Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07949
• Subject: NM_001351291.2
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1433
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTAC  74

Query   75  AGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG  148

Query  149  AAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAG  222

Query  223  GATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCG  296

Query  297  GTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTT  370

Query  371  TTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGG  444

Query  445  CGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA  518

Query  519  TGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAAT  592

Query  593  TTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATG  666

Query  667  CTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAAC  740

Query  741  TTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTT  814

Query  815  TGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTG  888

Query  889  GCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGAC  962

Query  963  GGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGT  1036

Query 1037  ACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGG  1110

Query 1111  AAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAA  1184

Query 1185  TACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTA  1258

Query 1259  GCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAAACAAAGGAGACAATGTTCTACTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGT  1332

Query 1333  GTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAAT  1406

Query 1407  TATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT  1434