAAAACACAGAAAGAATGGCTGAT 1406
Query 1407 TATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1434
.|||||.||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1407 AATTAGAAGCATCAGTATTTGGACTTCC 1434