Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07957
Subject:
NM_001365642.1
Aligned Length:
1351
Identities:
1075
Gaps:
276

Alignment

Query    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MRGGKCNMLSSLGCLLLCGSITLALGNAQKLPKGKRPNLKVHINTTSDSILLKFLRPSPNVKLEGLLLGYGSNV  74

Query   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  SPNQYFPLPAEGKFTEAIVDAEPKYLIVVRPAPPPSQKKSCSGKTRSRKPLQLVVGTLTPSSVFLSWGFLINPH  148

Query  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  HDWTLPSHCPNDRFYTIRYREKDKEKKWIFQICPATETIVENLKPNTVYEFGVKDNVEGGIWSKIFNHKTVVGS  222

Query  223  KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KKVNGKIQSTYDQDHTVPAYVPRKLIPITIIKQVIQNVTHKDSAKSPEKAPLGGVILVHLIIPGLNETTVKLPA  296

Query  297  SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSET-----------  359
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  297  SLMFEISDALKTQLAKNETLALPAESKTPEVEKISARPTTVTPETVPRSTKPTTSSALDVSETTLVLSKRTPET  370

Query  360  --------------TLASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIP  419
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  LQTILIPQFELPLSTLASSEKPWIVPTAKISEDSKVLQPQTATYDVFSSPTTSDEPEISDSYTATSDRILDSIP  444

Query  420  PKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTIT  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PKTSRTLEQPRATLAPSETPFVPQKLEIFTSPEMQPTTPAPQQTTSIPSTPKRRPRPKPPRTKPERTTSAGTIT  518

Query  494  PKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLKPKIPLSPEVTHTKP-----------------------------------  532
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  519  PKISKSPEPTWTTPAPGKTQFISLKPKIPLSPEVTHTKPAPEPQTLLPSQSTIGPETPGTKPSTTLAPRKTKRP  592

Query  533  --------------------------------------------------------------------------  532
                                                                                      
Sbjct  593  GRRPRPRPRPKTTPSPEVPKSKPALEPATIQPEPLVPTTASKPSERPKTTHRPDAPQIQPGSKPPKQLLPKPQT  666

Query  533  --------------------------------------------------------------------------  532
                                                                                      
Sbjct  667  TAEPDMPPTKSVSEPVPFETEAPSMTIVPTTDIEPVTVRTEATVTTLAPKTSQRTRTRRPRPKHKTTPRPETLQ  740

Query  533  -------------------------------------------APKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQ  563
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TKLDFGPITPGTSSAPTTTTKRTRRPHPKPKTTPHPEVPQTKLAPKQTPRAPPKPKTSPRPRIPQTQPVPKVPQ  814

Query  564  RVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQ  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  RVTAKPKTSPSPEVSYTTPAPKDVLLPHKPYPEVSQSEPAPLETRGIPFIPMISPSPSQEELQTTLEETDQSTQ  888

Query  638  EPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRPRTSDKPHIRP-------------------------GVKQAPRPSG  686
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         ||||||||||
Sbjct  889  EPFTTKIPRTTELAKTTQAPHRFYTTVRPRTSDKPHIRPVLNRTTTRPTRPKPSGMPSGNGVGTGVKQAPRPSG  962

Query  687  ADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERI  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ADRNVSVDSTHPTKKPGTRRPPLPPRPTHPRRKPLPPNNVTGKPGSAGIISSGPITTPPLRSTPRPTGTPLERI  1036

Query  761  ETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNAT  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ETDIKQPTVPASGEELENITDFSSSPTRETDPLGKPRFKGPHVRYIQKPDNSPCSITDSVKRFPKEEATEGNAT  1110

Query  835  SPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYE  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  SPPQNPPTNLTVVTVEGCPSFVILDWEKPLNDTVTEYEVISRENGSFSGKNKSIQMTNQTFSTVENLKPNTSYE  1184

Query  909  FQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLC  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  FQVKPKNPLGEGPVSNTVAFSTESADPRVSEPVSAGRDAIWTERPFNSDSYSECKGKQYVKRTWYKKFVGVQLC  1258

Query  983  NSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGH  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  NSLRYKIYLSDSLTGKFYNIGDQRGHGEDHCQFVDSFLDGRTGQQLTSDQLPIKEGYFRAVRQEPVQFGEIGGH  1332

Query 1057  TQINYVQWYECGTTIPGKW  1075
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TQINYVQWYECGTTIPGKW  1351