Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07949
- Subject:
- NM_001351283.2
- Aligned Length:
- 1521
- Identities:
- 1433
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTGGGAAGGACATGGTCAGATTTGTTGTAAGAAAGACTGTGCAGAGGAGTGTGGCAAAGGGATCCAGAAG 74
Query 1 -------------ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGA 61
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATGCAAGAAGAGAATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGA 148
Query 62 GAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGAT 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGAT 222
Query 136 AGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGT 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGT 296
Query 210 TCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTT 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTT 370
Query 284 TACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACA 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACA 444
Query 358 ATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTT 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTT 518
Query 432 TAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGAT 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGAT 592
Query 506 TAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAA 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAA 666
Query 580 GATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGA 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGA 740
Query 654 CTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCAT 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCAT 814
Query 728 CCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCAT 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCAT 888
Query 802 GATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTT 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTT 962
Query 876 CCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCAT 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCAT 1036
Query 950 CATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCC 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCC 1110
Query 1024 CCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGA 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGA 1184
Query 1098 GTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAA 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAA 1258
Query 1172 AAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAA 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAA 1332
Query 1246 AACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTT 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTACTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTT 1406
Query 1320 TGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAA 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAA 1480
Query 1394 AGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1521